MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 15458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016901	TCG	2	6	4355484	4355489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_016901	CTC	2	6	4356608	4356613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13003	NC_016901	AGCT	2	8	4356643	4356650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13004	NC_016901	ATTAG	2	10	4356658	4356667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_016901	AATA	2	8	4358559	4358566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016901	ATCT	2	8	4358567	4358574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13007	NC_016901	ATT	2	6	4358690	4358695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016901	TCA	2	6	4358707	4358712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016901	GAT	2	6	4358714	4358719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016901	CTA	2	6	4358854	4358859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_016901	TAA	2	6	4358895	4358900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_016901	AT	3	6	4358902	4358907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016901	T	6	6	4358907	4358912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_016901	GCA	2	6	4358930	4358935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_016901	ACA	2	6	4358953	4358958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_016901	TAA	2	6	4358961	4358966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_016901	TCAG	2	8	4361056	4361063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13018	NC_016901	GCC	2	6	4361086	4361091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_016901	GGC	2	6	4361106	4361111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_016901	TGC	2	6	4361890	4361895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_016901	TG	3	6	4362518	4362523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_016901	A	6	6	4362525	4362530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_016901	CGC	2	6	4362580	4362585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13024	NC_016901	A	7	7	4362727	4362733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016901	AAT	2	6	4362744	4362749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_016901	AAT	2	6	4362756	4362761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_016901	CGC	2	6	4364878	4364883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_016901	TGAT	2	8	4365009	4365016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016901	TTAA	2	8	4365023	4365030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_016901	AAG	2	6	4365035	4365040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016901	TGG	2	6	4365045	4365050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016901	TTA	2	6	4365929	4365934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016901	A	6	6	4365976	4365981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016901	CT	3	6	4365985	4365990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_016901	TA	3	6	4366012	4366017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_016901	CAG	2	6	4366038	4366043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_016901	TGG	2	6	4367084	4367089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_016901	AAT	2	6	4367117	4367122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_016901	A	6	6	4367849	4367854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_016901	TTA	2	6	4370525	4370530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_016901	GAA	2	6	4370737	4370742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_016901	CACT	2	8	4371334	4371341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_016901	TAA	2	6	4371426	4371431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_016901	TA	3	6	4372811	4372816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_016901	T	7	7	4373371	4373377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_016901	ACA	2	6	4373418	4373423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_016901	T	6	6	4373476	4373481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_016901	CTG	2	6	4373483	4373488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_016901	A	8	8	4373490	4373497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_016901	ACA	2	6	4373520	4373525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_016901	A	6	6	4375855	4375860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_016901	CATT	2	8	4375871	4375878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13053	NC_016901	A	6	6	4375880	4375885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_016901	TAAC	2	8	4376464	4376471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13055	NC_016901	AACA	2	8	4376508	4376515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_016901	TCAT	2	8	4379373	4379380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13057	NC_016901	CAA	2	6	4379403	4379408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_016901	TAC	2	6	4380691	4380696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_016901	CACC	2	8	4383206	4383213	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13060	NC_016901	ATAA	2	8	4383254	4383261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_016901	A	6	6	4384286	4384291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_016901	CTG	2	6	4384294	4384299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_016901	ATT	2	6	4384327	4384332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_016901	AGC	2	6	4384344	4384349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_016901	TCA	2	6	4384380	4384385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_016901	AGACA	2	10	4384399	4384408	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13067	NC_016901	TGA	2	6	4384426	4384431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_016901	TGT	2	6	4384532	4384537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_016901	ATCA	2	8	4384543	4384550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_016901	AC	3	6	4384635	4384640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13071	NC_016901	TCAG	2	8	4384730	4384737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13072	NC_016901	TTAAC	2	10	4384829	4384838	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13073	NC_016901	CTT	2	6	4384854	4384859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_016901	CGC	2	6	4384927	4384932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_016901	T	6	6	4384996	4385001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_016901	CGG	2	6	4385021	4385026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_016901	TTA	2	6	4385116	4385121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016901	GAT	2	6	4385129	4385134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016901	CAT	2	6	4385149	4385154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_016901	ATA	2	6	4385206	4385211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_016901	A	7	7	4385211	4385217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_016901	TAG	2	6	4385317	4385322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_016901	TTC	2	6	4385357	4385362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_016901	CAA	2	6	4385382	4385387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_016901	AGCAT	2	10	4385451	4385460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13086	NC_016901	TA	3	6	4385467	4385472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_016901	TAC	2	6	4385491	4385496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_016901	TCA	2	6	4385497	4385502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_016901	CTT	2	6	4385528	4385533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_016901	CAT	2	6	4385544	4385549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_016901	CAAA	2	8	4385659	4385666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13092	NC_016901	GAAAA	2	10	4385677	4385686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016901	T	6	6	4385719	4385724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016901	GA	3	6	4385777	4385782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_016901	A	7	7	4387005	4387011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_016901	GCT	2	6	4387035	4387040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_016901	TTCA	2	8	4389076	4389083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13098	NC_016901	AC	3	6	4389245	4389250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_016901	TCT	2	6	4389264	4389269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_016901	CGCA	2	8	4389336	4389343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_016901	GC	4	8	4389441	4389448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_016901	ATC	2	6	4390177	4390182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_016901	TAAT	2	8	4390208	4390215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_016901	CAT	2	6	4390220	4390225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_016901	AAT	2	6	4390313	4390318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_016901	TGT	2	6	4391869	4391874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_016901	GCA	2	6	4391875	4391880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_016901	AGC	2	6	4391939	4391944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_016901	TTG	2	6	4391945	4391950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_016901	CTCG	2	8	4394078	4394085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13111	NC_016901	GCA	2	6	4394141	4394146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_016901	TAA	2	6	4394198	4394203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_016901	A	6	6	4394792	4394797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_016901	GC	3	6	4396353	4396358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_016901	GAGT	2	8	4396397	4396404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_016901	ATG	2	6	4396726	4396731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_016901	TCA	2	6	4396767	4396772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_016901	ACA	2	6	4396885	4396890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_016901	AT	3	6	4396897	4396902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_016901	TCG	2	6	4396957	4396962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_016901	TA	3	6	4396972	4396977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_016901	ATTAAT	2	12	4397037	4397048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_016901	CAT	2	6	4397055	4397060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_016901	GTC	2	6	4398357	4398362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_016901	A	6	6	4398375	4398380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_016901	T	7	7	4398407	4398413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_016901	CGC	2	6	4398436	4398441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_016901	CGG	2	6	4399090	4399095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13130	NC_016901	A	7	7	4399177	4399183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_016901	TGC	2	6	4399191	4399196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_016901	ACA	2	6	4399219	4399224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13262	NC_016901	ACCA	2	8	4443862	4443869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13263	NC_016901	TGA	2	6	4447778	4447783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13291	NC_016901	AAGC	2	8	4457639	4457646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13383	NC_016901	TAAG	2	8	4482491	4482498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13386	NC_016901	T	6	6	4482652	4482657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13387	NC_016901	TAA	2	6	4483315	4483320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13388	NC_016901	AAGC	2	8	4483333	4483340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13389	NC_016901	ATT	2	6	4483361	4483366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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