MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 15458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016901	GTT	2	6	5141640	5141645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_016901	AATC	2	8	5141703	5141710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15003	NC_016901	TGC	2	6	5141764	5141769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_016901	GA	3	6	5141785	5141790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_016901	ACAT	2	8	5141954	5141961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15006	NC_016901	TTC	2	6	5142066	5142071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_016901	AAC	2	6	5142077	5142082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_016901	CCG	2	6	5142154	5142159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_016901	TAG	2	6	5142185	5142190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_016901	ATA	2	6	5142229	5142234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_016901	TCA	2	6	5142299	5142304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_016901	TCT	2	6	5142486	5142491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_016901	CA	3	6	5142513	5142518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15014	NC_016901	TACCTG	2	12	5142574	5142585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_016901	CCTT	2	8	5143947	5143954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15016	NC_016901	AT	3	6	5148707	5148712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_016901	ATT	2	6	5148888	5148893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_016901	A	8	8	5148949	5148956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_016901	TTA	2	6	5148957	5148962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_016901	T	7	7	5148972	5148978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_016901	GTTTG	2	10	5149107	5149116	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_016901	TA	3	6	5151044	5151049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_016901	GTT	2	6	5151064	5151069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_016901	GTA	2	6	5151366	5151371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_016901	ATCA	2	8	5151393	5151400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15026	NC_016901	A	6	6	5151682	5151687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_016901	TAA	2	6	5152020	5152025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_016901	CTG	2	6	5152050	5152055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_016901	CAA	2	6	5154160	5154165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_016901	CA	3	6	5154255	5154260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15031	NC_016901	AAT	2	6	5154356	5154361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_016901	T	6	6	5154377	5154382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_016901	CCA	2	6	5154413	5154418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15034	NC_016901	CTT	2	6	5154559	5154564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_016901	TGA	2	6	5154645	5154650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_016901	AG	3	6	5154710	5154715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_016901	TAA	2	6	5154752	5154757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_016901	T	7	7	5154822	5154828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_016901	ATT	2	6	5154869	5154874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_016901	TTG	2	6	5154941	5154946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_016901	T	6	6	5154974	5154979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_016901	TGC	2	6	5155091	5155096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_016901	TTG	2	6	5155099	5155104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_016901	TTA	2	6	5155137	5155142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_016901	TAA	2	6	5155151	5155156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_016901	AGC	2	6	5155177	5155182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_016901	ACC	2	6	5155205	5155210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15048	NC_016901	ATA	2	6	5155252	5155257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_016901	TGT	2	6	5155262	5155267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_016901	CCA	2	6	5155284	5155289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15051	NC_016901	TGA	2	6	5155301	5155306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_016901	TCT	2	6	5155320	5155325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_016901	TG	3	6	5155344	5155349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_016901	TAA	2	6	5156585	5156590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_016901	ATC	2	6	5156705	5156710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_016901	CTG	2	6	5156722	5156727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_016901	TTA	2	6	5156734	5156739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_016901	GGA	2	6	5156831	5156836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_016901	ATT	2	6	5156910	5156915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_016901	AGT	2	6	5156952	5156957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_016901	ATC	2	6	5157065	5157070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_016901	TAA	2	6	5157115	5157120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_016901	TAA	2	6	5157128	5157133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_016901	TGG	2	6	5157176	5157181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_016901	TCA	2	6	5157252	5157257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_016901	CTTA	2	8	5157299	5157306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15067	NC_016901	TTTGCT	2	12	5157339	5157350	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15068	NC_016901	ATC	2	6	5157449	5157454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_016901	CCA	2	6	5157476	5157481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15070	NC_016901	TAA	2	6	5157506	5157511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_016901	T	6	6	5157596	5157601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_016901	T	6	6	5157611	5157616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_016901	TAAG	2	8	5157623	5157630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_016901	T	7	7	5157639	5157645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_016901	AATTC	2	10	5157720	5157729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15076	NC_016901	T	6	6	5157857	5157862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_016901	GGC	2	6	5157887	5157892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15078	NC_016901	TTTA	2	8	5157926	5157933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_016901	TAA	2	6	5157934	5157939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_016901	TTC	2	6	5157976	5157981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_016901	AT	3	6	5157988	5157993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_016901	ATT	2	6	5158007	5158012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_016901	TA	3	6	5159034	5159039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_016901	GAT	2	6	5159071	5159076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_016901	TAG	2	6	5159119	5159124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_016901	GCTT	2	8	5159153	5159160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15087	NC_016901	TAA	2	6	5159167	5159172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_016901	TAC	2	6	5159211	5159216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_016901	TTAT	2	8	5159226	5159233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_016901	TA	3	6	5159241	5159246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_016901	AGT	2	6	5159352	5159357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_016901	A	6	6	5159384	5159389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_016901	CAA	2	6	5159398	5159403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_016901	AAC	2	6	5159410	5159415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_016901	T	6	6	5159455	5159460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_016901	ATTA	2	8	5159468	5159475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_016901	TAC	2	6	5163199	5163204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_016901	GAC	2	6	5163226	5163231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_016901	AC	5	10	5163329	5163338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15100	NC_016901	TCC	2	6	5163366	5163371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15101	