MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016863	GTTG	2	8	3232147	3232154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_016863	AAT	2	6	3233304	3233309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_016863	AT	4	8	3233334	3233341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_016863	AG	3	6	3233347	3233352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_016863	T	6	6	3233355	3233360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_016863	A	6	6	3233384	3233389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_016863	CTG	2	6	3235267	3235272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_016863	AGTT	2	8	3235304	3235311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_016863	TGC	2	6	3235371	3235376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_016863	AAT	2	6	3235392	3235397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_016863	ACA	2	6	3236855	3236860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_016863	TTTGC	2	10	3238035	3238044	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9013	NC_016863	A	7	7	3238082	3238088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_016863	CT	3	6	3238207	3238212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9015	NC_016863	TCTG	2	8	3238223	3238230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9016	NC_016863	GCC	2	6	3238327	3238332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9017	NC_016863	GGC	2	6	3238391	3238396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_016863	GTG	2	6	3238412	3238417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_016863	GAGTA	2	10	3240786	3240795	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_016863	TGT	2	6	3240900	3240905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_016863	A	7	7	3240950	3240956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_016863	GAAA	2	8	3240958	3240965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_016863	GGC	2	6	3241081	3241086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_016863	ATA	2	6	3241150	3241155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_016863	AAC	2	6	3241910	3241915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_016863	GTG	2	6	3241919	3241924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_016863	GAA	2	6	3241951	3241956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9030	NC_016863	ATT	2	6	3242156	3242161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_016863	ATA	2	6	3242205	3242210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_016863	TAA	2	6	3244574	3244579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9034	NC_016863	TTC	2	6	3245467	3245472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_016863	AT	3	6	3245475	3245480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_016863	AAT	2	6	3246415	3246420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_016863	AAT	2	6	3246437	3246442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_016863	TGT	2	6	3248209	3248214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_016863	GCG	2	6	3248221	3248226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_016863	GTC	2	6	3249658	3249663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_016863	A	7	7	3249731	3249737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_016863	TAA	2	6	3249744	3249749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_016863	ATT	2	6	3249756	3249761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_016863	T	6	6	3249760	3249765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_016863	ATTT	2	8	3249796	3249803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_016863	A	6	6	3249816	3249821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_016863	ATT	2	6	3249840	3249845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_016863	AT	3	6	3250678	3250683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_016863	CT	3	6	3250700	3250705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_016863	TAT	2	6	3252783	3252788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_016863	ACA	2	6	3252790	3252795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_016863	TTAT	2	8	3252821	3252828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_016863	GGCA	2	8	3252829	3252836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9054	NC_016863	TCA	2	6	3254679	3254684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_016863	GAA	2	6	3254739	3254744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_016863	ATG	2	6	3256324	3256329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_016863	TCGC	2	8	3256380	3256387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9058	NC_016863	T	7	7	3256392	3256398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_016863	GCCCG	2	10	3256420	3256429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9060	NC_016863	TTCC	2	8	3256433	3256440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_016863	TTG	2	6	3257325	3257330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_016863	CAG	2	6	3257345	3257350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_016863	CGG	2	6	3257363	3257368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_016863	TTA	2	6	3257385	3257390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_016863	A	6	6	3257405	3257410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_016863	TGA	2	6	3257465	3257470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_016863	CT	3	6	3257548	3257553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_016863	CGT	2	6	3257605	3257610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_016863	AAT	3	9	3257633	3257641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9071	NC_016863	A	6	6	3257653	3257658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_016863	TAA	2	6	3257698	3257703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_016863	A	7	7	3257702	3257708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9075	NC_016863	ATTTT	2	10	3257788	3257797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9078	NC_016863	A	6	6	3257865	3257870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_016863	A	6	6	3257907	3257912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_016863	T	6	6	3259967	3259972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_016863	AT	3	6	3259988	3259993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_016863	TTTA	2	8	3260020	3260027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_016863	GAT	2	6	3260046	3260051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9086	NC_016863	AAT	2	6	3260130	3260135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_016863	A	6	6	3261594	3261599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_016863	CAAT	2	8	3261660	3261667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9089	NC_016863	GGC	2	6	3261696	3261701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9091	NC_016863	AAAT	2	8	3261795	3261802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_016863	ATG	2	6	3261821	3261826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9094	NC_016863	AAG	2	6	3261966	3261971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_016863	AG	3	6	3266232	3266237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_016863	GCC	2	6	3266279	3266284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9097	NC_016863	AAAC	2	8	3266347	3266354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9098	NC_016863	TCT	2	6	3266362	3266367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_016863	T	7	7	3266377	3266383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9102	NC_016863	TTA	2	6	3267546	3267551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_016863	TAT	2	6	3267585	3267590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_016863	CCA	2	6	3267666	3267671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9105	NC_016863	AAT	2	6	3267678	3267683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_016863	CAA	2	6	3267700	3267705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_016863	ATG	2	6	3267720	3267725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_016863	TCGCT	2	10	3267730	3267739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9109	NC_016863	ATT	2	6	3267752	3267757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_016863	AAT	2	6	3267770	3267775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_016863	AAT	3	9	3267781	3267789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_016863	AAT	2	6	3267901	3267906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_016863	TCA	2	6	3267918	3267923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_016863	AT	3	6	3267924	3267929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_016863	AAT	2	6	3268081	3268086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_016863	ATT	2	6	3268094	3268099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9122	NC_016863	GTA	2	6	3271171	3271176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9124	NC_016863	CTG	2	6	3271202	3271207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_016863	CGCTT	2	10	3271209	3271218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9126	NC_016863	AT	3	6	3273002	3273007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_016863	TA	3	6	3273015	3273020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_016863	ATA	2	6	3273037	3273042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_016863	ACC	2	6	3273312	3273317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9130	NC_016863	GAA	2	6	3279669	3279674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_016863	T	7	7	3279706	3279712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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