MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016857	GTC	2	6	2503729	2503734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_016857	TGA	2	6	2504747	2504752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_016857	TCG	2	6	2504771	2504776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_016857	TTA	2	6	2504790	2504795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_016857	AAT	2	6	2504862	2504867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_016857	ATG	2	6	2504883	2504888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_016857	TGT	2	6	2504945	2504950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_016857	AAC	2	6	2509559	2509564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_016857	AAT	2	6	2509573	2509578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_016857	GCA	2	6	2509626	2509631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_016857	AAT	2	6	2509676	2509681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_016857	CAC	2	6	2509690	2509695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_016857	TTC	2	6	2509758	2509763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_016857	CCT	2	6	2509806	2509811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_016857	CTAT	2	8	2511282	2511289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_016857	TA	3	6	2511302	2511307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_016857	AAT	2	6	2511313	2511318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_016857	GGC	2	6	2511333	2511338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_016857	GAGT	2	8	2511343	2511350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_016857	CCT	2	6	2511764	2511769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_016857	ATTTT	2	10	2511866	2511875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016857	T	7	7	2511872	2511878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016857	GCCT	2	8	2512032	2512039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_016857	ATG	2	6	2512107	2512112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016857	TGA	2	6	2512145	2512150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016857	AAGT	2	8	2512159	2512166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016857	ATA	2	6	2513239	2513244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_016857	T	6	6	2513303	2513308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_016857	CGG	2	6	2513316	2513321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_016857	TCA	2	6	2513339	2513344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_016857	AAT	2	6	2513503	2513508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016857	TAT	2	6	2513520	2513525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_016857	CT	3	6	2513536	2513541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_016857	GTAAGT	2	12	2513550	2513561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_016857	GA	3	6	2513588	2513593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_016857	CATTT	2	10	2513620	2513629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6537	NC_016857	TGA	2	6	2513661	2513666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_016857	TGG	2	6	2515013	2515018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_016857	TTC	2	6	2515045	2515050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_016857	A	6	6	2515085	2515090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_016857	ACTT	2	8	2515108	2515115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6542	NC_016857	CAAA	2	8	2515139	2515146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_016857	ATT	2	6	2515151	2515156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_016857	CGA	2	6	2515197	2515202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_016857	AAT	2	6	2515231	2515236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_016857	TGA	2	6	2515452	2515457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_016857	AAT	2	6	2515504	2515509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_016857	A	7	7	2515548	2515554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_016857	AC	3	6	2515635	2515640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_016857	CCA	2	6	2515668	2515673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_016857	AAC	3	9	2516708	2516716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_016857	TCA	2	6	2516751	2516756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_016857	GCA	2	6	2516787	2516792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_016857	TATT	2	8	2519907	2519914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016857	A	6	6	2520936	2520941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_016857	GA	3	6	2521038	2521043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_016857	CCT	2	6	2521376	2521381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_016857	GAC	2	6	2522801	2522806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_016857	TTTTCA	2	12	2522859	2522870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6560	NC_016857	CAGTA	2	10	2522875	2522884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6561	NC_016857	TTA	2	6	2522929	2522934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016857	GT	4	8	2522937	2522944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_016857	T	7	7	2524260	2524266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_016857	TA	3	6	2526484	2526489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_016857	AAT	2	6	2526499	2526504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_016857	AGC	2	6	2526557	2526562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_016857	CAAA	2	8	2526565	2526572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_016857	TGG	2	6	2526654	2526659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_016857	CATGC	2	10	2526691	2526700	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6570	NC_016857	TGG	2	6	2526772	2526777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_016857	CATGC	2	10	2526809	2526818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6572	NC_016857	CAT	2	6	2526879	2526884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_016857	AGT	2	6	2526984	2526989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_016857	ATA	2	6	2527829	2527834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_016857	CTGCC	2	10	2527847	2527856	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6576	NC_016857	ACG	2	6	2529476	2529481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_016857	AACA	2	8	2529482	2529489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6578	NC_016857	CA	3	6	2529543	2529548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6579	NC_016857	AGG	2	6	2529590	2529595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_016857	CGG	2	6	2529600	2529605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_016857	TCA	2	6	2529616	2529621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_016857	ACT	2	6	2529629	2529634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_016857	CCG	2	6	2529646	2529651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_016857	AGG	2	6	2529711	2529716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_016857	CGG	2	6	2529721	2529726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_016857	TCA	2	6	2529737	2529742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_016857	CAC	2	6	2529745	2529750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_016857	AGG	2	6	2529828	2529833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_016857	CGG	2	6	2529838	2529843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_016857	TCA	2	6	2529854	2529859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_016857	CAC	2	6	2529862	2529867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6592	NC_016857	CCA	2	6	2529941	2529946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_016857	A	6	6	2529951	2529956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_016857	T	6	6	2529972	2529977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_016857	TGCGC	2	10	2530031	2530040	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6596	NC_016857	GAC	2	6	2530055	2530060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_016857	TTGC	2	8	2533565	2533572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6598	NC_016857	TTAA	2	8	2533621	2533628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_016857	TAA	2	6	2533634	2533639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_016857	CA	3	6	2534465	2534470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_016857	AGAT	2	8	2534476	2534483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_016857	AT	3	6	2535424	2535429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_016857	A	6	6	2538750	2538755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_016857	CAAGTG	2	12	2539864	2539875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6605	NC_016857	GCA	2	6	2539890	2539895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_016857	ATT	2	6	2540842	2540847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_016857	CTGG	2	8	2540891	2540898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6608	NC_016857	A	6	6	2541941	2541946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_016857	T	6	6	2541963	2541968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_016857	TCACC	2	10	2541987	2541996	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6611	NC_016857	GCC	2	6	2542246	2542251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6612	NC_016857	T	7	7	2542561	2542567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_016857	GAA	2	6	2544899	2544904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_016857	T	7	7	2544923	2544929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_016857	GCC	2	6	2544942	2544947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_016857	GTGCA	2	10	2544959	2544968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6617	NC_016857	CAG	2	6	2546157	2546162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_016857	TTA	2	6	2548264	2548269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_016857	ATT	2	6	2548296	2548301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_016857	A	6	6	2548686	2548691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_016857	AAC	2	6	2549238	2549243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_016857	TAT	2	6	2549255	2549260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_016857	GGC	2	6	2549265	2549270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_016857	A	6	6	2550292	2550297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_016857	TCA	2	6	2554193	2554198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_016857	TA	3	6	2554232	2554237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_016857	TGA	2	6	2554243	2554248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_016857	TCCC	2	8	2554277	2554284	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6629	NC_016857	GAG	3	9	2554295	2554303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6631	NC_016857	A	7	7	2555217	2555223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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