MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016857	A	6	6	4024236	4024241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_016857	CAT	2	6	4024324	4024329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_016857	ACTC	2	8	4027091	4027098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_016857	GAC	2	6	4028398	4028403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_016857	TTTCA	2	10	4028562	4028571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10506	NC_016857	ATT	2	6	4028608	4028613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_016857	ACC	2	6	4028634	4028639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_016857	CGA	2	6	4028645	4028650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_016857	A	8	8	4028650	4028657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_016857	GAA	2	6	4028661	4028666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_016857	TAAC	2	8	4028673	4028680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10512	NC_016857	A	7	7	4028683	4028689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_016857	AAG	3	9	4028746	4028754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_016857	GCG	2	6	4028773	4028778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_016857	CG	3	6	4028777	4028782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_016857	TTC	2	6	4030506	4030511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_016857	AT	3	6	4030562	4030567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_016857	A	7	7	4030648	4030654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_016857	GCAAG	2	10	4030675	4030684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10520	NC_016857	AAG	2	6	4031137	4031142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_016857	CAT	2	6	4031684	4031689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_016857	T	8	8	4031792	4031799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_016857	TCA	2	6	4033542	4033547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_016857	GCCAC	2	10	4033610	4033619	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10525	NC_016857	CCT	2	6	4038593	4038598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_016857	ATTA	2	8	4041341	4041348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_016857	ATTTT	2	10	4041350	4041359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_016857	T	7	7	4041356	4041362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_016857	CAT	2	6	4041396	4041401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_016857	ATTG	2	8	4041406	4041413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_016857	AAT	2	6	4041419	4041424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_016857	ATTT	2	8	4041472	4041479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_016857	CAA	2	6	4047701	4047706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_016857	CGG	2	6	4047729	4047734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_016857	GT	3	6	4051884	4051889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_016857	TTG	2	6	4051926	4051931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_016857	AG	3	6	4055260	4055265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_016857	CT	3	6	4055285	4055290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_016857	CGC	2	6	4055315	4055320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_016857	GTA	2	6	4055327	4055332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_016857	CGT	2	6	4055349	4055354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_016857	GTA	2	6	4055370	4055375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_016857	TGT	2	6	4055387	4055392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_016857	A	7	7	4055460	4055466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_016857	GCA	2	6	4055470	4055475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_016857	A	6	6	4056416	4056421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_016857	GA	3	6	4056435	4056440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_016857	TC	3	6	4056487	4056492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10549	NC_016857	CAT	2	6	4056571	4056576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_016857	CAA	2	6	4056618	4056623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_016857	GAG	2	6	4057938	4057943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_016857	CTGC	2	8	4059150	4059157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10553	NC_016857	GCAG	2	8	4059161	4059168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_016857	GT	4	8	4063711	4063718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_016857	GC	3	6	4063742	4063747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10556	NC_016857	TTG	2	6	4066395	4066400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_016857	TCT	2	6	4066576	4066581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_016857	TTC	2	6	4066594	4066599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_016857	CG	3	6	4066669	4066674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_016857	A	6	6	4066682	4066687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_016857	GCT	2	6	4066812	4066817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_016857	ATT	2	6	4066888	4066893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_016857	GCC	2	6	4069412	4069417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_016857	GC	3	6	4069428	4069433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_016857	T	7	7	4069497	4069503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_016857	CAA	2	6	4069508	4069513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10568	NC_016857	A	6	6	4071099	4071104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_016857	AC	3	6	4071128	4071133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10570	NC_016857	TTC	2	6	4071236	4071241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10572	NC_016857	ATC	2	6	4071685	4071690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10574	NC_016857	CA	3	6	4071729	4071734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_016857	CAA	2	6	4071737	4071742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10580	NC_016857	A	6	6	4072626	4072631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_016857	T	7	7	4072641	4072647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10588	NC_016857	TCCG	2	8	4074903	4074910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10589	NC_016857	CTG	2	6	4074917	4074922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10591	NC_016857	GC	3	6	4074978	4074983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_016857	CTGC	2	8	4075005	4075012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10593	NC_016857	CAA	2	6	4075023	4075028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10595	NC_016857	TA	3	6	4075198	4075203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_016857	TGT	2	6	4075315	4075320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10599	NC_016857	TG	3	6	4080453	4080458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_016857	T	7	7	4080463	4080469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_016857	AGCGC	2	10	4081281	4081290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10602	NC_016857	AAT	2	6	4082869	4082874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_016857	A	7	7	4086053	4086059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_016857	ACCAG	2	10	4086076	4086085	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10609	NC_016857	TTTAA	2	10	4087496	4087505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_016857	A	6	6	4087518	4087523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_016857	ATC	2	6	4088377	4088382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10613	NC_016857	GCAG	2	8	4090226	4090233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10614	NC_016857	CCA	2	6	4090261	4090266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10615	NC_016857	AGAA	2	8	4090270	4090277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_016857	A	7	7	4090298	4090304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_016857	TAC	2	6	4090333	4090338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10620	NC_016857	GGA	2	6	4092298	4092303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_016857	TAC	2	6	4093788	4093793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_016857	T	7	7	4093795	4093801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_016857	GAA	2	6	4093814	4093819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_016857	T	7	7	4093947	4093953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_016857	ATAA	2	8	4093959	4093966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10628	NC_016857	T	6	6	4094047	4094052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_016857	TAA	2	6	4094756	4094761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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