MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016863	TCA	2	6	3590573	3590578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_016863	CT	3	6	3590591	3590596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_016863	ATTA	2	8	3590623	3590630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_016863	TA	3	6	3596540	3596545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_016863	TAA	2	6	3596550	3596555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_016863	TCC	2	6	3596559	3596564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_016863	CT	3	6	3596601	3596606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_016863	TTG	2	6	3597139	3597144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_016863	TAA	2	6	3597197	3597202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_016863	TTA	3	9	3597274	3597282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_016863	GAT	2	6	3597341	3597346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_016863	TATT	2	8	3597386	3597393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_016863	CCA	2	6	3597394	3597399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_016863	CAA	2	6	3597416	3597421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_016863	A	7	7	3597624	3597630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_016863	T	7	7	3597646	3597652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016863	ACTA	2	8	3601031	3601038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10018	NC_016863	A	6	6	3602538	3602543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_016863	TTG	2	6	3602576	3602581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016863	TAC	2	6	3604257	3604262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_016863	GCA	2	6	3604307	3604312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_016863	TTG	2	6	3604412	3604417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_016863	AAC	2	6	3604453	3604458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_016863	ATC	2	6	3604548	3604553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_016863	GGCAA	2	10	3604572	3604581	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10026	NC_016863	T	6	6	3604698	3604703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_016863	TAC	2	6	3608097	3608102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_016863	CG	3	6	3608103	3608108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_016863	A	6	6	3610708	3610713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_016863	T	6	6	3610728	3610733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_016863	CGC	2	6	3610791	3610796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_016863	TTTA	2	8	3611438	3611445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_016863	TAA	2	6	3611459	3611464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_016863	AATT	2	8	3611466	3611473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_016863	TGG	2	6	3611537	3611542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_016863	GCC	2	6	3613824	3613829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_016863	AG	3	6	3614977	3614982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_016863	ACA	2	6	3615882	3615887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_016863	GCC	2	6	3615957	3615962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_016863	ATG	2	6	3617700	3617705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_016863	ATT	2	6	3617716	3617721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_016863	CGT	2	6	3617744	3617749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_016863	A	7	7	3617764	3617770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_016863	AG	3	6	3617774	3617779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016863	CAA	2	6	3617893	3617898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_016863	ATA	2	6	3617915	3617920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_016863	CCG	2	6	3617922	3617927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_016863	AACC	2	8	3618007	3618014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_016863	A	6	6	3618017	3618022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_016863	AT	4	8	3618040	3618047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016863	GGC	2	6	3619700	3619705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_016863	GAA	2	6	3619731	3619736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016863	AGGG	2	8	3619737	3619744	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016863	CAA	2	6	3621851	3621856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_016863	GT	3	6	3621863	3621868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_016863	A	6	6	3621875	3621880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016863	CAG	2	6	3621947	3621952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_016863	ATT	2	6	3621981	3621986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016863	AAG	2	6	3622531	3622536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_016863	TGGC	2	8	3622556	3622563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10061	NC_016863	GCCA	2	8	3622570	3622577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10062	NC_016863	CTT	2	6	3624981	3624986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_016863	CTTT	2	8	3625019	3625026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_016863	T	6	6	3625024	3625029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016863	TTAA	2	8	3625063	3625070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_016863	ATTA	2	8	3625092	3625099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_016863	TTA	2	6	3625105	3625110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_016863	TTAA	2	8	3625123	3625130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_016863	AAAT	2	8	3625180	3625187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_016863	TGT	2	6	3625283	3625288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_016863	ATT	2	6	3625291	3625296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_016863	GCC	2	6	3625333	3625338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_016863	C	6	6	3625337	3625342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10074	NC_016863	A	6	6	3627965	3627970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_016863	TCG	2	6	3628210	3628215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10077	NC_016863	GAT	2	6	3630889	3630894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_016863	TAT	2	6	3630900	3630905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_016863	CGC	2	6	3631598	3631603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_016863	CTT	3	9	3631641	3631649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_016863	TGCC	2	8	3631688	3631695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_016863	AAC	2	6	3631829	3631834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_016863	GTC	2	6	3631843	3631848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_016863	GGC	2	6	3633214	3633219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10086	NC_016863	GCGCT	2	10	3633265	3633274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10087	NC_016863	ATA	2	6	3633298	3633303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_016863	TAA	2	6	3637828	3637833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_016863	AAC	2	6	3637834	3637839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_016863	TCC	3	9	3637874	3637882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_016863	AGGG	2	8	3637894	3637901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_016863	AGG	2	6	3637902	3637907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_016863	CGC	2	6	3637934	3637939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_016863	CAG	2	6	3638088	3638093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_016863	TAAT	2	8	3638116	3638123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_016863	GAT	2	6	3638157	3638162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_016863	ATT	2	6	3638172	3638177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_016863	T	6	6	3638239	3638244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_016863	ATTA	2	8	3638341	3638348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_016863	A	8	8	3638357	3638364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_016863	C	6	6	3638373	3638378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10102	NC_016863	AGTGA	2	10	3638388	3638397	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_016863	GT	3	6	3641129	3641134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_016863	AC	3	6	3641788	3641793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_016863	CAA	2	6	3644182	3644187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_016863	CCA	2	6	3644320	3644325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_016863	GAT	2	6	3644367	3644372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_016863	CGCGC	2	10	3644407	3644416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10109	NC_016863	CCATG	2	10	3646006	3646015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10110	NC_016863	ATT	2	6	3646045	3646050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_016863	T	6	6	3646049	3646054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_016863	ATTT	2	8	3646075	3646082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_016863	GAAA	2	8	3646098	3646105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_016863	AACC	2	8	3648526	3648533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_016863	AGA	2	6	3649459	3649464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_016863	TA	4	8	3649468	3649475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_016863	TCG	2	6	3649482	3649487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_016863	ATT	2	6	3649848	3649853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_016863	T	6	6	3649944	3649949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_016863	TAT	2	6	3649978	3649983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_016863	GCA	2	6	3650028	3650033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_016863	CAGA	2	8	3653746	3653753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10123	NC_016863	T	6	6	3653775	3653780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_016863	CCTT	2	8	3655135	3655142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_016863	CAG	2	6	3655197	3655202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_016863	CTT	2	6	3659256	3659261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_016863	AATT	2	8	3660047	3660054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_016863	CAG	2	6	3660132	3660137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_016863	C	6	6	3660153	3660158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10131	NC_016863	T	6	6	3665421	3665426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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