MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 plasmid unnamed

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016888	GA	3	6	11	16	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016888	A	7	7	16	22	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016888	GGA	2	6	23	28	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016888	CGG	2	6	437	442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016888	CGGA	2	8	568	575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016888	CCCG	2	8	593	600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016888	GGA	2	6	627	632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016888	TGC	2	6	747	752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016888	TCG	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016888	TTG	2	6	798	803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016888	CCGA	2	8	937	944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016888	GAA	2	6	1009	1014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016888	CAC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016888	GAG	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016888	TCC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016888	GGCA	2	8	3375	3382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016888	ATA	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016888	A	6	6	3410	3415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016888	CTGCCA	2	12	4375	4386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016888	AGG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016888	GA	3	6	5097	5102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016888	GAT	2	6	5285	5290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016888	TGG	2	6	5341	5346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016888	AGT	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016888	TGG	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016888	GCAT	2	8	5411	5418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016888	GT	3	6	5513	5518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016888	GGA	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016888	CCT	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016888	TTG	2	6	7109	7114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016888	GGC	2	6	7191	7196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016888	GAC	2	6	7231	7236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016888	TGG	2	6	7353	7358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016888	TCG	2	6	7518	7523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016888	GT	3	6	7576	7581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016888	CAG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016888	CCG	2	6	7663	7668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016888	TGG	2	6	7711	7716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016888	AAC	2	6	7753	7758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016888	GCC	2	6	7818	7823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016888	GCGG	2	8	7934	7941	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016888	GGA	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016888	GGA	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016888	AGC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016888	TGG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016888	A	6	6	8319	8324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016888	GCCGGG	2	12	8329	8340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016888	ACC	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016888	GGCC	2	8	8379	8386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016888	GCC	2	6	8390	8395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016888	GTC	2	6	8422	8427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016888	CG	3	6	8453	8458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016888	ATGA	2	8	9396	9403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016888	TCC	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016888	TCT	2	6	10894	10899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016888	ACTC	2	8	10999	11006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016888	AC	4	8	11007	11014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016888	TCCGC	2	10	11063	11072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016888	TCGC	2	8	11117	11124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016888	CAT	2	6	11158	11163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016888	CA	4	8	11167	11174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016888	CGG	2	6	11243	11248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016888	TTA	2	6	11255	11260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016888	TTA	2	6	11300	11305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016888	TTG	2	6	11320	11325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016888	TCTCG	2	10	11438	11447	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016888	GAG	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016888	GAG	2	6	12981	12986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016888	GTC	2	6	13006	13011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016888	GGTTC	2	10	13061	13070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016888	TCA	2	6	13218	13223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016888	AG	4	8	13260	13267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016888	GAC	2	6	13373	13378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016888	AGG	2	6	13404	13409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016888	CGT	2	6	13776	13781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016888	GTG	2	6	13877	13882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016888	TCG	2	6	13988	13993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016888	ATC	2	6	14018	14023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016888	CGC	2	6	14088	14093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016888	TTTC	2	8	16742	16749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016888	GGTA	2	8	16754	16761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016888	CAC	2	6	16773	16778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016888	CGGT	2	8	17392	17399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016888	CTC	2	6	17403	17408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016888	TGA	2	6	17453	17458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016888	TG	3	6	17480	17485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016888	A	6	6	17494	17499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016888	CTTAT	2	10	17506	17515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016888	TCT	2	6	17751	17756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016888	GGT	2	6	17777	17782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016888	TCG	2	6	17810	17815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016888	GGC	2	6	17844	17849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016888	TG	3	6	17889	17894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016888	CCG	2	6	17905	17910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016888	TGA	2	6	17978	17983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016888	CG	3	6	18008	18013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016888	TCG	2	6	