MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 11972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016912	ATCA	2	8	892668	892675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_016912	TTC	2	6	892676	892681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016912	A	7	7	892695	892701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016912	AT	3	6	892707	892712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016912	TA	4	8	892724	892731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016912	AGG	2	6	892795	892800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016912	T	6	6	898595	898600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016912	ATAA	2	8	898625	898632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016912	TAA	2	6	898657	898662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016912	T	6	6	898663	898668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016912	A	6	6	898688	898693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016912	AGG	2	6	898707	898712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016912	CGA	2	6	900447	900452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016912	G	6	6	900475	900480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016912	ATA	2	6	904304	904309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016912	TAA	2	6	905363	905368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016912	TAC	2	6	905427	905432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016912	TAA	2	6	905445	905450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016912	T	6	6	905453	905458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016912	TTTAAT	2	12	905499	905510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016912	TAA	2	6	905523	905528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016912	A	7	7	905552	905558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016912	T	6	6	905561	905566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016912	ATTC	2	8	905602	905609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_016912	T	6	6	906093	906098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016912	AAT	2	6	906113	906118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016912	ATTAA	2	10	906209	906218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016912	TTA	2	6	906280	906285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016912	AGAA	2	8	906307	906314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016912	CAAA	2	8	906317	906324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_016912	TTTG	2	8	906335	906342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016912	GAT	2	6	906389	906394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016912	ATTA	2	8	907119	907126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016912	T	7	7	907163	907169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016912	TAG	2	6	907196	907201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016912	AGG	2	6	908253	908258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016912	TAC	2	6	908261	908266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_016912	TAT	2	6	910167	910172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016912	AACA	2	8	910193	910200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_016912	TTTG	2	8	910207	910214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016912	CGT	2	6	910248	910253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_016912	ACG	2	6	910264	910269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_016912	T	7	7	910270	910276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016912	T	6	6	910283	910288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016912	GAAGT	2	10	910298	910307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016912	AT	3	6	910354	910359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016912	TAT	2	6	910363	910368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016912	AT	3	6	910427	910432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016912	TAA	2	6	910459	910464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016912	AATT	2	8	911358	911365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016912	AT	3	6	911776	911781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016912	GAAA	2	8	911810	911817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016912	TAT	2	6	912471	912476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016912	TAT	2	6	912516	912521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016912	TAT	2	6	912566	912571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016912	AGG	2	6	912601	912606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016912	CA	3	6	915293	915298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_016912	AAT	2	6	918552	918557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016912	ACG	2	6	918585	918590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016912	GTAT	2	8	918616	918623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016912	ATAA	2	8	918633	918640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016912	TTA	2	6	918718	918723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016912	AGTT	2	8	918763	918770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016912	ATTA	2	8	918801	918808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016912	TTA	2	6	919623	919628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016912	TA	3	6	919627	919632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016912	T	6	6	919645	919650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016912	TAA	2	6	919658	919663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016912	ATT	2	6	919679	919684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016912	TGAT	2	8	919697	919704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016912	T	6	6	919704	919709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016912	A	7	7	919716	919722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016912	TCC	2	6	920888	920893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_016912	TTA	2	6	920911	920916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016912	T	6	6	920957	920962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016912	AT	3	6	921155	921160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016912	A	6	6	922827	922832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016912	ACAATA	2	12	922896	922907	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4079	NC_016912	ACT	2	6	922910	922915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_016912	T	6	6	922924	922929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016912	TAG	2	6	923696	923701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016912	TATAA	2	10	923735	923744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016912	TTTAA	3	15	923764	923778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016912	ATT	2	6	923810	923815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016912	ATA	2	6	923847	923852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016912	AGG	2	6	923869	923874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016912	ATA	2	6	924397	924402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016912	GTA	2	6	924415	924420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016912	TAA	2	6	924430	924435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016912	TAA	2	6	924460	924465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016912	TTTA	2	8	926877	926884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016912	TAA	2	6	927105	927110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016912	ATA	2	6	927143	927148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016912	TAG	2	6	927168	927173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016912	TAG	2	6	927192	927197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016912	TTA	2	6	927221	927226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016912	CAA	2	6	927231	927236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016912	TAA	2	6	927245	927250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016912	AAT	2	6	930603	930608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016912	GAA	2	6	930618	930623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016912	AAAT	2	8	930624	930631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016912	ATG	2	6	930660	930665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016912	TATT	2	8	930809	930816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016912	ACTTA	2	10	930839	930848	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4105	NC_016912	TTTA	2	8	930849	930856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016912	GAA	2	6	931754	931759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016912	T	6	6	931815	931820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016912	TA	3	6	931831	931836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016912	AAC	2	6	934226	934231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_016912	T	6	6	935645	935650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016912	TAA	2	6	937252	937257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016912	ATTA	2	8	937258	937265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016912	CAA	2	6	937272	937277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016912	AGA	2	6	937297	937302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016912	TCAT	2	8	937359	937366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_016912	TA	4	8	937367	937374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016912	A	6	6	937382	937387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016912	TA	3	6	937398	937403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016912	AACGGA	2	12	937418	937429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4120	NC_016912	CGC	2	6	937446	937451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_016912	ATT	2	6	937620	937625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016912	A	7	7	937661	937667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016912	TTA	2	6	938312	938317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016912	AT	3	6	938359	938364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016912	TAA	2	6	938369	938374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016912	TTA	2	6	938392	938397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016912	AAT	2	6	938415	938420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016912	TTA	2	6	938474	938479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016912	AAAG	2	8	938486	938493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016912	TC	3	6	939797	939802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_016912	TA	4	8	939812	939819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016912	TTAT	2	8	939828	939835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016912	TA	3	6	939862	939867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016912	TAT	2	6	939907	939912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016912	AGG	2	6	939977	939982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_016912	T	6	6	940821	940826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_016912	T	6	6	940880	940885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_016912	TTA	2	6	940928	940933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4414	NC_016912	AT	3	6	1005396	1005401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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