MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 chromosome

Total Repeats: 8871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016884	GTCA	2	8	1187616	1187623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_016884	AGG	2	6	1187638	1187643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016884	TGC	2	6	1188152	1188157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_016884	GTC	2	6	1188173	1188178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016884	AAT	2	6	1188193	1188198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016884	CGATTA	2	12	1188212	1188223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4007	NC_016884	ATC	2	6	1188297	1188302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_016884	TCA	2	6	1191859	1191864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_016884	G	10	10	1191898	1191907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016884	ATC	2	6	1192824	1192829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016884	T	6	6	1192864	1192869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016884	GTT	2	6	1192877	1192882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016884	GAG	2	6	1194875	1194880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016884	AAT	2	6	1196239	1196244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016884	GGCG	2	8	1197166	1197173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_016884	ATT	2	6	1197174	1197179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016884	C	6	6	1198011	1198016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4018	NC_016884	T	6	6	1198061	1198066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016884	C	6	6	1198074	1198079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4020	NC_016884	C	6	6	1198376	1198381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4021	NC_016884	GGA	2	6	1199414	1199419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016884	GAAG	2	8	1199999	1200006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016884	GCG	2	6	1201199	1201204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016884	AG	3	6	1201205	1201210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016884	CTC	2	6	1201824	1201829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_016884	TAA	2	6	1201851	1201856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016884	GAG	2	6	1204037	1204042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016884	CCGC	3	12	1204523	1204534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4029	NC_016884	CGG	2	6	1204537	1204542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016884	T	6	6	1204547	1204552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016884	AGAGA	2	10	1206405	1206414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016884	GCCC	2	8	1206420	1206427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4033	NC_016884	TGT	2	6	1206438	1206443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016884	TGCC	2	8	1206560	1206567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_016884	GGC	2	6	1206624	1206629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_016884	ACA	3	9	1206650	1206658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_016884	CGC	2	6	1206770	1206775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_016884	TCG	2	6	1206836	1206841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_016884	CAT	2	6	1208044	1208049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_016884	CGT	2	6	1208110	1208115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_016884	A	6	6	1208125	1208130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016884	TGGC	2	8	1208158	1208165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_016884	AGG	2	6	1208819	1208824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016884	CG	3	6	1208875	1208880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_016884	ACC	2	6	1208895	1208900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_016884	GCG	2	6	1208970	1208975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_016884	GTT	2	6	1208983	1208988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016884	CAC	2	6	1209124	1209129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_016884	CCT	2	6	1209172	1209177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_016884	GTT	3	9	1213075	1213083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016884	CGGT	2	8	1213175	1213182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_016884	AGA	2	6	1213252	1213257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016884	AC	3	6	1213335	1213340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_016884	TG	3	6	1214000	1214005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016884	AC	3	6	1214072	1214077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_016884	GAA	2	6	1215220	1215225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016884	GACA	2	8	1215265	1215272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_016884	GGC	2	6	1215298	1215303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_016884	CAA	2	6	1215308	1215313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016884	AGGA	2	8	1215359	1215366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016884	TGG	2	6	1215461	1215466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016884	ATT	2	6	1215469	1215474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016884	CGTGG	2	10	1215495	1215504	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4064	NC_016884	GAAT	2	8	1215633	1215640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016884	AGGTG	2	10	1215683	1215692	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016884	CGA	2	6	1215811	1215816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_016884	AC	3	6	1215866	1215871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_016884	GCA	2	6	1215921	1215926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_016884	GGA	2	6	1215937	1215942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016884	GCCG	2	8	1215974	1215981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_016884	CAG	2	6	1216027	1216032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_016884	ACG	2	6	1216061	1216066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_016884	ACGGC	2	10	1216157	1216166	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4074	NC_016884	GGCCG	2	10	1216230	1216239	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4075	NC_016884	GCT	2	6	1216273	1216278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_016884	TCG	2	6	1216434	1216439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_016884	GCG	2	6	1216506	1216511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016884	TGG	2	6	1216542	1216547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016884	GAA	2	6	1216691	1216696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016884	TTG	3	9	1217600	1217608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016884	AGG	2	6	1217613	1217618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016884	GAA	2	6	1217696	1217701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016884	TCTA	2	8	1217703	1217710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_016884	CAC	2	6	1217724	1217729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_016884	CCT	2	6	1217873	1217878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_016884	CCGC	2	8	1217925	1217932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4087	NC_016884	AGGA	2	8	1217969	1217976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016884	CCA	2	6	1218068	1218073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_016884	ATC	2	6	1218130	1218135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016884	GAA	2	6	1218184	1218189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016884	TCC	2	6	1218202	1218207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_016884	TTG	2	6	1218242	1218247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016884	GGT	2	6	1218851	