MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017046	T	6	6	2013269	2013274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_017046	GCA	2	6	2013277	2013282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_017046	A	6	6	2013327	2013332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017046	AAT	2	6	2013370	2013375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_017046	GAGT	2	8	2013409	2013416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_017046	A	6	6	2013432	2013437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_017046	CAACC	2	10	2013490	2013499	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6508	NC_017046	CG	3	6	2013528	2013533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_017046	AGG	2	6	2018215	2018220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_017046	CGA	2	6	2018222	2018227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_017046	GGACA	2	10	2019934	2019943	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6512	NC_017046	A	6	6	2024117	2024122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017046	AT	3	6	2024134	2024139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_017046	TCAC	2	8	2024165	2024172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6515	NC_017046	ACTTT	2	10	2024187	2024196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6516	NC_017046	GAT	2	6	2024199	2024204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017046	TGAG	2	8	2024340	2024347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_017046	TCC	2	6	2025218	2025223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_017046	A	7	7	2025578	2025584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017046	AAG	2	6	2025622	2025627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_017046	T	7	7	2025683	2025689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_017046	T	6	6	2025706	2025711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017046	ATGA	2	8	2025714	2025721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_017046	TGC	2	6	2025766	2025771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_017046	CTT	2	6	2025808	2025813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_017046	CCG	2	6	2025849	2025854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_017046	A	6	6	2025873	2025878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_017046	TCA	2	6	2028442	2028447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6530	NC_017046	CGA	2	6	2028497	2028502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_017046	CAT	2	6	2028632	2028637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_017046	ATC	2	6	2028679	2028684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_017046	CCT	2	6	2028740	2028745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_017046	TCT	2	6	2029742	2029747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_017046	CGG	2	6	2029787	2029792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_017046	ATA	2	6	2029844	2029849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_017046	AAT	2	6	2032706	2032711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_017046	CT	3	6	2033463	2033468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_017046	TTA	2	6	2033485	2033490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_017046	CCA	2	6	2033529	2033534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_017046	TCC	2	6	2033832	2033837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_017046	ATTA	2	8	2033884	2033891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017046	ATTC	2	8	2033953	2033960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6544	NC_017046	CTG	2	6	2034005	2034010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_017046	AAC	2	6	2034067	2034072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_017046	TTTTA	2	10	2034097	2034106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017046	TTA	2	6	2034134	2034139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017046	ATTT	2	8	2034150	2034157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_017046	T	8	8	2034191	2034198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_017046	T	6	6	2034202	2034207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_017046	A	6	6	2034233	2034238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017046	CAA	2	6	2034255	2034260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_017046	ATCAA	2	10	2034263	2034272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6554	NC_017046	A	6	6	2034271	2034276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_017046	A	6	6	2034291	2034296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_017046	AT	4	8	2034310	2034317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_017046	TA	3	6	2034329	2034334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_017046	TAT	2	6	2034340	2034345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_017046	A	6	6	2034346	2034351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_017046	T	6	6	2034400	2034405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_017046	TTG	2	6	2034446	2034451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_017046	ATT	2	6	2034474	2034479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017046	TTA	2	6	2035736	2035741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_017046	ACA	2	6	2035811	2035816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_017046	T	6	6	2035821	2035826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_017046	GGAAA	2	10	2035861	2035870	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_017046	GAT	2	6	2035882	2035887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_017046	GAT	2	6	2035905	2035910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_017046	ATC	2	6	2035912	2035917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6571	NC_017046	ATT	2	6	2035954	2035959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_017046	A	6	6	2036035	2036040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_017046	TTA	2	6	2036133	2036138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_017046	GAA	2	6	2036409	2036414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_017046	AG	3	6	2036422	2036427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_017046	A	7	7	2036428	2036434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6579	NC_017046	A	7	7	2036561	2036567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_017046	T	6	6	2036577	2036582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_017046	GAT	2	6	2036783	2036788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6584	NC_017046	AAT	2	6	2038473	2038478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_017046	TA	3	6	2038536	2038541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_017046	TCG	2	6	2038601	2038606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_017046	TC	4	8	2038622	2038629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6593	NC_017046	AGA	2	6	2039076	2039081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_017046	GA	3	6	2039107	2039112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_017046	TAA	2	6	2039195	2039200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6597	NC_017046	T	6	6	2039287	2039292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_017046	TGG	2	6	2039357	2039362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_017046	T	6	6	2039451	2039456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_017046	CAT	2	6	2039516	2039521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_017046	AAT	2	6	2039523	2039528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_017046	CTG	2	6	2039535	2039540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6605	NC_017046	CAATA	2	10	2039635	2039644	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6606	NC_017046	AAG	2	6	2039659	2039664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6609	NC_017046	TCGA	2	8	2040945	2040952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6610	NC_017046	CG	3	6	2040967	2040972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6611	NC_017046	GTG	2	6	2041004	2041009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_017046	AAAAG	2	10	2041121	2041130	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_017046	TAA	2	6	2041136	2041141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_017046	CG	5	10	2044388	2044397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_017046	CTC	2	6	2044410	2044415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_017046	CTCCAG	2	12	2050280	2050291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6622	NC_017046	CCA	2	6	2054672	2054677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_017046	CCG	2	6	2057781	2057786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_017046	CTG	2	6	2057792	2057797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6626	NC_017046	CAA	3	9	2057854	2057862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_017046	CCG	2	6	2057866	2057871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6628	NC_017046	CCA	2	6	2057923	2057928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6629	NC_017046	GGGC	2	8	2060241	2060248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6630	NC_017046	ATT	2	6	2060308	2060313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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