MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016863	CGC	2	6	2343522	2343527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_016863	AAT	2	6	2343535	2343540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_016863	TGTT	2	8	2343592	2343599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_016863	T	8	8	2343607	2343614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_016863	ATT	2	6	2343626	2343631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_016863	CTT	2	6	2343633	2343638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_016863	GCG	3	9	2344560	2344568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_016863	TGA	2	6	2344589	2344594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_016863	GGC	2	6	2344598	2344603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_016863	GCC	2	6	2344605	2344610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_016863	CGC	2	6	2344631	2344636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_016863	GCTG	2	8	2344637	2344644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_016863	GCT	2	6	2344679	2344684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_016863	TGC	2	6	2344694	2344699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_016863	T	7	7	2344752	2344758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_016863	GCA	2	6	2344977	2344982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_016863	ATA	2	6	2344983	2344988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_016863	GGTAA	2	10	2344998	2345007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_016863	ATTA	2	8	2345109	2345116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_016863	CAGC	2	8	2345123	2345130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6521	NC_016863	CCA	3	9	2345719	2345727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_016863	CGC	2	6	2345862	2345867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_016863	GTT	2	6	2345872	2345877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016863	ATTTA	2	10	2345999	2346008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016863	TAA	2	6	2346057	2346062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016863	ATAA	2	8	2346067	2346074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016863	AAT	2	6	2346085	2346090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_016863	TAA	2	6	2346095	2346100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_016863	TAA	2	6	2346127	2346132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016863	GCA	2	6	2346180	2346185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_016863	A	6	6	2346221	2346226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016863	TC	3	6	2346267	2346272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_016863	GTT	2	6	2346280	2346285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_016863	TAC	2	6	2346331	2346336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_016863	AAT	2	6	2346413	2346418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_016863	TAA	2	6	2346424	2346429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_016863	GCGCC	2	10	2347111	2347120	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6538	NC_016863	GTC	2	6	2352084	2352089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_016863	CCT	2	6	2352096	2352101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_016863	TCA	2	6	2353414	2353419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_016863	TTG	2	6	2354543	2354548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_016863	AGT	2	6	2359459	2359464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_016863	TA	3	6	2359595	2359600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_016863	TA	3	6	2359607	2359612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_016863	TA	3	6	2359671	2359676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_016863	TAA	2	6	2359694	2359699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_016863	ATA	2	6	2359732	2359737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_016863	TGT	2	6	2359752	2359757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_016863	CAG	2	6	2359774	2359779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_016863	GCA	2	6	2360398	2360403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_016863	A	6	6	2360403	2360408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_016863	TGG	2	6	2360421	2360426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_016863	ATA	2	6	2362168	2362173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_016863	TAAC	2	8	2362187	2362194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_016863	AAT	3	9	2362209	2362217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_016863	TGCT	2	8	2363962	2363969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_016863	GT	3	6	2363978	2363983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_016863	CGT	2	6	2365117	2365122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_016863	A	6	6	2365147	2365152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_016863	TTA	2	6	2366326	2366331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_016863	T	6	6	2366357	2366362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016863	AAT	2	6	2366428	2366433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_016863	T	6	6	2366514	2366519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_016863	AT	3	6	2366559	2366564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_016863	TGA	2	6	2366596	2366601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_016863	ATC	2	6	2366661	2366666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_016863	TTTA	2	8	2366673	2366680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_016863	T	8	8	2366743	2366750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_016863	AC	3	6	2366763	2366768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_016863	AAT	2	6	2366851	2366856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_016863	AGT	2	6	2366886	2366891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_016863	TCCCG	2	10	2366930	2366939	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6573	NC_016863	ATTC	2	8	2366988	2366995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6574	NC_016863	CCTTCA	2	12	2367013	2367024	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_016863	CGC	2	6	2370473	2370478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_016863	CT	3	6	2376208	2376213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_016863	ATT	2	6	2376449	2376454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_016863	ATC	2	6	2380823	2380828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_016863	GAA	2	6	2380851	2380856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_016863	T	9	9	2380880	2380888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_016863	TTG	2	6	2380894	2380899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_016863	CTA	2	6	2380999	2381004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_016863	TA	4	8	2381045	2381052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_016863	G	6	6	2381098	2381103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_016863	TTTC	2	8	2381109	2381116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6586	NC_016863	GCC	2	6	2383504	2383509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_016863	GCTCA	2	10	2386156	2386165	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6588	NC_016863	AAC	2	6	2387160	2387165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_016863	TTTA	2	8	2389732	2389739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_016863	GTTC	2	8	2389755	2389762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6591	NC_016863	AAC	2	6	2389764	2389769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_016863	GCT	2	6	2389773	2389778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_016863	A	6	6	2389956	2389961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_016863	ATT	2	6	2394153	2394158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_016863	ACG	2	6	2394244	2394249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_016863	AAT	3	9	2394328	2394336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_016863	AAT	2	6	2394350	2394355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_016863	AT	3	6	2394383	2394388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_016863	TAA	3	9	2394396	2394404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_016863	TACAT	2	10	2394423	2394432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6601	NC_016863	AT	3	6	2394475	2394480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_016863	TA	3	6	2394526	2394531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_016863	AGA	2	6	2394533	2394538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_016863	ATG	2	6	2395537	2395542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_016863	GAA	2	6	2395549	2395554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_016863	TA	3	6	2395563	2395568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_016863	AGGCC	2	10	2395578	2395587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6608	NC_016863	A	6	6	2400010	2400015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_016863	A	6	6	2400124	2400129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_016863	GAT	2	6	2400133	2400138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_016863	ATG	2	6	2401424	2401429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_016863	AGA	2	6	2401466	2401471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_016863	AGG	2	6	2401483	2401488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_016863	CGA	2	6	2401498	2401503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_016863	TAC	2	6	2402181	2402186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_016863	CAT	2	6	2402200	2402205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_016863	CAA	2	6	2402233	2402238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_016863	A	6	6	2402246	2402251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_016863	TGG	2	6	2402320	2402325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_016863	GAC	2	6	2402769	2402774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_016863	GCAT	2	8	2403520	2403527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6622	NC_016863	AAAGC	2	10	2403550	2403559	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6623	NC_016863	TTAAT	2	10	2403608	2403617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_016863	A	6	6	2403649	2403654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_016863	GT	3	6	2414603	2414608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_016863	ATCA	2	8	2417055	2417062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6627	NC_016863	ATT	2	6	2417095	2417100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_016863	CCCT	2	8	2418428	2418435	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6629	NC_016863	A	6	6	2418470	2418475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_016863	AGGG	2	8	2418490	2418497	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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6632	NC_016863	TGT	2	6	2419357	2419362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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