MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 15577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016940	AAC	2	6	4327118	4327123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15502	NC_016940	A	7	7	4327133	4327139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_016940	AGTTA	2	10	4330704	4330713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_016940	T	6	6	4331184	4331189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_016940	GT	3	6	4331221	4331226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_016940	T	8	8	4331266	4331273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_016940	T	6	6	4331277	4331282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_016940	TA	3	6	4331301	4331306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_016940	CAA	2	6	4331344	4331349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_016940	A	6	6	4331365	4331370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_016940	AATTT	2	10	4332083	4332092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_016940	TAT	2	6	4332103	4332108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_016940	CT	3	6	4332153	4332158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15514	NC_016940	A	6	6	4333192	4333197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_016940	GTT	3	9	4333248	4333256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_016940	AAG	2	6	4333290	4333295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_016940	TAT	2	6	4334159	4334164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_016940	T	6	6	4334177	4334182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_016940	T	6	6	4335034	4335039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_016940	T	7	7	4335687	4335693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_016940	TAC	2	6	4335695	4335700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_016940	AAAT	2	8	4335703	4335710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_016940	GGC	2	6	4335715	4335720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_016940	ATT	2	6	4336637	4336642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_016940	A	6	6	4336654	4336659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_016940	GGC	2	6	4336667	4336672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_016940	TAC	2	6	4337178	4337183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_016940	ATC	2	6	4337192	4337197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_016940	GCT	2	6	4337212	4337217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_016940	ATT	2	6	4337236	4337241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_016940	T	6	6	4337274	4337279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_016940	GCC	2	6	4337288	4337293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15533	NC_016940	CGG	2	6	4337296	4337301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_016940	GCT	2	6	4337326	4337331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_016940	GGAT	2	8	4337416	4337423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_016940	AT	4	8	4337422	4337429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_016940	CAA	2	6	4337451	4337456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_016940	AAG	2	6	4337457	4337462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_016940	A	6	6	4337553	4337558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_016940	AG	3	6	4337574	4337579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_016940	T	7	7	4338148	4338154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_016940	AAT	2	6	4338191	4338196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_016940	T	7	7	4338521	4338527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_016940	ATAA	2	8	4338543	4338550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_016940	AGT	2	6	4338562	4338567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_016940	A	9	9	4338601	4338609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_016940	TA	3	6	4338615	4338620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_016940	TTC	2	6	4338630	4338635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_016940	TTC	2	6	4339730	4339735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_016940	TTTTA	2	10	4340664	4340673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_016940	T	6	6	4340683	4340688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_016940	GCC	2	6	4340696	4340701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15553	NC_016940	CGG	2	6	4340704	4340709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_016940	GCT	2	6	4340734	4340739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_016940	TCGCT	2	10	4340807	4340816	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15556	NC_016940	GCG	2	6	4340822	4340827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_016940	CGC	2	6	4340832	4340837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15558	NC_016940	CAG	2	6	4340865	4340870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_016940	CAG	2	6	4340883	4340888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_016940	CTC	2	6	4340895	4340900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_016940	CAA	2	6	4340903	4340908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_016940	AT	3	6	4340948	4340953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_016940	CAAA	2	8	4340962	4340969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15564	NC_016940	GCG	2	6	4340990	4340995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_016940	CAA	2	6	4341011	4341016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_016940	T	6	6	4343110	4343115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_016940	AGC	2	6	4343123	4343128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15568	NC_016940	ATT	2	6	4343151	4343156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_016940	CTT	2	6	4343160	4343165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_016940	A	6	6	4343174	4343179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_016940	T	6	6	4343188	4343193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_016940	CGG	2	6	4345079	4345084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_016940	T	7	7	4345125	4345131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_016940	A	6	6	4345142	4345147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_016940	CGC	2	6	4345171	4345176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15576	NC_016940	TCGCT	2	10	4345190	4345199	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15577	NC_016940	AACAA	2	10	4345210	4345219	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.