MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132

Total Repeats: 12078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016941	ATT	2	6	126	131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016941	AAT	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016941	TAT	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016941	AGA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016941	TG	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016941	GTC	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016941	ATTT	2	8	345	352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016941	TTA	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016941	ATT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016941	GT	3	6	446	451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016941	AAGA	2	8	499	506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016941	AGA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016941	TA	3	6	1910	1915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016941	AAT	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016941	TAA	2	6	1951	1956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016941	ATG	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016941	AC	3	6	2010	2015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016941	CTA	3	9	2091	2099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016941	TA	3	6	2119	2124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016941	TTAA	2	8	3321	3328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016941	T	6	6	3344	3349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016941	AAT	2	6	3356	3361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016941	TAAAA	2	10	3376	3385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016941	TAAA	2	8	3405	3412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016941	TGAA	2	8	3418	3425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016941	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016941	AAATTA	2	12	3547	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016941	AAT	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016941	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016941	CT	3	6	3611	3616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016941	A	7	7	3636	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016941	AT	3	6	3649	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016941	ATT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016941	TGAAC	2	10	6982	6991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016941	AGG	2	6	6998	7003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016941	A	6	6	9685	9690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016941	CTATA	2	10	9742	9751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016941	AT	3	6	10617	10622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016941	AT	3	6	10635	10640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016941	TAT	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016941	ATT	3	9	10680	10688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016941	ATT	2	6	10746	10751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016941	CAA	2	6	10763	10768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016941	TAT	3	9	10769	10777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016941	ATA	2	6	10805	10810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016941	AATA	2	8	10841	10848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016941	AAG	2	6	10865	10870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016941	AAGT	2	8	12431	12438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016941	TAA	2	6	12491	12496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016941	AG	3	6	12538	12543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016941	TA	3	6	12573	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016941	CTAC	2	8	12584	12591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016941	TAA	2	6	12612	12617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016941	T	7	7	12723	12729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016941	AAAAT	2	10	12737	12746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016941	AAT	2	6	12758	12763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016941	T	6	6	12773	12778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016941	TAA	2	6	14095	14100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016941	GTG	2	6	14104	14109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016941	CAC	2	6	14120	14125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016941	T	6	6	14126	14131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016941	ATC	2	6	14226	14231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016941	ATG	2	6	14270	14275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016941	TAC	2	6	14287	14292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016941	TTA	2	6	14316	14321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016941	AGG	2	6	14339	14344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016941	GAG	2	6	14353	14358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016941	A	6	6	14389	14394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016941	ATT	2	6	14418	14423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016941	TA	3	6	14452	14457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016941	AAATA	2	10	14498	14507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016941	ACA	2	6	14510	14515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016941	TAT	2	6	14606	14611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016941	AGG	2	6	14644	14649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016941	TA	3	6	15984	15989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016941	CTT	2	6	15992	15997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016941	AAG	2	6	16013	16018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016941	T	7	7	16019	16025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016941	AGG	2	6	16031	16036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016941	AAT	2	6	17068	17073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016941	TAAA	2	8	17076	17083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016941	ATAA	2	8	17088	17095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016941	ATA	2	6	17169	17174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016941	ACA	2	6	17210	17215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016941	ATA	2	6	17219	17224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016941	AAT	2	6	22121	22126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016941	AT	3	6	22176	22181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016941	TTA	2	6	22228	22233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016941	TTA	2	6	22261	22266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016941	TA	3	6	23671	23676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016941	TAT	2	6	23735	23740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016941	ATT	2	6	23775	23780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016941	AT	3	6	23805	23810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016941	TAAA	2	8	23914	23921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016941	AG	3	6	23949	23954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016941	TAA	2	6	23964	23969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016941	ATA	2	6	24019	24024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016941	A	6	6	24037	24042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016941	ATCT	2	8	24075	24082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016941	CGG	2	6	24133	24138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016941	GCCT	2	8	24203	24210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016941	T	7	7	24279	24285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016941	TTTA	2	8	24356	24363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016941	A	6	6	24414	24419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016941	TAC	2	6	24459	24464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016941	ATA	2	6	24504	24509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016941	TATT	2	8	24511	24518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016941	TAA	2	6	24564	24569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016941	ATT	3	9	24610	24618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016941	TAA	2	6	24638	24643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016941	A	6	6	24642	24647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016941	AT	3	6	24653	24658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016941	TA	3	6	24704	24709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016941	T	6	6	24778	24783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016941	A	6	6	24808	24813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016941	ATA	2	6	29522	29527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016941	ATA	2	6	29546	29551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016941	GCTA	2	8	29565	29572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016941	TTA	2	6	29635	29640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016941	AGT	2	6	29641	29646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016941	TAC	2	6	29662	29667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016941	TAA	2	6	29711	29716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016941	CATT	2	8	29723	29730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016941	ATA	2	6	29785	29790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016941	AG	3	6	29875	29880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016941	T	6	6	30759	30764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016941	TGG	2	6	30772	30777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016941	TGT	2	6	30786	30791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016941	A	6	6	30819	30824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016941	AAT	2	6	30851	30856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016941	ATCA	2	8	30866	30873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016941	ATA	2	6	30893	30898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016941	AT	3	6	33246	33251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016941	TAC	2	6	33261	33266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016941	T	8	8	33297	33304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016941	A	6	6	33309	33314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016941	TAA	2	6	33358	33363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016941	A	6	6	33519	33524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016941	TAA	2	6	33533	33538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016941	TAA	2	6	33560	33565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016941	GGA	2	6	33598	33603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016941	T	6	6	34098	34103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016941	AAG	2	6	34175	34180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016941	TTTCA	2	10	34234	34243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016941	ATA	2	6	34249	34254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016941	TTCT	2	8	34313	34320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016941	ATAA	2	8	34351	34358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016941	GAA	2	6	34368	34373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016941	ATA	2	6	34382	34387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016941	AGG	2	6	34399	34404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_016941	TAA	2	6	35705	35710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016941	TAAA	2	8	35728	35735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_016941	T	6	6	35816	35821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016941	AGATA	2	10	35845	35854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016941	TAA	2	6	35860	35865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_016941	ATT	2	6	35900	35905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016941	TAA	2	6	35932	35937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_016941	ATG	2	6	36039	36044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_016941	TTA	2	6	37150	37155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_016941	T	7	7	37560	37566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016941	AAGA	2	8	39155	39162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016941	GA	3	6	39161	39166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016941	TA	3	6	41665	41670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_016941	GTA	2	6	41698	41703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_016941	TCT	2	6	58213	58218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_016941	CAT	2	6	58250	58255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_016941	A	6	6	58291	58296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_016941	ATA	2	6	82460	82465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_016941	TGA	2	6	85846	85851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_016941	AAT	2	6	86675	86680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_016941	ATAA	2	8	99195	99202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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