NC_016901	TCA	2	6	5163431	5163436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_016901	CCA	2	6	5166786	5166791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15103	NC_016901	ACTA	2	8	5166856	5166863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15104	NC_016901	GC	3	6	5168582	5168587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15105	NC_016901	AATA	2	8	5169703	5169710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_016901	CACC	2	8	5171180	5171187	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15107	NC_016901	CAA	2	6	5171246	5171251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_016901	ATTT	2	8	5171273	5171280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_016901	CAA	2	6	5171282	5171287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_016901	CGAT	2	8	5171298	5171305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15111	NC_016901	ATC	2	6	5171349	5171354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_016901	TGAT	2	8	5180848	5180855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_016901	GAC	2	6	5180916	5180921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_016901	AT	3	6	5180965	5180970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_016901	CGG	2	6	5180985	5180990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_016901	GCC	2	6	5181050	5181055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15117	NC_016901	CAA	2	6	5181086	5181091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_016901	TCT	2	6	5181634	5181639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_016901	ATGG	2	8	5181726	5181733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_016901	AGCT	2	8	5181736	5181743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15121	NC_016901	GGC	2	6	5181904	5181909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_016901	ACG	2	6	5181973	5181978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_016901	ATA	2	6	5181997	5182002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_016901	A	7	7	5183604	5183610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_016901	GACTA	2	10	5183611	5183620	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15126	NC_016901	T	7	7	5183780	5183786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_016901	AAG	2	6	5184415	5184420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_016901	TCT	2	6	5184440	5184445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15129	NC_016901	ATT	2	6	5185817	5185822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_016901	TAAA	2	8	5186456	5186463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_016901	AATT	2	8	5186476	5186483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_016901	CCA	2	6	5186540	5186545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15250	NC_016901	ATGG	2	8	5243215	5243222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15253	NC_016901	A	7	7	5243306	5243312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_016901	AAT	2	6	5243340	5243345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15256	NC_016901	ACCG	2	8	5243375	5243382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15257	NC_016901	GGC	2	6	5243447	5243452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15374	NC_016901	CCT	2	6	5260136	5260141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15383	NC_016901	CTT	2	6	5260664	5260669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15385	NC_016901	ATTCA	2	10	5260712	5260721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15386	NC_016901	GCTT	2	8	5260735	5260742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15387	NC_016901	A	6	6	5260861	5260866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_016901	ATC	2	6	5260931	5260936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15389	NC_016901	TTA	2	6	5262421	5262426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15390	NC_016901	CAT	2	6	5262822	5262827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15391	NC_016901	TA	3	6	5262854	5262859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15392	NC_016901	TA	3	6	5262891	5262896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15393	NC_016901	TTA	2	6	5263852	5263857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15394	NC_016901	AGC	2	6	5263879	5263884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15395	NC_016901	T	6	6	5263914	5263919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15396	NC_016901	TTTTAA	2	12	5263968	5263979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15397	NC_016901	ATC	2	6	5263991	5263996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15398	NC_016901	CCA	2	6	5264249	5264254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15399	NC_016901	CGT	2	6	5264280	5264285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15400	NC_016901	TGT	2	6	5264288	5264293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15401	NC_016901	A	6	6	5264305	5264310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15402	NC_016901	TTTA	2	8	5264329	5264336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15403	NC_016901	GTT	2	6	5266205	5266210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15404	NC_016901	T	6	6	5266217	5266222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15405	NC_016901	AAGT	2	8	5267009	5267016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15406	NC_016901	TTCGA	2	10	5267017	5267026	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15407	NC_016901	GAAAC	2	10	5267042	5267051	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15408	NC_016901	T	6	6	5267052	5267057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15409	NC_016901	A	7	7	5267137	5267143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15410	NC_016901	TAA	2	6	5267190	5267195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15411	NC_016901	TCT	2	6	5269380	5269385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15412	NC_016901	TTAAC	2	10	5269463	5269472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15413	NC_016901	CGAAT	2	10	5269513	5269522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15414	NC_016901	CAA	2	6	5269526	5269531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15415	NC_016901	TAAA	2	8	5269585	5269592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15416	NC_016901	A	6	6	5271010	5271015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15417	NC_016901	AAGCG	2	10	5271061	5271070	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15418	NC_016901	GAA	3	9	5271079	5271087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15419	NC_016901	AC	3	6	5271095	5271100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15420	NC_016901	A	6	6	5271132	5271137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15421	NC_016901	T	6	6	5271156	5271161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15422	NC_016901	AACTC	2	10	5276069	5276078	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15423	NC_016901	CCT	2	6	5276560	5276565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15425	NC_016901	TTC	2	6	5276894	5276899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15426	NC_016901	ACA	2	6	5278230	5278235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15427	NC_016901	TGTA	2	8	5280011	5280018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15428	NC_016901	CTTA	2	8	5280036	5280043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15429	NC_016901	ATTC	2	8	5280050	5280057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15430	NC_016901	CAA	2	6	5280705	5280710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15431	NC_016901	TAT	2	6	5280735	5280740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15432	NC_016901	AGC	2	6	5280792	5280797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15433	NC_016901	AGCT	2	8	5280803	5280810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15434	NC_016901	TTTGC	2	10	5282753	5282762	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15435	NC_016901	TCGA	2	8	5282790	5282797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15436	NC_016901	GAT	2	6	5282798	5282803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15440	NC_016901	TA	3	6	5282894	5282899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15441	NC_016901	ATTA	2	8	5282904	5282911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15442	NC_016901	TGATC	2	10	5282929	5282938	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15450	NC_016901	GGC	2	6	5285256	5285261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15458	NC_016901	CA	3	6	5288037	5288042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.