MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 15458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016901	T	6	6	1269803	1269808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016901	T	6	6	1269902	1269907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016901	TTCA	2	8	1269939	1269946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_016901	TGT	2	6	1272915	1272920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016901	TG	3	6	1272927	1272932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016901	GTC	2	6	1272938	1272943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_016901	CAT	2	6	1272962	1272967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_016901	AGA	2	6	1272992	1272997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016901	ATA	2	6	1273090	1273095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016901	GCTGA	2	10	1273542	1273551	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4011	NC_016901	T	6	6	1273722	1273727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016901	TAT	2	6	1275888	1275893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016901	GGC	2	6	1275930	1275935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016901	TAA	2	6	1278050	1278055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016901	TTA	2	6	1280509	1280514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016901	TTG	2	6	1280571	1280576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016901	ATGG	2	8	1282942	1282949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016901	CGC	2	6	1282975	1282980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_016901	TAA	2	6	1282982	1282987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016901	TC	3	6	1282989	1282994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_016901	TAA	2	6	1283030	1283035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016901	ATA	2	6	1284827	1284832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016901	TA	3	6	1287745	1287750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016901	TGAG	2	8	1291523	1291530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016901	CTA	3	9	1293403	1293411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_016901	T	7	7	1293432	1293438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016901	GCT	2	6	1293439	1293444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_016901	AATC	2	8	1293486	1293493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_016901	AAC	2	6	1293526	1293531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016901	TGGG	2	8	1293624	1293631	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016901	TG	3	6	1293667	1293672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016901	AGC	2	6	1293744	1293749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_016901	TTA	2	6	1294946	1294951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016901	GC	3	6	1294975	1294980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_016901	TAAA	2	8	1295026	1295033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016901	TTG	2	6	1295085	1295090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016901	T	7	7	1295101	1295107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016901	TGT	2	6	1295126	1295131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016901	TGT	2	6	1295139	1295144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016901	GTT	2	6	1295148	1295153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016901	AT	3	6	1295167	1295172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016901	TTGT	2	8	1296767	1296774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016901	T	6	6	1296830	1296835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016901	GTTA	2	8	1296850	1296857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016901	GCTA	2	8	1298410	1298417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_016901	TGC	2	6	1298466	1298471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_016901	AAT	2	6	1301344	1301349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016901	TTAAT	2	10	1301371	1301380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016901	GCT	2	6	1301440	1301445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_016901	ATC	2	6	1301451	1301456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_016901	AGT	2	6	1302591	1302596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016901	ATT	2	6	1302604	1302609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016901	AAG	2	6	1302613	1302618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016901	T	6	6	1302634	1302639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016901	GTT	2	6	1302727	1302732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016901	TTC	2	6	1303674	1303679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_016901	GTT	2	6	1304313	1304318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016901	GT	3	6	1304339	1304344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016901	GCG	2	6	1304460	1304465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016901	TCAC	2	8	1304820	1304827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_016901	TGA	2	6	1304858	1304863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016901	AATCCC	2	12	1304885	1304896	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_016901	TGG	2	6	1308340	1308345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016901	ATA	2	6	1308448	1308453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016901	TGAA	2	8	1308480	1308487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016901	GAA	2	6	1308491	1308496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016901	AAG	2	6	1308810	1308815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016901	ATAA	2	8	1308876	1308883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016901	GTT	2	6	1309120	1309125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016901	T	7	7	1309124	1309130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016901	TC	3	6	1309197	1309202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_016901	AGA	2	6	1309306	1309311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016901	TTGAA	2	10	1309312	1309321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016901	AATT	2	8	1309325	1309332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016901	TATT	2	8	1309399	1309406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016901	ACT	2	6	1309407	1309412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_016901	ATT	2	6	1309524	1309529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016901	GATG	2	8	1310125	1310132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016901	T	6	6	1310162	1310167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016901	T	6	6	1310175	1310180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016901	TGA	2	6	1310711	1310716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016901	GCG	2	6	1310809	1310814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_016901	GAT	2	6	1310837	1310842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016901	TGC	2	6	1310880	1310885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_016901	GCT	2	6	1311301	1311306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016901	CG	3	6	1311351	1311356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_016901	T	8	8	1311378	1311385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016901	TGG	2	6	1311859	1311864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016901	ATT	2	6	1312520	1312525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016901	TTTA	2	8	1312540	1312547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016901	TAAA	2	8	1312566	1312573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016901	A	6	6	1312571	1312576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016901	TTTA	2	8	1312578	1312585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016901	AT	3	6	1313334	1313339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016901	GAG	2	6	1313366	1313371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016901	GCA	2	6	1314382	1314387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_016901	ATG	2	6	1315171	1315176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016901	ATTTG	2	10	1316567	1316576	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016901	ATG	2	6	1316666	1316671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016901	GAT	2	6	1316701	1316706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016901	TGG	2	6	1316754	1316759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016901	TTGA	2	8	1316760	1316767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016901	ATTT	2	8	1318515	1318522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016901	A	7	7	1318535	1318541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016901	AGCACC	2	12	1318605	1318616	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_016901	CCA	2	6	1318640	1318645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_016901	GAA	2	6	1318694	1318699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016901	AGCACC	2	12	1318778	1318789	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_016901	CCA	2	6	1318813	1318818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_016901	A	7	7	1319152	1319158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016901	AATTC	2	10	1319952	1319961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4112	NC_016901	CA	3	6	1320031	1320036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_016901	T	6	6	1320037	1320042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016901	ATTTAT	2	12	1321794	1321805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016901	TAAC	2	8	1321850	1321857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_016901	TC	3	6	1321884	1321889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_016901	AGG	2	6	1321967	1321972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016901	GT	3	6	1324568	1324573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016901	TGAA	2	8	1324648	1324655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016901	T	6	6	1324763	1324768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016901	ATC	2	6	1325273	1325278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016901	TC	3	6	1325288	1325293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_016901	ATA	2	6	1325303	1325308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016901	TAA	2	6	1325353	1325358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016901	GATA	2	8	1326304	1326311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016901	TCT	2	6	1326381	1326386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_016901	TGG	2	6	1326446	1326451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016901	ATTC	2	8	1326454	1326461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_016901	A	6	6	1326479	1326484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016901	AAGC	2	8	1326545	1326552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4131	NC_016901	TTGAA	2	10	1326565	1326574	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016901	CT	3	6	1326582	1326587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_016901	GCA	2	6	1326613	1326618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_016901	A	6	6	1326628	1326633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016901	TG	3	6	1326765	1326770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_016901	GTTT	2	8	1326872	1326879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_016901	CAA	2	6	1326955	1326960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4244	NC_016901	GCC	2	6	1333087	1333092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4245	NC_016901	ATTT	2	8	1333098	1333105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_016901	GTTCA	2	10	1333172	1333181	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4247	NC_016901	TTG	2	6	1333193	1333198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_016901	TG	3	6	1333245	1333250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_016901	GTCT	2	8	1333264	1333271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4252	NC_016901	GA	3	6	1333274	1333279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_016901	GA	3	6	1333370	1333375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_016901	TGA	2	6	1337048	1337053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_016901	AAT	2	6	1337109	1337114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_016901	A	6	6	1337115	1337120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_016901	CAT	2	6	1337147	1337152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_016901	AAAT	2	8	1338484	1338491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_016901	GAT	2	6	1338515	1338520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_016901	ATTG	2	8	1338581	1338588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_016901	TGT	2	6	1338668	1338673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_016901	AG	3	6	1338735	1338740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_016901	TTAA	2	8	1342278	1342285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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