18110	18115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016888	CCCA	2	8	18234	18241	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_016888	AGG	2	6	18252	18257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016888	CCGGTC	2	12	18394	18405	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016888	A	7	7	18491	18497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016888	GCG	2	6	18586	18591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016888	TGC	2	6	18620	18625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016888	TGC	2	6	18674	18679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016888	CG	3	6	18716	18721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016888	GCCG	2	8	18765	18772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016888	ATA	2	6	18802	18807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016888	GGC	2	6	18817	18822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016888	TGG	2	6	18851	18856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016888	TCG	2	6	18866	18871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016888	GTCC	2	8	18914	18921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016888	GGC	2	6	18941	18946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016888	CGT	2	6	19028	19033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016888	ACC	2	6	19047	19052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016888	TGC	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016888	AGC	2	6	19113	19118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016888	CGT	2	6	19204	19209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016888	CGA	2	6	19234	19239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016888	TCC	2	6	19257	19262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016888	AC	3	6	19282	19287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016888	GAG	2	6	19403	19408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016888	ATG	2	6	19449	19454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016888	CCA	2	6	19510	19515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016888	CAT	2	6	19996	20001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016888	AGG	2	6	20004	20009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016888	CCG	2	6	21334	21339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016888	AAG	2	6	21430	21435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016888	GTTG	2	8	21462	21469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016888	CACC	2	8	21479	21486	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016888	GTT	2	6	21521	21526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016888	AGG	2	6	21935	21940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016888	CGGGC	2	10	21997	22006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016888	GCC	2	6	22056	22061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016888	GTT	2	6	22101	22106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016888	GCC	2	6	22138	22143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016888	C	6	6	22151	22156	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_016888	CGA	2	6	22209	22214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016888	CGC	2	6	22226	22231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016888	C	6	6	22240	22245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_016888	GCG	2	6	22261	22266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016888	CGG	2	6	22808	22813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016888	ACGG	2	8	24534	24541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016888	TGA	2	6	24603	24608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016888	GCA	2	6	24611	24616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016888	TTG	2	6	24652	24657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016888	TG	3	6	24714	24719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016888	TTA	2	6	24730	24735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016888	GGGA	2	8	24770	24777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016888	AC	3	6	24795	24800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016888	CCG	2	6	24813	24818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_016888	CCA	2	6	24830	24835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_016888	GGA	2	6	24844	24849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016888	CG	3	6	24912	24917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016888	TTC	2	6	25015	25020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_016888	GAAC	2	8	25718	25725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_016888	TCGG	2	8	25952	25959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_016888	TGG	2	6	26021	26026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016888	CGG	2	6	26690	26695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_016888	GTA	2	6	27298	27303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016888	TAT	2	6	27304	27309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_016888	TTC	2	6	33014	33019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_016888	GGT	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016888	CAG	2	6	33230	33235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_016888	GT	3	6	33708	33713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_016888	TCC	2	6	33731	33736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_016888	AGT	2	6	51284	51289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_016888	A	7	7	51376	51382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_016888	A	6	6	52956	52961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_016888	CGAT	2	8	54379	54386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
286	NC_016888	AGG	2	6	54436	54441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016888	TCCA	2	8	54468	54475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_016888	TGA	2	6	54530	54535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016888	CCA	2	6	54542	54547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_016888	ACTA	2	8	54553	54560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
291	NC_016888	AAC	2	6	56078	56083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_016888	CGGT	2	8	56088	56095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_016888	GAG	2	6	56115	56120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_016888	GGA	2	6	56149	56154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_016888	GGCA	2	8	56185	56192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
296	NC_016888	GCCT	2	8	56247	56254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
297	NC_016888	CGT	2	6	56322	56327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_016888	CAAGG	2	10	56424	56433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
299	NC_016888	GAAG	2	8	56457	56464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
300	NC_016888	CGG	2	6	56466	56471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_016888	GC	3	6	56561	56566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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314	NC_016888	TGT	2	6	59776	59781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_016888	TGG	2	6	59883	59888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_016888	GCC	2	6	63538	63543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.