MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016863	AAC	2	6	4042391	4042396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_016863	CGT	2	6	4042437	4042442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_016863	T	8	8	4042442	4042449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_016863	T	8	8	4042453	4042460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_016863	TAA	2	6	4043106	4043111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_016863	GGGC	2	8	4043157	4043164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_016863	AAGCG	2	10	4043165	4043174	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11008	NC_016863	AGA	2	6	4045191	4045196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_016863	TTTA	2	8	4045201	4045208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_016863	TTA	2	6	4045232	4045237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_016863	TAA	2	6	4045272	4045277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_016863	AAC	2	6	4045379	4045384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_016863	CCA	2	6	4045423	4045428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_016863	TCGC	2	8	4045910	4045917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_016863	A	6	6	4045985	4045990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_016863	ATT	2	6	4046497	4046502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_016863	ATT	2	6	4046542	4046547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_016863	TTG	2	6	4046564	4046569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_016863	A	7	7	4046599	4046605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_016863	CAC	2	6	4050600	4050605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_016863	T	6	6	4050709	4050714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_016863	CA	3	6	4050733	4050738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_016863	TCAT	2	8	4050755	4050762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_016863	GGC	2	6	4050777	4050782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_016863	AGG	2	6	4050846	4050851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_016863	ATG	2	6	4052886	4052891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_016863	A	7	7	4056842	4056848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_016863	TTC	2	6	4060953	4060958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_016863	TTA	2	6	4060976	4060981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_016863	TGA	2	6	4061057	4061062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_016863	A	6	6	4061062	4061067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_016863	ATT	2	6	4061082	4061087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_016863	CCA	2	6	4061131	4061136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11034	NC_016863	AAC	2	6	4061146	4061151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_016863	CA	3	6	4061154	4061159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_016863	GCC	2	6	4061161	4061166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11037	NC_016863	CGC	2	6	4061257	4061262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_016863	AAGCG	2	10	4061270	4061279	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11039	NC_016863	TG	3	6	4061311	4061316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_016863	GGC	2	6	4061465	4061470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_016863	AGC	2	6	4061505	4061510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_016863	TGC	2	6	4061512	4061517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_016863	ACT	2	6	4061579	4061584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_016863	TTG	2	6	4061677	4061682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_016863	CGA	2	6	4061705	4061710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_016863	GCA	2	6	4061779	4061784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_016863	GAA	2	6	4061838	4061843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_016863	GGA	2	6	4061874	4061879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_016863	TAA	2	6	4061892	4061897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_016863	GCA	2	6	4061900	4061905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_016863	AGA	2	6	4061921	4061926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_016863	CAG	2	6	4061947	4061952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_016863	G	6	6	4062094	4062099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_016863	GGA	2	6	4062138	4062143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_016863	GGC	2	6	4062158	4062163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_016863	GAA	2	6	4062401	4062406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_016863	AGA	2	6	4062430	4062435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_016863	TGC	2	6	4062477	4062482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_016863	GTC	2	6	4062489	4062494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_016863	TTG	2	6	4062550	4062555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_016863	GGA	2	6	4062602	4062607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_016863	TCA	2	6	4062627	4062632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_016863	AC	3	6	4062653	4062658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_016863	CGT	2	6	4062721	4062726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_016863	AC	3	6	4062822	4062827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_016863	GTAG	2	8	4062863	4062870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_016863	CCT	2	6	4062963	4062968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_016863	CA	3	6	4062998	4063003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11069	NC_016863	TGA	2	6	4063011	4063016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_016863	CGG	2	6	4063094	4063099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_016863	AAC	2	6	4063247	4063252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_016863	GTT	2	6	4063257	4063262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_016863	TC	3	6	4063269	4063274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11074	NC_016863	ACG	2	6	4063288	4063293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_016863	GAAA	2	8	4063301	4063308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_016863	GCG	2	6	4063569	4063574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_016863	GAG	2	6	4063585	4063590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_016863	TG	3	6	4063610	4063615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_016863	GC	3	6	4063637	4063642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11080	NC_016863	G	6	6	4063730	4063735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_016863	TCC	2	6	4063740	4063745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11082	NC_016863	CTGA	2	8	4063760	4063767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_016863	GTAC	2	8	4063844	4063851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11084	NC_016863	GGA	2	6	4064049	4064054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_016863	AC	3	6	4064267	4064272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11086	NC_016863	CGTC	2	8	4064285	4064292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_016863	AAC	2	6	4064304	4064309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_016863	AGC	2	6	4064394	4064399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_016863	CAT	2	6	4064400	4064405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_016863	AAAG	2	8	4064408	4064415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_016863	AGCGA	2	10	4064536	4064545	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11092	NC_016863	CGTT	2	8	4064585	4064592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11093	NC_016863	GT	3	6	4064624	4064629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_016863	G	6	6	4064829	4064834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_016863	GT	4	8	4064887	4064894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_016863	GAC	2	6	4064931	4064936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_016863	CAA	2	6	4064957	4064962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_016863	GGT	2	6	4065029	4065034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_016863	GA	3	6	4065059	4065064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_016863	AGTC	2	8	4065155	4065162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11101	NC_016863	GCTG	2	8	4065173	4065180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_016863	TTA	2	6	4065188	4065193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_016863	CGG	2	6	4065312	4065317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_016863	ATG	2	6	4065388	4065393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_016863	ACC	2	6	4065583	4065588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11106	NC_016863	TGG	2	6	4065643	4065648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_016863	TCC	2	6	4065669	4065674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11108	NC_016863	GGA	2	6	4065686	4065691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_016863	AGG	2	6	4065724	4065729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_016863	GGT	2	6	4065806	4065811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_016863	CGG	2	6	4065893	4065898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_016863	TCA	2	6	4065921	4065926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_016863	CGT	2	6	4066001	4066006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_016863	G	6	6	4066050	4066055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_016863	GAC	3	9	4066232	4066240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_016863	GT	3	6	4066254	4066259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_016863	GA	3	6	4066341	4066346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_016863	GGC	2	6	4066411	4066416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_016863	GGT	2	6	4066425	4066430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_016863	CCTG	2	8	4066605	4066612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_016863	CCGT	2	8	4066640	4066647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_016863	TC	3	6	4066722	4066727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11123	NC_016863	AAT	2	6	4066741	4066746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_016863	T	9	9	4066766	4066774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_016863	CTT	2	6	4066818	4066823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_016863	TCA	2	6	4066831	4066836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_016863	ATT	2	6	4067692	4067697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11129	NC_016863	T	7	7	4068153	4068159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11390	NC_016863	G	6	6	4162134	4162139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11391	NC_016863	GAC	3	9	4162316	4162324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11393	NC_016863	GA	3	6	4162425	4162430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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