MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 12464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016928	CAT	2	6	2342484	2342489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_016928	TA	3	6	2342511	2342516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_016928	TAT	2	6	2342532	2342537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_016928	TTC	2	6	2342601	2342606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_016928	GTT	2	6	2342654	2342659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_016928	AC	3	6	2342764	2342769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_016928	TTGA	2	8	2342817	2342824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_016928	TGT	2	6	2342844	2342849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_016928	TTA	2	6	2343784	2343789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_016928	TCT	2	6	2343840	2343845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_016928	CTT	2	6	2344999	2345004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_016928	TGT	2	6	2345018	2345023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_016928	GAT	2	6	2345033	2345038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_016928	CAA	2	6	2345067	2345072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_016928	TAA	2	6	2345115	2345120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_016928	TA	3	6	2345169	2345174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_016928	A	6	6	2345174	2345179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_016928	ATT	2	6	2345259	2345264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_016928	ATT	2	6	2348220	2348225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_016928	CAA	2	6	2348262	2348267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_016928	ATAA	2	8	2348270	2348277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_016928	TAAA	2	8	2348303	2348310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_016928	TTA	2	6	2349335	2349340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_016928	TTA	2	6	2349395	2349400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_016928	TTA	2	6	2349515	2349520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_016928	TTA	2	6	2349575	2349580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_016928	TTA	2	6	2349695	2349700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_016928	ATC	2	6	2349724	2349729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_016928	TTA	2	6	2349755	2349760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_016928	TCAA	2	8	2349780	2349787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10531	NC_016928	TTA	2	6	2349815	2349820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_016928	CAA	2	6	2349908	2349913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_016928	ATAA	2	8	2349916	2349923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_016928	TCT	2	6	2349950	2349955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_016928	ATT	2	6	2349963	2349968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_016928	AT	3	6	2349975	2349980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_016928	TGCAA	2	10	2350025	2350034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10538	NC_016928	TTAT	2	8	2351011	2351018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_016928	TTA	2	6	2351024	2351029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_016928	AATTC	2	10	2351061	2351070	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10541	NC_016928	TAA	2	6	2351131	2351136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_016928	TAA	2	6	2351159	2351164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_016928	TC	3	6	2351214	2351219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10544	NC_016928	AAG	2	6	2352569	2352574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_016928	ATG	2	6	2352575	2352580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_016928	ATTCA	2	10	2353323	2353332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10547	NC_016928	T	7	7	2353378	2353384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_016928	ATCA	2	8	2353391	2353398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10549	NC_016928	TTAAC	2	10	2353439	2353448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10550	NC_016928	CAAAA	2	10	2354151	2354160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10551	NC_016928	ACT	2	6	2354204	2354209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_016928	TA	3	6	2354235	2354240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_016928	TA	3	6	2354334	2354339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_016928	CCA	2	6	2355532	2355537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10555	NC_016928	CA	3	6	2355741	2355746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10556	NC_016928	AAT	2	6	2355756	2355761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_016928	CAT	2	6	2355774	2355779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_016928	TCT	2	6	2355791	2355796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_016928	T	6	6	2355848	2355853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_016928	ATT	2	6	2355858	2355863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_016928	A	7	7	2355878	2355884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10563	NC_016928	TG	3	6	2355924	2355929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_016928	TCA	2	6	2355936	2355941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_016928	CCT	2	6	2358076	2358081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10567	NC_016928	TGAAAT	2	12	2358166	2358177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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10569	NC_016928	TTG	2	6	2358250	2358255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_016928	A	7	7	2358258	2358264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_016928	CAT	2	6	2358273	2358278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_016928	ATATTT	2	12	2358970	2358981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_016928	ATT	3	9	2358985	2358993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_016928	TCG	2	6	2359039	2359044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_016928	TA	3	6	2359230	2359235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_016928	TTTA	2	8	2359308	2359315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_016928	GAG	2	6	2359334	2359339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10581	NC_016928	TCAA	2	8	2360008	2360015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10584	NC_016928	ATT	2	6	2360125	2360130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_016928	ATT	2	6	2360135	2360140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_016928	ATT	2	6	2360159	2360164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_016928	ATT	2	6	2360168	2360173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_016928	TTG	2	6	2360196	2360201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10590	NC_016928	ATAA	2	8	2361510	2361517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_016928	AGG	2	6	2361521	2361526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_016928	CCT	2	6	2361533	2361538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10594	NC_016928	TAT	2	6	2363602	2363607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_016928	ATTT	2	8	2363640	2363647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_016928	TA	3	6	2364587	2364592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_016928	AAAAC	2	10	2364611	2364620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10598	NC_016928	ATC	2	6	2364644	2364649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_016928	ACCT	2	8	2365613	2365620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10600	NC_016928	TA	3	6	2365622	2365627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_016928	A	7	7	2365670	2365676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_016928	TA	3	6	2365678	2365683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_016928	AGA	2	6	2365688	2365693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_016928	TCA	2	6	2365744	2365749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_016928	AAAGA	2	10	2365781	2365790	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_016928	TA	3	6	2366455	2366460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_016928	TAA	2	6	2366532	2366537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_016928	CTA	2	6	2366539	2366544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_016928	CAA	2	6	2366590	2366595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10610	NC_016928	A	7	7	2366598	2366604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_016928	AT	3	6	2366617	2366622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_016928	AATT	3	12	2366682	2366693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_016928	TCC	2	6	2369302	2369307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10614	NC_016928	TTTA	2	8	2369328	2369335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_016928	A	7	7	2369355	2369361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_016928	CAA	2	6	2369365	2369370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10619	NC_016928	ATA	2	6	2370033	2370038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_016928	A	6	6	2370093	2370098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_016928	CAG	2	6	2370099	2370104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_016928	CTG	2	6	2370135	2370140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_016928	TAC	2	6	2370247	2370252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_016928	A	6	6	2370286	2370291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_016928	TAA	2	6	2370312	2370317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_016928	ACTAA	2	10	2370323	2370332	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10627	NC_016928	ATTTTT	2	12	2372016	2372027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_016928	TGTTT	2	10	2372060	2372069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_016928	TCAAT	2	10	2372078	2372087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10630	NC_016928	ATA	2	6	2372088	2372093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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