MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 12767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016860	GTT	2	6	629401	629406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016860	GGC	2	6	634067	634072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016860	GCC	2	6	634085	634090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_016860	GCT	2	6	635703	635708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016860	TGCG	2	8	635755	635762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_016860	CGA	2	6	635780	635785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016860	AG	3	6	637027	637032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016860	TGC	2	6	637111	637116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016860	AAT	2	6	637127	637132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016860	ATT	2	6	637148	637153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016860	CA	3	6	637157	637162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_016860	GAT	2	6	640465	640470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016860	AG	3	6	641617	641622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016860	GC	3	6	641764	641769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_016860	TCA	2	6	641794	641799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016860	TCG	2	6	641825	641830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_016860	GGC	2	6	641843	641848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016860	CTT	2	6	641884	641889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016860	T	6	6	641937	641942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016860	TTA	2	6	641962	641967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016860	ATTA	2	8	641995	642002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016860	TAAT	2	8	642036	642043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016860	ATCT	2	8	642051	642058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_016860	ATA	2	6	642099	642104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016860	GT	4	8	642138	642145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016860	AGGGA	2	10	642737	642746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016860	GAT	2	6	642794	642799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016860	GGCGC	2	10	642807	642816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1529	NC_016860	T	6	6	643363	643368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016860	AG	3	6	644067	644072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016860	TAA	2	6	648974	648979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016860	AC	3	6	649018	649023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_016860	CA	3	6	649024	649029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_016860	AAT	2	6	649037	649042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016860	TAA	2	6	649086	649091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016860	CAA	2	6	649116	649121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016860	A	6	6	649120	649125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016860	GTG	2	6	649249	649254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016860	AGT	2	6	649282	649287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016860	TGT	2	6	649294	649299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016860	ATA	2	6	649314	649319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016860	TAA	2	6	649350	649355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016860	GAG	2	6	649390	649395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016860	A	7	7	649415	649421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016860	A	6	6	649508	649513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016860	CTC	2	6	650595	650600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_016860	ATG	2	6	650610	650615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016860	AT	3	6	650621	650626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016860	CAT	2	6	650660	650665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016860	A	7	7	650678	650684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016860	ATT	2	6	650707	650712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016860	A	7	7	651350	651356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016860	TGAT	2	8	651400	651407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016860	GGC	2	6	651420	651425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016860	CTTCA	2	10	651591	651600	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1556	NC_016860	GC	3	6	651674	651679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_016860	CTT	2	6	651703	651708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_016860	TCC	2	6	651713	651718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_016860	CAT	2	6	651747	651752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_016860	GTC	2	6	651763	651768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_016860	CAC	2	6	651826	651831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_016860	TGA	2	6	651858	651863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016860	GCTC	2	8	651895	651902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_016860	TC	3	6	651969	651974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_016860	ACG	2	6	652058	652063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_016860	TCAT	2	8	652172	652179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_016860	T	8	8	652211	652218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016860	CT	3	6	652471	652476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_016860	TGG	2	6	652619	652624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016860	CGC	2	6	652802	652807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_016860	TGG	2	6	652819	652824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016860	ATTA	2	8	652833	652840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016860	AAT	2	6	655841	655846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016860	TTA	2	6	655879	655884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016860	GTT	2	6	655892	655897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016860	AGT	2	6	655926	655931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016860	AC	3	6	655948	655953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_016860	GTA	2	6	656015	656020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016860	TTG	2	6	656031	656036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016860	GC	3	6	656096	656101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_016860	GCG	3	9	656141	656149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016860	CTC	2	6	656219	656224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_016860	ATT	2	6	656255	656260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016860	A	7	7	656468	656474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016860	TAA	2	6	656526	656531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016860	ATA	2	6	656537	656542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016860	GTT	2	6	656548	656553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016860	ATT	2	6	656592	656597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016860	CAG	2	6	656986	656991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_016860	GCG	2	6	657271	657276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_016860	ATTT	2	8	658176	658183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016860	ACC	2	6	658262	658267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_016860	A	6	6	658285	658290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016860	T	6	6	658315	658320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016860	TTAT	2	8	658325	658332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016860	ATAA	2	8	659704	659711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016860	T	8	8	659733	659740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016860	GAAA	2	8	659787	659794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016860	TAT	2	6	659816	659821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016860	TCG	2	6	660696	660701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_016860	TGA	2	6	660731	660736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016860	ATG	2	6	660737	660742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016860	A	6	6	661993	661998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016860	GC	3	6	662092	662097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_016860	CTTTT	2	10	662101	662110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1606	NC_016860	T	7	7	662127	662133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016860	TAACGT	2	12	662140	662151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1608	NC_016860	T	6	6	663642	663647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016860	TC	3	6	664932	664937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_016860	CAG	2	6	664947	664952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016860	ATG	2	6	664956	664961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016860	CTG	2	6	664963	664968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_016860	CGT	2	6	665081	665086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_016860	CAA	2	6	665129	665134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016860	TGAA	2	8	665135	665142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016860	T	6	6	665145	665150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016860	CGT	2	6	665203	665208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016860	CAA	2	6	665215	665220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016860	AGGG	2	8	667220	667227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016860	CGTT	2	8	667235	667242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_016860	AGTA	2	8	667286	667293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016860	CGT	2	6	667322	667327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_016860	AGA	2	6	670146	670151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016860	GCC	2	6	670214	670219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_016860	TCC	2	6	671246	671251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_016860	ATA	2	6	671264	671269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016860	TAA	2	6	671278	671283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016860	TTAT	2	8	674941	674948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016860	A	6	6	675039	675044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016860	TGGT	2	8	675744	675751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016860	CAG	2	6	675769	675774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_016860	GGA	2	6	675803	675808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016860	GTCGC	2	10	676829	676838	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1634	NC_016860	ACTC	2	8	676905	676912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_016860	TG	3	6	676984	676989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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