MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016863	TAA	2	6	2579613	2579618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_016863	A	6	6	2579678	2579683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_016863	AGA	2	6	2579703	2579708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_016863	GA	3	6	2579707	2579712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_016863	TTG	2	6	2582005	2582010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_016863	ACG	2	6	2582107	2582112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_016863	AC	3	6	2582234	2582239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_016863	ACTTT	2	10	2582249	2582258	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7009	NC_016863	CTG	2	6	2585547	2585552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_016863	AAC	2	6	2585654	2585659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_016863	AAC	2	6	2586716	2586721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_016863	AAC	2	6	2586733	2586738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_016863	GC	3	6	2586762	2586767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_016863	T	6	6	2586802	2586807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_016863	AT	3	6	2586818	2586823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016863	CTG	2	6	2587465	2587470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_016863	ATC	2	6	2587607	2587612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_016863	GC	3	6	2588968	2588973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_016863	GTA	2	6	2588992	2588997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016863	GCC	2	6	2589031	2589036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_016863	GCG	2	6	2589041	2589046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_016863	AAG	2	6	2589126	2589131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_016863	CTTC	2	8	2589149	2589156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7024	NC_016863	TCA	2	6	2589191	2589196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_016863	T	6	6	2589304	2589309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_016863	TTA	2	6	2591372	2591377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_016863	ATTT	2	8	2591453	2591460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_016863	A	6	6	2596540	2596545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_016863	ATTT	2	8	2596605	2596612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_016863	ATA	2	6	2596665	2596670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_016863	CT	3	6	2596673	2596678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_016863	TAT	3	9	2596679	2596687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_016863	AG	3	6	2596713	2596718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_016863	TTG	2	6	2596735	2596740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_016863	CTA	2	6	2596839	2596844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_016863	A	6	6	2596862	2596867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_016863	ATT	2	6	2596944	2596949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_016863	CAA	2	6	2596960	2596965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_016863	ATTG	2	8	2596972	2596979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_016863	ATAA	2	8	2596994	2597001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_016863	TTA	2	6	2597018	2597023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_016863	ATT	2	6	2597044	2597049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_016863	TC	3	6	2601730	2601735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_016863	GAT	2	6	2601747	2601752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7046	NC_016863	C	6	6	2601829	2601834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7047	NC_016863	A	6	6	2602704	2602709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_016863	AAGC	2	8	2604721	2604728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_016863	CAG	2	6	2606277	2606282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7051	NC_016863	TCA	2	6	2606368	2606373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_016863	GGC	2	6	2606388	2606393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_016863	ATG	2	6	2606402	2606407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_016863	A	6	6	2607568	2607573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016863	TCA	2	6	2607624	2607629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7058	NC_016863	TTA	2	6	2609187	2609192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_016863	CGC	2	6	2609587	2609592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_016863	GCA	2	6	2610377	2610382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_016863	GT	3	6	2611706	2611711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_016863	A	8	8	2611733	2611740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_016863	ATT	2	6	2611765	2611770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_016863	A	8	8	2612439	2612446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_016863	CT	3	6	2612469	2612474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_016863	TCAC	2	8	2612542	2612549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7067	NC_016863	AAC	2	6	2612572	2612577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_016863	CTTTT	2	10	2612651	2612660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7069	NC_016863	T	6	6	2612657	2612662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_016863	AGC	2	6	2612682	2612687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_016863	A	8	8	2612702	2612709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_016863	A	6	6	2612796	2612801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_016863	GGC	2	6	2614530	2614535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_016863	CCTT	2	8	2614564	2614571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_016863	GTA	2	6	2614676	2614681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7077	NC_016863	GTCT	2	8	2618322	2618329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7080	NC_016863	ACAG	2	8	2620583	2620590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7081	NC_016863	TGA	3	9	2620612	2620620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_016863	AAG	2	6	2621180	2621185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_016863	AAT	2	6	2621554	2621559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_016863	TCGTT	2	10	2621565	2621574	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7085	NC_016863	ATAA	2	8	2622471	2622478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_016863	AGGA	2	8	2622534	2622541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_016863	TAAA	2	8	2624159	2624166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_016863	GAA	2	6	2624189	2624194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_016863	TAA	2	6	2625687	2625692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_016863	TAA	2	6	2633504	2633509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_016863	ATA	2	6	2633581	2633586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_016863	AT	3	6	2633633	2633638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_016863	ATT	2	6	2633651	2633656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_016863	TAA	2	6	2633734	2633739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_016863	TAA	2	6	2633763	2633768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_016863	AT	3	6	2633773	2633778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_016863	AAAT	3	12	2633781	2633792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_016863	TGC	2	6	2633871	2633876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7103	NC_016863	TCGC	2	8	2633926	2633933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_016863	GCC	2	6	2633936	2633941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_016863	ATT	2	6	2633956	2633961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_016863	TA	3	6	2633967	2633972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_016863	AC	3	6	2634016	2634021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_016863	GGT	2	6	2634033	2634038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_016863	AATG	2	8	2634068	2634075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016863	ATT	2	6	2634120	2634125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_016863	ATA	2	6	2634140	2634145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_016863	CACG	2	8	2634154	2634161	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_016863	CGC	2	6	2634225	2634230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_016863	GCC	2	6	2634238	2634243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_016863	TTA	2	6	2634329	2634334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_016863	TGCA	2	8	2634424	2634431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7117	NC_016863	AAC	2	6	2634539	2634544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_016863	TATCCG	2	12	2634549	2634560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_016863	GGT	3	9	2634721	2634729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_016863	TGGC	2	8	2634737	2634744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7121	NC_016863	GCT	2	6	2634886	2634891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_016863	CCG	2	6	2634939	2634944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7123	NC_016863	AC	3	6	2635018	2635023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7124	NC_016863	CCG	2	6	2635064	2635069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_016863	CCG	2	6	2635116	2635121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_016863	CCA	2	6	2635123	2635128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7127	NC_016863	CCG	2	6	2635332	2635337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_016863	CAG	2	6	2635339	2635344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_016863	TCG	2	6	2635475	2635480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_016863	ATC	2	6	2635519	2635524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7132	NC_016863	CCCG	2	8	2635678	2635685	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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7261	NC_016863	GC	3	6	2641106	2641111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7263	NC_016863	CGG	2	6	2641131	2641136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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