MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016857	GGATC	2	10	1192495	1192504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3002	NC_016857	CA	3	6	1192513	1192518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_016857	CTTA	2	8	1192531	1192538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_016857	TTTGA	2	10	1197318	1197327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016857	ATG	2	6	1198616	1198621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016857	ATC	2	6	1198635	1198640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016857	TAATTA	2	12	1198660	1198671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016857	TTG	2	6	1199774	1199779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016857	ATT	2	6	1199783	1199788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016857	TG	3	6	1199818	1199823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016857	TGCC	2	8	1199853	1199860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_016857	T	6	6	1199868	1199873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016857	GCG	2	6	1200964	1200969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_016857	TAA	2	6	1202531	1202536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016857	TC	3	6	1203686	1203691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_016857	GAT	2	6	1203701	1203706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016857	GA	3	6	1203771	1203776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016857	C	6	6	1204052	1204057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3019	NC_016857	TCT	2	6	1204105	1204110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_016857	TAA	2	6	1204133	1204138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016857	GGA	2	6	1204167	1204172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016857	TTCA	2	8	1204216	1204223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_016857	T	7	7	1204226	1204232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016857	TGT	2	6	1204237	1204242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016857	ATT	2	6	1204246	1204251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016857	TCA	2	6	1204272	1204277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_016857	A	6	6	1204289	1204294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016857	ACAT	2	8	1204313	1204320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_016857	AT	4	8	1204608	1204615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016857	TA	3	6	1204630	1204635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016857	AGC	2	6	1206410	1206415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_016857	GGC	2	6	1206460	1206465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_016857	GCC	2	6	1206477	1206482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_016857	TCC	2	6	1207145	1207150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_016857	GGA	2	6	1207178	1207183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016857	TCT	2	6	1208441	1208446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_016857	GCG	3	9	1208452	1208460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016857	T	6	6	1208466	1208471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016857	T	7	7	1208493	1208499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016857	TCA	2	6	1208528	1208533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_016857	GCA	2	6	1208541	1208546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_016857	A	6	6	1208551	1208556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016857	AGGA	2	8	1208629	1208636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016857	GTA	2	6	1210860	1210865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016857	AAT	2	6	1210895	1210900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016857	TA	3	6	1210948	1210953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016857	AAT	2	6	1210987	1210992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016857	CAT	2	6	1213524	1213529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_016857	AAGC	2	8	1214278	1214285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_016857	AATA	2	8	1214294	1214301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016857	CG	4	8	1214333	1214340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_016857	GGA	2	6	1214380	1214385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016857	AGG	2	6	1215214	1215219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016857	AGTC	2	8	1215942	1215949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_016857	GCC	2	6	1218737	1218742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_016857	AAC	2	6	1221576	1221581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_016857	T	7	7	1224312	1224318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016857	GTC	2	6	1224320	1224325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_016857	CGTA	2	8	1224369	1224376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_016857	CCCG	2	8	1224381	1224388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3061	NC_016857	A	6	6	1224454	1224459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016857	ATT	2	6	1227712	1227717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016857	GAC	2	6	1227726	1227731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_016857	AGC	2	6	1227884	1227889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_016857	AGA	2	6	1227908	1227913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016857	TGC	2	6	1227985	1227990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_016857	TGA	2	6	1227993	1227998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016857	CAT	2	6	1228064	1228069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_016857	T	6	6	1228134	1228139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016857	TAA	2	6	1228162	1228167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_016857	TG	3	6	1228232	1228237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016857	C	6	6	1228267	1228272	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3073	NC_016857	ATA	2	6	1229276	1229281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016857	TTTTG	2	10	1229283	1229292	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016857	GTT	2	6	1230242	1230247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016857	ACTGA	2	10	1230326	1230335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3077	NC_016857	T	7	7	1230423	1230429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016857	AG	3	6	1230471	1230476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016857	CAA	2	6	1230505	1230510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_016857	T	6	6	1231219	1231224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016857	ATG	2	6	1231242	1231247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016857	TG	3	6	1231331	1231336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016857	ATT	2	6	1231340	1231345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016857	GC	3	6	1231406	1231411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_016857	GAG	2	6	1231974	1231979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016857	CG	3	6	1232163	1232168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_016857	CGA	2	6	1232285	1232290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_016857	GCC	2	6	1233393	1233398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_016857	TA	3	6	1233426	1233431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016857	TTA	2	6	1236122	1236127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016857	TCCC	2	8	1236557	1236564	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3092	NC_016857	GGA	2	6	1236566	1236571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016857	AGAC	2	8	1237829	1237836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_016857	TAA	2	6	1237839	1237844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016857	T	6	6	1237865	1237870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016857	T	7	7	1242222	1242228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016857	TAAT	2	8	1242237	1242244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016857	GAGC	2	8	1242285	1242292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_016857	CAAA	2	8	1242371	1242378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_016857	TATT	2	8	1242387	1242394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_016857	TAA	2	6	1242405	1242410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016857	TGTCC	2	10	1242428	1242437	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_016857	CGG	2	6	1242439	1242444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_016857	C	6	6	1242451	1242456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3105	NC_016857	ATG	2	6	1243951	1243956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016857	T	6	6	1243989	1243994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016857	T	6	6	1246357	1246362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016857	TAA	2	6	1246428	1246433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016857	T	7	7	1250396	1250402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016857	TTG	2	6	1250526	1250531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016857	TTAA	2	8	1250532	1250539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016857	TAA	2	6	1250549	1250554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016857	TTAA	2	8	1250558	1250565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016857	GCT	2	6	1251919	1251924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_016857	AGG	2	6	1252066	1252071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016857	T	8	8	1252668	1252675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016857	CGT	2	6	1252687	1252692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_016857	TC	3	6	1253357	1253362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_016857	TAT	2	6	1253363	1253368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016857	AAAC	2	8	1253371	1253378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_016857	AAAT	2	8	1253408	1253415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016857	TA	3	6	1253453	1253458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016857	ATCG	2	8	1253515	1253522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_016857	TCA	2	6	1253562	1253567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_016857	AAAAAG	2	12	1253866	1253877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016857	T	6	6	1253899	1253904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016857	TAA	2	6	1254892	1254897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_016857	ATT	2	6	1254905	1254910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016857	CGC	2	6	1258513	1258518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_016857	GCT	2	6	1258540	1258545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016857	TAT	2	6	1258622	1258627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_016857	CCG	2	6	1258658	1258663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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