MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 12464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016928	CATT	2	8	2236356	2236363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_016928	ATT	2	6	2236398	2236403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_016928	ATA	2	6	2236423	2236428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_016928	AT	3	6	2236434	2236439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_016928	TAA	2	6	2236477	2236482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_016928	ATT	2	6	2236536	2236541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_016928	TAT	2	6	2236552	2236557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_016928	CCT	2	6	2237417	2237422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_016928	GTC	2	6	2237921	2237926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_016928	TA	3	6	2237943	2237948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_016928	CTT	2	6	2237969	2237974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_016928	TTA	2	6	2237978	2237983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_016928	AAATTT	2	12	2237987	2237998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016928	T	6	6	2238004	2238009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016928	T	6	6	2238102	2238107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_016928	ATT	2	6	2238111	2238116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016928	GTG	2	6	2238134	2238139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_016928	ATT	2	6	2238246	2238251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_016928	ATA	2	6	2238257	2238262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016928	ATT	2	6	2240788	2240793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_016928	ATT	2	6	2240839	2240844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_016928	TTG	2	6	2241806	2241811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_016928	AGG	2	6	2241862	2241867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_016928	TAT	2	6	2242539	2242544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_016928	A	7	7	2242611	2242617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_016928	TA	3	6	2242652	2242657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_016928	ATT	2	6	2242739	2242744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_016928	TAA	2	6	2242793	2242798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_016928	ATGG	2	8	2242818	2242825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_016928	ACTT	2	8	2242881	2242888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_016928	AGTAA	2	10	2242932	2242941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_016928	A	6	6	2242940	2242945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_016928	GTG	2	6	2242963	2242968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_016928	ACA	2	6	2242971	2242976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_016928	A	6	6	2242978	2242983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_016928	TAA	2	6	2242985	2242990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_016928	ACTT	2	8	2243012	2243019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10038	NC_016928	ATG	2	6	2243023	2243028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_016928	TAA	2	6	2243030	2243035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_016928	A	6	6	2243034	2243039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_016928	GAC	2	6	2243061	2243066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_016928	CAAA	2	8	2243096	2243103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_016928	ATA	2	6	2243120	2243125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_016928	TGAAAA	2	12	2243129	2243140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016928	TAT	2	6	2243214	2243219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_016928	TAGAT	2	10	2243239	2243248	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_016928	TAACA	2	10	2243300	2243309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10048	NC_016928	TAAA	2	8	2243333	2243340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_016928	ATTT	2	8	2243369	2243376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_016928	AAC	2	6	2243423	2243428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_016928	CAT	2	6	2243492	2243497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_016928	CTC	2	6	2244230	2244235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_016928	ATGTG	2	10	2245940	2245949	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016928	AT	3	6	2246026	2246031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_016928	TA	3	6	2246071	2246076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_016928	GT	3	6	2246181	2246186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016928	A	7	7	2246300	2246306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_016928	ATG	2	6	2246574	2246579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016928	ATT	2	6	2246644	2246649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_016928	GTCC	2	8	2246650	2246657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_016928	TAA	2	6	2246679	2246684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016928	AAT	2	6	2246732	2246737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_016928	TATTC	2	10	2246751	2246760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10064	NC_016928	AATA	2	8	2246768	2246775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016928	TAC	2	6	2246793	2246798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_016928	A	7	7	2246827	2246833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_016928	TA	3	6	2246862	2246867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_016928	ACG	2	6	2246903	2246908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_016928	GCT	2	6	2246910	2246915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10071	NC_016928	TAAA	2	8	2247037	2247044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_016928	CTG	2	6	2247045	2247050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_016928	GGT	2	6	2247054	2247059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_016928	AT	3	6	2247123	2247128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_016928	ATG	2	6	2247180	2247185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_016928	TATT	2	8	2247186	2247193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_016928	TAAA	2	8	2247200	2247207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_016928	T	6	6	2247290	2247295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_016928	TAG	2	6	2247381	2247386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10081	NC_016928	TTA	2	6	2247410	2247415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_016928	AAT	2	6	2247416	2247421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_016928	ACT	2	6	2247422	2247427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_016928	T	6	6	2247489	2247494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_016928	TC	3	6	2247525	2247530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10086	NC_016928	T	6	6	2247578	2247583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_016928	T	6	6	2247667	2247672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_016928	TAT	2	6	2249181	2249186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_016928	A	6	6	2249376	2249381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_016928	AAT	2	6	2249392	2249397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_016928	TGT	2	6	2249406	2249411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_016928	TTC	2	6	2249418	2249423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_016928	TCC	2	6	2249895	2249900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_016928	TCC	2	6	2250353	2250358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_016928	A	6	6	2250360	2250365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_016928	GAT	2	6	2250409	2250414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_016928	TGT	2	6	2250463	2250468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_016928	TA	3	6	2250480	2250485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_016928	TAA	2	6	2250544	2250549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_016928	TC	4	8	2253858	2253865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_016928	TATC	2	8	2253880	2253887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10103	NC_016928	TA	3	6	2253938	2253943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_016928	GTT	2	6	2253982	2253987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016928	AAC	2	6	2253989	2253994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_016928	CT	3	6	2254016	2254021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_016928	TAA	2	6	2254041	2254046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_016928	ATA	2	6	2254087	2254092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_016928	TTCA	2	8	2254100	2254107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_016928	A	6	6	2254160	2254165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_016928	A	6	6	2254228	2254233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_016928	GC	3	6	2254234	2254239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_016928	CAT	2	6	2254244	2254249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_016928	TTG	2	6	2254254	2254259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_016928	TTTA	2	8	2254277	2254284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_016928	TA	3	6	2254353	2254358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_016928	AGT	2	6	2254361	2254366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_016928	TA	3	6	2254376	2254381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_016928	CCT	2	6	2254763	2254768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_016928	TCC	2	6	2255724	2255729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_016928	TA	3	6	2255731	2255736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_016928	CAT	2	6	2255782	2255787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_016928	CCT	2	6	2256191	2256196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_016928	CT	3	6	2256582	2256587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_016928	TAT	2	6	2256721	2256726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_016928	AATT	2	8	2257062	2257069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_016928	ATCT	2	8	2257089	2257096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10128	NC_016928	CCT	2	6	2257802	2257807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_016928	CCT	2	6	2259552	2259557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10130	NC_016928	CCT	2	6	2260267	2260272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10132	NC_016928	CCT	2	6	2261214	2261219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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