MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 13251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016863	CCG	2	6	1814344	1814349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_016863	GA	3	6	1814369	1814374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016863	TG	3	6	1821049	1821054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016863	CT	3	6	1821066	1821071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_016863	GC	3	6	1821163	1821168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_016863	CCT	2	6	1821172	1821177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_016863	GAG	3	9	1821192	1821200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016863	TA	4	8	1821208	1821215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016863	AAATT	2	10	1821235	1821244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016863	CAA	2	6	1821271	1821276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_016863	TC	3	6	1821340	1821345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_016863	TGT	2	6	1821362	1821367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016863	A	8	8	1821382	1821389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016863	CGC	2	6	1821401	1821406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_016863	TTGAT	2	10	1822838	1822847	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016863	GTC	2	6	1822903	1822908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_016863	TTA	2	6	1822930	1822935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016863	A	6	6	1822961	1822966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016863	TGTC	2	8	1822989	1822996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_016863	CT	3	6	1823019	1823024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_016863	T	6	6	1823114	1823119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016863	T	6	6	1823126	1823131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016863	GAA	2	6	1823147	1823152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016863	T	6	6	1827095	1827100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016863	TTA	2	6	1827915	1827920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016863	GAG	2	6	1827929	1827934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016863	GAAA	2	8	1828011	1828018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016863	A	7	7	1828016	1828022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016863	A	6	6	1828046	1828051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016863	A	7	7	1828057	1828063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016863	CTT	2	6	1828086	1828091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_016863	A	6	6	1829238	1829243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016863	A	6	6	1833314	1833319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016863	GTGTG	2	10	1833320	1833329	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5037	NC_016863	CAT	2	6	1834635	1834640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_016863	AG	4	8	1834664	1834671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016863	TGA	2	6	1834707	1834712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5043	NC_016863	AT	3	6	1836422	1836427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016863	TGAA	2	8	1836475	1836482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_016863	CCT	2	6	1837658	1837663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5052	NC_016863	ATT	2	6	1837722	1837727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_016863	ATT	2	6	1839901	1839906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5061	NC_016863	TGT	2	6	1841799	1841804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_016863	T	6	6	1841871	1841876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016863	ATA	2	6	1841882	1841887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016863	TTCTT	2	10	1841937	1841946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5067	NC_016863	TA	3	6	1843275	1843280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_016863	CTGC	2	8	1852339	1852346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_016863	A	6	6	1852372	1852377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5095	NC_016863	ATA	2	6	1858653	1858658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_016863	GGA	2	6	1863078	1863083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016863	T	6	6	1863116	1863121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016863	AGG	2	6	1863144	1863149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_016863	CAA	2	6	1863172	1863177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5110	NC_016863	TCG	2	6	1865637	1865642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_016863	CGCT	2	8	1865643	1865650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_016863	CT	3	6	1865652	1865657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_016863	ATT	2	6	1867315	1867320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016863	GAATT	2	10	1867343	1867352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016863	ATT	2	6	1867389	1867394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_016863	AC	3	6	1867927	1867932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_016863	T	8	8	1867948	1867955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016863	GTT	2	6	1867965	1867970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_016863	CAC	2	6	1868391	1868396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_016863	GCG	2	6	1868400	1868405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_016863	TCC	2	6	1868626	1868631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_016863	GTC	2	6	1868668	1868673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_016863	A	6	6	1868757	1868762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016863	GGTT	2	8	1868790	1868797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016863	TTA	2	6	1868971	1868976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_016863	GGTT	2	8	1869078	1869085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_016863	CGC	2	6	1869143	1869148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5264	NC_016863	GTATT	2	10	1911590	1911599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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