MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016863	A	6	6	3816777	3816782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_016863	GAT	2	6	3816791	3816796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_016863	TA	3	6	3816848	3816853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_016863	A	7	7	3816890	3816896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_016863	CAT	2	6	3817941	3817946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_016863	CAT	2	6	3819377	3819382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_016863	GAAA	2	8	3819468	3819475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_016863	ATA	2	6	3821261	3821266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_016863	GGC	2	6	3825290	3825295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_016863	TCA	2	6	3825379	3825384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_016863	TGA	2	6	3825409	3825414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_016863	CCG	2	6	3825415	3825420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_016863	TGG	3	9	3825427	3825435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_016863	A	6	6	3825471	3825476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_016863	CGT	2	6	3825478	3825483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_016863	CGC	2	6	3825513	3825518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_016863	CGA	2	6	3825562	3825567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_016863	CAC	2	6	3825605	3825610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10519	NC_016863	TGA	2	6	3825652	3825657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_016863	CGAGTA	2	12	3825677	3825688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10521	NC_016863	ATT	2	6	3825705	3825710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_016863	CGG	2	6	3825751	3825756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_016863	GCC	2	6	3825798	3825803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_016863	GTG	2	6	3825822	3825827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_016863	GAG	2	6	3825831	3825836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_016863	GGC	2	6	3825984	3825989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_016863	TGA	2	6	3826033	3826038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_016863	ATT	2	6	3826983	3826988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_016863	T	7	7	3827053	3827059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_016863	GGC	2	6	3829165	3829170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_016863	AAGCG	2	10	3829237	3829246	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10533	NC_016863	AAT	2	6	3832102	3832107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_016863	ATTTA	2	10	3832126	3832135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_016863	TGG	2	6	3835397	3835402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_016863	AGG	2	6	3836155	3836160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_016863	CAA	2	6	3836264	3836269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_016863	GTT	2	6	3836336	3836341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_016863	T	7	7	3836340	3836346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_016863	CT	3	6	3836383	3836388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10541	NC_016863	CTACA	2	10	3836472	3836481	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10542	NC_016863	AAG	2	6	3836547	3836552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_016863	GGC	2	6	3838517	3838522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_016863	GAG	2	6	3838572	3838577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_016863	TCC	2	6	3840661	3840666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10546	NC_016863	TCTTT	2	10	3840782	3840791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10547	NC_016863	AAT	2	6	3840827	3840832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_016863	GAA	2	6	3840882	3840887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10550	NC_016863	GC	3	6	3840897	3840902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10551	NC_016863	TATC	2	8	3840914	3840921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10552	NC_016863	GGA	2	6	3841346	3841351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_016863	TA	3	6	3841408	3841413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_016863	T	7	7	3841495	3841501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_016863	ATC	2	6	3841559	3841564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_016863	A	8	8	3841569	3841576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_016863	CATA	2	8	3841582	3841589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10558	NC_016863	ATTATA	2	12	3841593	3841604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_016863	ATAA	2	8	3841634	3841641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_016863	GC	3	6	3841654	3841659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10561	NC_016863	CGA	2	6	3841671	3841676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10563	NC_016863	TATAT	2	10	3841764	3841773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_016863	ATT	2	6	3841776	3841781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_016863	ATT	2	6	3842496	3842501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_016863	TCAT	2	8	3842519	3842526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10568	NC_016863	ATTAA	2	10	3847040	3847049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_016863	AATA	2	8	3847068	3847075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_016863	TGT	2	6	3847093	3847098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10577	NC_016863	TAT	2	6	3852579	3852584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10579	NC_016863	TAA	3	9	3852701	3852709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10585	NC_016863	T	7	7	3858109	3858115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_016863	A	8	8	3858728	3858735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_016863	CTTT	2	8	3858773	3858780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10591	NC_016863	TCT	2	6	3858783	3858788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_016863	GTA	2	6	3858812	3858817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10597	NC_016863	A	6	6	3863897	3863902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_016863	CCAT	2	8	3864021	3864028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10599	NC_016863	ACTC	2	8	3864126	3864133	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10600	NC_016863	GCC	2	6	3864138	3864143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10602	NC_016863	TA	3	6	3864169	3864174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_016863	TCA	2	6	3866481	3866486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10608	NC_016863	A	8	8	3872052	3872059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_016863	AAT	2	6	3872084	3872089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_016863	TAAA	2	8	3872944	3872951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_016863	TC	3	6	3872986	3872991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10612	NC_016863	GCA	2	6	3873009	3873014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_016863	AGTC	2	8	3873021	3873028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10614	NC_016863	TTAAA	2	10	3873035	3873044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_016863	AGGG	2	8	3873773	3873780	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_016863	ATT	2	6	3877235	3877240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10619	NC_016863	A	6	6	3880267	3880272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_016863	CTT	2	6	3880347	3880352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_016863	GCA	2	6	3880355	3880360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10623	NC_016863	T	7	7	3880392	3880398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_016863	ATA	2	6	3880417	3880422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_016863	GGC	2	6	3880472	3880477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_016863	AAT	2	6	3880508	3880513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_016863	TG	3	6	3883250	3883255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_016863	A	6	6	3883290	3883295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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