MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016857	CAG	2	6	2999176	2999181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_016857	TTAT	2	8	2999183	2999190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_016857	GA	3	6	2999254	2999259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_016857	A	7	7	2999277	2999283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_016857	CA	3	6	2999291	2999296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_016857	AAAC	2	8	2999307	2999314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_016857	AT	3	6	2999377	2999382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_016857	GTC	2	6	2999384	2999389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_016857	CGG	2	6	2999411	2999416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_016857	AGA	2	6	2999467	2999472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_016857	GCAG	2	8	2999483	2999490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_016857	ATA	3	9	2999510	2999518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_016857	CTCCC	2	10	2999531	2999540	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8014	NC_016857	CGC	2	6	3000683	3000688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_016857	A	6	6	3002794	3002799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_016857	ACA	2	6	3003640	3003645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_016857	AAT	2	6	3004071	3004076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_016857	GGC	2	6	3004091	3004096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_016857	CAT	2	6	3007508	3007513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_016857	ACAAA	2	10	3007542	3007551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8021	NC_016857	AAC	2	6	3007609	3007614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_016857	TGAA	2	8	3007628	3007635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_016857	GGT	2	6	3007640	3007645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_016857	GCC	2	6	3010297	3010302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_016857	CAT	2	6	3012567	3012572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_016857	GCC	2	6	3012649	3012654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_016857	ATT	2	6	3013325	3013330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_016857	GTG	2	6	3013392	3013397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_016857	AGCC	2	8	3013416	3013423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_016857	CT	3	6	3018187	3018192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_016857	GT	3	6	3026170	3026175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_016857	GAT	2	6	3028388	3028393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_016857	GC	3	6	3028394	3028399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_016857	CT	3	6	3028770	3028775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_016857	TATT	2	8	3028791	3028798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_016857	ATT	2	6	3028858	3028863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_016857	TA	3	6	3028886	3028891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_016857	GAT	2	6	3028912	3028917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_016857	TTG	2	6	3028930	3028935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_016857	T	6	6	3032382	3032387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_016857	ATA	2	6	3032414	3032419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_016857	AGT	2	6	3032423	3032428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_016857	GGCA	2	8	3032455	3032462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_016857	AT	3	6	3033402	3033407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_016857	ACCA	2	8	3033445	3033452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_016857	GAT	2	6	3033459	3033464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_016857	TA	4	8	3033465	3033472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_016857	TAC	2	6	3033478	3033483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_016857	A	6	6	3033486	3033491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_016857	T	6	6	3033494	3033499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_016857	ATA	2	6	3033500	3033505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_016857	A	6	6	3033533	3033538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_016857	T	6	6	3034309	3034314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_016857	TTC	2	6	3034345	3034350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_016857	ACT	2	6	3034358	3034363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_016857	CTT	2	6	3034381	3034386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_016857	TAA	2	6	3034397	3034402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_016857	TTA	2	6	3034414	3034419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_016857	TTTAC	2	10	3034484	3034493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8060	NC_016857	TGG	2	6	3034529	3034534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_016857	ATGT	2	8	3034537	3034544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_016857	A	7	7	3034623	3034629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_016857	AAT	2	6	3034669	3034674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_016857	TG	3	6	3035580	3035585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_016857	AAT	2	6	3035623	3035628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_016857	GAT	2	6	3035642	3035647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_016857	T	7	7	3035658	3035664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_016857	ATT	2	6	3035665	3035670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_016857	AAT	2	6	3035677	3035682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_016857	CG	3	6	3035693	3035698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8071	NC_016857	TAA	2	6	3035807	3035812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_016857	AC	3	6	3035835	3035840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_016857	ATT	2	6	3035861	3035866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_016857	AT	3	6	3035872	3035877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_016857	TGA	2	6	3040163	3040168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8077	NC_016857	ACT	2	6	3040262	3040267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_016857	AC	3	6	3040323	3040328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_016857	TAA	2	6	3040331	3040336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_016857	T	6	6	3040356	3040361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_016857	CAA	2	6	3040397	3040402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_016857	T	6	6	3041344	3041349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_016857	TTA	2	6	3041375	3041380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_016857	TAA	2	6	3041387	3041392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_016857	TA	3	6	3041511	3041516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_016857	ATG	2	6	3041545	3041550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_016857	CAT	2	6	3041662	3041667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_016857	CCT	2	6	3041744	3041749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_016857	CT	3	6	3041748	3041753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_016857	TCC	2	6	3041754	3041759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_016857	AGCC	2	8	3041781	3041788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_016857	GAT	2	6	3041793	3041798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_016857	CCT	2	6	3041811	3041816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_016857	AAAGA	2	10	3041846	3041855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_016857	ATT	2	6	3041863	3041868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_016857	A	7	7	3041873	3041879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_016857	ATA	2	6	3042037	3042042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_016857	AGC	2	6	3042043	3042048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_016857	A	7	7	3042060	3042066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_016857	CT	4	8	3042148	3042155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8101	NC_016857	AGTT	2	8	3042193	3042200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_016857	ATT	2	6	3042209	3042214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_016857	AAT	2	6	3042253	3042258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_016857	ATA	2	6	3042310	3042315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_016857	CAG	2	6	3042343	3042348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_016857	TTA	2	6	3042391	3042396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_016857	TAT	2	6	3042425	3042430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_016857	GA	3	6	3044099	3044104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_016857	TAC	2	6	3046921	3046926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_016857	TG	3	6	3046928	3046933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_016857	TTG	2	6	3046964	3046969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_016857	GA	3	6	3046976	3046981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_016857	ATG	2	6	3050406	3050411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_016857	TTA	2	6	3054035	3054040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_016857	GGT	2	6	3054050	3054055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_016857	A	6	6	3054068	3054073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_016857	ATG	2	6	3056241	3056246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_016857	TTAA	2	8	3060964	3060971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_016857	GCC	2	6	3066698	3066703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_016857	GCA	3	9	3066792	3066800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_016857	TGGA	2	8	3066821	3066828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_016857	AATT	2	8	3066830	3066837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_016857	T	8	8	3066852	3066859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_016857	TCA	2	6	3067432	3067437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_016857	ATT	2	6	3067485	3067490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_016857	CAG	2	6	3067560	3067565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_016857	GCT	3	9	3067572	3067580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_016857	T	7	7	3067580	3067586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_016857	CCT	2	6	3067681	3067686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_016857	GAC	2	6	3067764	3067769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8132	NC_016857	ATTAAA	2	12	3068674	3068685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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