MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 15617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017046	TAA	2	6	1615743	1615748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017046	CAT	2	6	1615787	1615792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017046	CGCGC	2	10	1615803	1615812	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5004	NC_017046	T	6	6	1615821	1615826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017046	A	7	7	1615851	1615857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017046	T	6	6	1615898	1615903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017046	TTC	2	6	1615910	1615915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017046	AGA	2	6	1616039	1616044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017046	CGT	2	6	1624125	1624130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017046	ATG	2	6	1624151	1624156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017046	TTC	2	6	1624158	1624163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017046	A	6	6	1625105	1625110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017046	CATTAA	2	12	1625967	1625978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5014	NC_017046	CA	3	6	1625992	1625997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_017046	A	7	7	1626062	1626068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017046	CGC	2	6	1626153	1626158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_017046	GCG	2	6	1626166	1626171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017046	CTC	2	6	1626916	1626921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017046	TC	3	6	1626920	1626925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_017046	TCAA	2	8	1626940	1626947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_017046	TGC	2	6	1627015	1627020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017046	GGT	2	6	1627034	1627039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017046	ATTA	2	8	1627093	1627100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017046	CAC	2	6	1627165	1627170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_017046	CA	3	6	1627178	1627183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_017046	CCG	2	6	1627255	1627260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_017046	TTCCCC	2	12	1628881	1628892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_017046	GCC	2	6	1628927	1628932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_017046	ATAA	2	8	1629160	1629167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017046	ATC	2	6	1629236	1629241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017046	CGG	2	6	1629249	1629254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017046	GAC	2	6	1630383	1630388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017046	GCT	2	6	1630412	1630417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017046	ACT	2	6	1630422	1630427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017046	TTA	2	6	1630455	1630460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017046	AAT	3	9	1630470	1630478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017046	ATT	2	6	1630480	1630485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017046	CTTAA	2	10	1630548	1630557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_017046	TCCT	2	8	1633501	1633508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_017046	AAC	2	6	1633523	1633528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017046	GAA	2	6	1633545	1633550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017046	A	6	6	1633569	1633574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017046	AAAT	2	8	1633597	1633604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017046	ACA	2	6	1633643	1633648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017046	ATG	2	6	1633758	1633763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017046	GCC	2	6	1633817	1633822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_017046	T	6	6	1633824	1633829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017046	AAT	2	6	1634901	1634906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017046	GCC	2	6	1635028	1635033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_017046	TAT	2	6	1636324	1636329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017046	CGC	3	9	1636359	1636367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_017046	CCG	2	6	1636443	1636448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_017046	TTGC	2	8	1636450	1636457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_017046	GAA	2	6	1636484	1636489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017046	AAC	2	6	1636501	1636506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017046	TC	3	6	1636516	1636521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017046	A	6	6	1643197	1643202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017046	CG	3	6	1643203	1643208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_017046	TAT	2	6	1643307	1643312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017046	ATG	2	6	1643351	1643356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017046	AATG	2	8	1643369	1643376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017046	CGT	2	6	1643390	1643395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017046	TGC	3	9	1643411	1643419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017046	TGC	2	6	1643487	1643492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017046	T	6	6	1643536	1643541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017046	GCC	2	6	1645037	1645042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5069	NC_017046	GTT	2	6	1646606	1646611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_017046	AAT	2	6	1647640	1647645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_017046	CTG	2	6	1647933	1647938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017046	ATT	2	6	1647948	1647953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017046	GCG	2	6	1647974	1647979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017046	GAA	2	6	1647992	1647997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_017046	A	7	7	1648249	1648255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017046	AAT	2	6	1648289	1648294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5090	NC_017046	TTG	2	6	1648544	1648549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_017046	ATA	2	6	1648629	1648634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017046	TAAT	2	8	1648642	1648649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_017046	ATA	2	6	1648853	1648858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017046	ACC	2	6	1648867	1648872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_017046	AT	3	6	1649937	1649942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017046	AAT	2	6	1649953	1649958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017046	AGTATA	2	12	1650009	1650020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_017046	ATT	2	6	1650097	1650102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017046	CAT	2	6	1650105	1650110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5108	NC_017046	C	6	6	1652955	1652960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5109	NC_017046	TGAC	2	8	1653010	1653017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_017046	TGG	2	6	1654221	1654226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017046	ATG	2	6	1654967	1654972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017046	ATA	2	6	1654981	1654986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017046	A	7	7	1655055	1655061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017046	GTT	2	6	1656744	1656749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017046	CTT	2	6	1658327	1658332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017046	GTT	2	6	1658334	1658339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017046	ATT	2	6	1658416	1658421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017046	T	6	6	1658420	1658425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017046	CAC	2	6	1658518	1658523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017046	AG	3	6	1662106	1662111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017046	AGGA	2	8	1666433	1666440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017046	CAG	2	6	1666483	1666488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017046	TAA	2	6	1668197	1668202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017046	T	6	6	1668264	1668269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017046	CAG	2	6	1668270	1668275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017046	TAA	2	6	1668321	1668326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017046	TTG	2	6	1668332	1668337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017046	ACCG	2	8	1668385	1668392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_017046	GCA	2	6	1668412	1668417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_017046	CCTT	2	8	1669951	1669958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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