MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016863	CAA	2	6	4207524	4207529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_016863	GGTC	2	8	4207565	4207572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11503	NC_016863	CAG	2	6	4207617	4207622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_016863	CGC	3	9	4207673	4207681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_016863	ATC	2	6	4207714	4207719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_016863	TGC	2	6	4207753	4207758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_016863	CCAGC	2	10	4207761	4207770	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11508	NC_016863	ACG	2	6	4207781	4207786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_016863	CAT	2	6	4208036	4208041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_016863	CACG	2	8	4208057	4208064	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11511	NC_016863	CAG	2	6	4208121	4208126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_016863	AAG	2	6	4208146	4208151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_016863	GATC	2	8	4208219	4208226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_016863	GCG	2	6	4208296	4208301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_016863	CAC	2	6	4208313	4208318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11516	NC_016863	TGGT	2	8	4208350	4208357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_016863	GC	3	6	4208447	4208452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11518	NC_016863	GGT	2	6	4208514	4208519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_016863	CTTC	2	8	4208579	4208586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11520	NC_016863	CTT	2	6	4208612	4208617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_016863	TTG	2	6	4208628	4208633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_016863	GC	3	6	4208651	4208656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11523	NC_016863	GGC	2	6	4208675	4208680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_016863	CCA	2	6	4208699	4208704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11525	NC_016863	GC	3	6	4208726	4208731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_016863	GAT	2	6	4208744	4208749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_016863	GCA	2	6	4208873	4208878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_016863	GCC	3	9	4208929	4208937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11529	NC_016863	GTG	2	6	4208938	4208943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_016863	CTG	2	6	4208983	4208988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_016863	GTT	2	6	4209065	4209070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_016863	TCC	2	6	4209119	4209124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_016863	GAG	2	6	4209131	4209136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_016863	GT	5	10	4209161	4209170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_016863	AAAG	2	8	4209184	4209191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_016863	AT	4	8	4210054	4210061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_016863	CT	3	6	4210079	4210084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11538	NC_016863	CGAA	2	8	4210195	4210202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11539	NC_016863	A	6	6	4210201	4210206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016863	ATA	2	6	4211342	4211347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_016863	A	8	8	4211377	4211384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_016863	A	6	6	4211408	4211413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_016863	TATCAA	2	12	4211445	4211456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11544	NC_016863	TAT	2	6	4211522	4211527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_016863	T	6	6	4212695	4212700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_016863	TTC	2	6	4212711	4212716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_016863	AG	3	6	4212761	4212766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_016863	TTA	2	6	4212767	4212772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_016863	GGC	2	6	4212909	4212914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_016863	TCA	2	6	4212922	4212927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_016863	CGAA	2	8	4213962	4213969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_016863	TCGT	2	8	4214017	4214024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_016863	GGC	2	6	4214607	4214612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_016863	A	6	6	4214635	4214640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_016863	A	7	7	4216157	4216163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_016863	AGCGC	2	10	4217153	4217162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11557	NC_016863	CTT	2	6	4219975	4219980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_016863	A	6	6	4220001	4220006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_016863	ACCT	2	8	4220017	4220024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_016863	CAA	2	6	4220056	4220061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_016863	CTA	2	6	4220094	4220099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_016863	GTC	2	6	4220115	4220120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_016863	A	7	7	4220152	4220158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_016863	GC	3	6	4220169	4220174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11565	NC_016863	AGG	2	6	4220239	4220244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_016863	TCG	2	6	4221110	4221115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_016863	GGC	2	6	4221152	4221157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_016863	CGG	2	6	4221176	4221181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_016863	TGC	2	6	4221235	4221240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_016863	ATT	2	6	4223134	4223139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_016863	T	6	6	4223138	4223143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_016863	GCC	2	6	4223212	4223217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_016863	A	6	6	4223272	4223277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_016863	TCA	2	6	4223347	4223352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_016863	CAA	2	6	4223378	4223383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_016863	ATT	2	6	4223462	4223467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_016863	GTT	2	6	4223470	4223475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_016863	AT	3	6	4223497	4223502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_016863	TAAATA	2	12	4223526	4223537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_016863	GTT	2	6	4223559	4223564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_016863	TTTTA	2	10	4223579	4223588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_016863	ATTT	2	8	4223608	4223615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_016863	TTAAA	2	10	4223645	4223654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_016863	TAT	2	6	4223689	4223694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_016863	TTTTAA	2	12	4223723	4223734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_016863	TAT	2	6	4224438	4224443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_016863	T	8	8	4224479	4224486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_016863	TGA	2	6	4224493	4224498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_016863	ATT	2	6	4224509	4224514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_016863	CG	3	6	4224517	4224522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11591	NC_016863	TAA	2	6	4227415	4227420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_016863	CTT	2	6	4227457	4227462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_016863	AAAG	2	8	4227495	4227502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_016863	TCA	2	6	4227543	4227548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_016863	A	6	6	4227573	4227578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_016863	T	7	7	4227582	4227588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_016863	TTAA	2	8	4227655	4227662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_016863	AAT	2	6	4227711	4227716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_016863	GAT	2	6	4227720	4227725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_016863	A	6	6	4229530	4229535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_016863	TCA	2	6	4231663	4231668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_016863	GTT	2	6	4231693	4231698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_016863	TC	3	6	4231741	4231746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11604	NC_016863	ATG	2	6	4232330	4232335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_016863	T	8	8	4232342	4232349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_016863	TTA	2	6	4232370	4232375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_016863	TAC	2	6	4232401	4232406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_016863	AGA	2	6	4232411	4232416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_016863	GCCAG	2	10	4233352	4233361	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11610	NC_016863	CCTGA	2	10	4233391	4233400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11611	NC_016863	CAG	2	6	4233408	4233413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_016863	GC	3	6	4234489	4234494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_016863	GCC	2	6	4234558	4234563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11614	NC_016863	T	7	7	4234608	4234614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_016863	TCA	2	6	4234653	4234658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_016863	CAACA	2	10	4234659	4234668	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11617	NC_016863	TAT	2	6	4235696	4235701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_016863	T	6	6	4235711	4235716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_016863	GTTA	2	8	4236660	4236667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_016863	CT	3	6	4236670	4236675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11621	NC_016863	TGG	2	6	4236697	4236702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_016863	TA	3	6	4236709	4236714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_016863	CAT	2	6	4236740	4236745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_016863	TCA	2	6	4239101	4239106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_016863	CTG	2	6	4240181	4240186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_016863	CCA	2	6	4240958	4240963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11627	NC_016863	CCTG	2	8	4240977	4240984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11628	NC_016863	CGT	2	6	4240991	4240996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11630	NC_016863	TTC	2	6	4241758	4241763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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