MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016857	CTA	2	6	4397783	4397788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_016857	AAG	2	6	4397859	4397864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_016857	TAATT	2	10	4397873	4397882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_016857	TTA	2	6	4397885	4397890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_016857	TTTA	2	8	4397900	4397907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_016857	AAT	2	6	4398213	4398218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_016857	A	7	7	4398271	4398277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_016857	TCGT	2	8	4398319	4398326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11509	NC_016857	A	6	6	4403729	4403734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_016857	GAC	2	6	4403754	4403759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_016857	GCC	2	6	4403780	4403785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11512	NC_016857	GCA	3	9	4403793	4403801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_016857	ACTT	2	8	4403938	4403945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_016857	GCC	2	6	4403974	4403979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_016857	GCT	2	6	4404596	4404601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_016857	AAT	2	6	4404617	4404622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_016857	AAC	2	6	4404626	4404631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_016857	C	6	6	4407910	4407915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11519	NC_016857	A	7	7	4407939	4407945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_016857	GCC	2	6	4409037	4409042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_016857	AG	3	6	4415411	4415416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_016857	GCG	2	6	4415477	4415482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_016857	GCA	2	6	4415655	4415660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_016857	CAG	2	6	4415695	4415700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_016857	TG	3	6	4415892	4415897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_016857	GGC	2	6	4416046	4416051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_016857	AGC	2	6	4416086	4416091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_016857	TGC	2	6	4416093	4416098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_016857	ACT	2	6	4416160	4416165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_016857	TTG	2	6	4416257	4416262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_016857	CGA	2	6	4416285	4416290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_016857	GCA	2	6	4416359	4416364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_016857	GAA	2	6	4416418	4416423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_016857	GGA	2	6	4416454	4416459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_016857	TAA	2	6	4416472	4416477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_016857	GCA	2	6	4416480	4416485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_016857	AGA	2	6	4416501	4416506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016857	CAG	2	6	4416527	4416532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_016857	G	6	6	4416674	4416679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016857	GGA	2	6	4416718	4416723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_016857	GGC	2	6	4416738	4416743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_016857	GAA	2	6	4416981	4416986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_016857	AGA	2	6	4417010	4417015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_016857	TGC	2	6	4417057	4417062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_016857	GTC	2	6	4417069	4417074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_016857	TTG	2	6	4417130	4417135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_016857	GGA	2	6	4417182	4417187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_016857	TCA	2	6	4417207	4417212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_016857	AC	3	6	4417233	4417238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_016857	CGT	2	6	4417301	4417306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_016857	AC	3	6	4417402	4417407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_016857	GTAG	2	8	4417443	4417450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_016857	CCT	2	6	4417543	4417548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_016857	CA	3	6	4417578	4417583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_016857	TGA	2	6	4417591	4417596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_016857	CGG	2	6	4417674	4417679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_016857	AAC	2	6	4417827	4417832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_016857	GTT	2	6	4417837	4417842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_016857	TC	3	6	4417849	4417854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_016857	GCG	2	6	4418147	4418152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_016857	GAG	2	6	4418163	4418168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_016857	TG	3	6	4418188	4418193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_016857	GC	3	6	4418215	4418220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_016857	G	6	6	4418308	4418313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_016857	TCC	2	6	4418318	4418323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_016857	CTGA	2	8	4418338	4418345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11567	NC_016857	GTAC	2	8	4418422	4418429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_016857	GGA	2	6	4418627	4418632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_016857	AC	3	6	4418845	4418850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_016857	CGTC	2	8	4418863	4418870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_016857	AAC	2	6	4418882	4418887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_016857	AGC	2	6	4418972	4418977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_016857	CAT	2	6	4418978	4418983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_016857	AAAG	2	8	4418986	4418993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_016857	AGCGA	2	10	4419114	4419123	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11576	NC_016857	CGTT	2	8	4419163	4419170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_016857	GT	3	6	4419202	4419207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_016857	G	6	6	4419407	4419412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_016857	GT	4	8	4419465	4419472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_016857	GAC	2	6	4419509	4419514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11582	NC_016857	GGT	2	6	4419607	4419612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_016857	GA	3	6	4419637	4419642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_016857	AGTC	2	8	4419733	4419740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11585	NC_016857	GCTG	2	8	4419751	4419758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11586	NC_016857	TTA	2	6	4419766	4419771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_016857	CGG	2	6	4419890	4419895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11589	NC_016857	ACC	2	6	4420161	4420166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11590	NC_016857	TGG	2	6	4420221	4420226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_016857	TCC	2	6	4420247	4420252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_016857	GGA	2	6	4420264	4420269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_016857	AGG	2	6	4420302	4420307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_016857	GGT	2	6	4420384	4420389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_016857	CGG	2	6	4420471	4420476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_016857	TCA	2	6	4420499	4420504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_016857	CGT	2	6	4420579	4420584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_016857	G	6	6	4420628	4420633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_016857	GAC	3	9	4420810	4420818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_016857	GT	3	6	4420832	4420837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_016857	AGA	2	6	4420922	4420927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_016857	GGC	2	6	4420981	4420986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_016857	AAGGA	2	10	4420992	4421001	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_016857	TGAC	2	8	4421021	4421028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11605	NC_016857	GCA	2	6	4421047	4421052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_016857	GGC	2	6	4421092	4421097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_016857	GGT	2	6	4421106	4421111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_016857	GAG	3	9	4421281	4421289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_016857	CCG	2	6	4421294	4421299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_016857	T	6	6	4421984	4421989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_016857	TTCTA	2	10	4421996	4422005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11612	NC_016857	TCT	2	6	4423061	4423066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_016857	T	6	6	4423122	4423127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_016857	TCA	2	6	4423144	4423149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_016857	ATTTA	2	10	4423159	4423168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_016857	AATTA	2	10	4423194	4423203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_016857	TTTTGA	2	12	4423218	4423229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_016857	AGT	2	6	4423240	4423245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_016857	TTCG	2	8	4423281	4423288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_016857	CAA	2	6	4423309	4423314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_016857	GAG	2	6	4423316	4423321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_016857	CAC	2	6	4424933	4424938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11623	NC_016857	GCGCT	2	10	4429431	4429440	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11624	NC_016857	GCC	2	6	4429462	4429467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_016857	GCC	2	6	4429499	4429504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11626	NC_016857	ACA	2	6	4433337	4433342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_016857	TCTT	2	8	4433370	4433377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11629	NC_016857	GGC	2	6	4433428	4433433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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