1218856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016884	CCT	3	9	1218857	1218865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_016884	ATC	2	6	1220765	1220770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_016884	GGA	2	6	1220833	1220838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016884	AAT	2	6	1221835	1221840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016884	C	6	6	1225511	1225516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4099	NC_016884	TAT	2	6	1225521	1225526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016884	CCG	2	6	1225602	1225607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_016884	ATTT	2	8	1227026	1227033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016884	GGA	2	6	1227118	1227123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016884	TCG	2	6	1227206	1227211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_016884	AT	3	6	1227352	1227357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016884	TGA	2	6	1227399	1227404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016884	AGG	2	6	1227437	1227442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016884	C	6	6	1228840	1228845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4108	NC_016884	GGC	2	6	1228869	1228874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016884	TCC	2	6	1230690	1230695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_016884	AT	4	8	1230759	1230766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016884	GCCC	2	8	1230790	1230797	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4112	NC_016884	GGA	2	6	1232702	1232707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016884	CTC	2	6	1237387	1237392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_016884	A	6	6	1237434	1237439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016884	GGTT	2	8	1237486	1237493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016884	CGCGA	2	10	1244199	1244208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4117	NC_016884	TAA	2	6	1244219	1244224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016884	CCA	2	6	1244325	1244330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_016884	GGT	2	6	1244373	1244378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016884	CCA	2	6	1244482	1244487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_016884	AGC	2	6	1244518	1244523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016884	CCT	2	6	1244557	1244562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_016884	AGG	2	6	1244753	1244758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016884	CCA	2	6	1244783	1244788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_016884	ATT	2	6	1244873	1244878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016884	T	6	6	1244902	1244907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016884	TG	3	6	1244934	1244939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016884	CG	3	6	1244986	1244991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_016884	CTGA	2	8	1244995	1245002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_016884	TGTCC	2	10	1246048	1246057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4131	NC_016884	GCC	2	6	1246126	1246131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_016884	AAT	2	6	1246266	1246271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016884	CAT	2	6	1246401	1246406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_016884	TCT	2	6	1246427	1246432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_016884	CG	3	6	1246530	1246535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_016884	GA	3	6	1246540	1246545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_016884	GTC	2	6	1246740	1246745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_016884	ACC	2	6	1250962	1250967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4144	NC_016884	CTCAC	2	10	1252218	1252227	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4145	NC_016884	AAT	2	6	1252236	1252241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_016884	GAA	2	6	1252268	1252273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4244	NC_016884	GAG	2	6	1327088	1327093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_016884	GGC	3	9	1327555	1327563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_016884	A	6	6	1327577	1327582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_016884	ACGGA	2	10	1327625	1327634	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4248	NC_016884	T	6	6	1327772	1327777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_016884	T	6	6	1327823	1327828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_016884	AGGT	2	8	1327837	1327844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_016884	GCT	2	6	1327898	1327903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_016884	CGA	2	6	1327956	1327961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_016884	GGTCA	2	10	1328026	1328035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4254	NC_016884	CGGT	2	8	1328200	1328207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4255	NC_016884	GGT	2	6	1328253	1328258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_016884	CAT	2	6	1328261	1328266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_016884	CCGT	2	8	1329218	1329225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_016884	TAA	2	6	1329309	1329314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_016884	GAT	2	6	1330869	1330874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_016884	TGG	2	6	1330916	1330921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_016884	TG	3	6	1330934	1330939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_016884	AGG	2	6	1331103	1331108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_016884	AT	3	6	1331856	1331861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_016884	AGGA	2	8	1331873	1331880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_016884	GTGG	2	8	1332001	1332008	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_016884	GTC	2	6	1332039	1332044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4267	NC_016884	ATC	2	6	1332078	1332083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4269	NC_016884	GAG	2	6	1332557	1332562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_016884	TTA	2	6	1332563	1332568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_016884	TTA	2	6	1332627	1332632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4273	NC_016884	AAGA	2	8	1332689	1332696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_016884	TGG	2	6	1332723	1332728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4276	NC_016884	GGTG	2	8	1332767	1332774	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4281	NC_016884	GCTG	2	8	1334350	1334357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4285	NC_016884	TAC	2	6	1335325	1335330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4289	NC_016884	TGAG	2	8	1338870	1338877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4290	NC_016884	A	6	6	1338893	1338898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4291	NC_016884	TGGA	2	8	1342681	1342688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_016884	CCT	2	6	1345080	1345085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4294	NC_016884	AGG	2	6	1345130	1345135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4300	NC_016884	CGCT	2	8	1348685	1348692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4304	NC_016884	CATC	2	8	1350240	1350247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4305	NC_016884	TGG	2	6	1350271	1350276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4324	NC_016884	TTG	2	6	1356098	1356103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4333	NC_016884	GCGGG	2	10	1361495	1361504	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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4343	NC_016884	GAG	2	6	1364204	1364209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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