MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 12726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016857	TCG	2	6	2039240	2039245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_016857	TC	4	8	2039261	2039268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_016857	CGA	2	6	2039475	2039480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_016857	GAC	2	6	2039489	2039494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_016857	CGC	2	6	2039505	2039510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_016857	AGA	2	6	2039715	2039720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016857	GA	3	6	2039746	2039751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_016857	TAA	2	6	2039834	2039839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016857	A	6	6	2039846	2039851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_016857	T	6	6	2039926	2039931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016857	CAA	2	6	2039963	2039968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_016857	TGG	2	6	2039996	2040001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016857	T	6	6	2040090	2040095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016857	CAT	2	6	2040155	2040160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_016857	AAT	2	6	2040162	2040167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016857	CTG	2	6	2040174	2040179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_016857	CGCC	2	8	2040247	2040254	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5518	NC_016857	CAATA	2	10	2040274	2040283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5519	NC_016857	AAG	2	6	2040298	2040303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016857	C	7	7	2040337	2040343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5521	NC_016857	TTA	2	6	2040423	2040428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016857	TCGA	2	8	2041584	2041591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_016857	CG	3	6	2041606	2041611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_016857	GTG	2	6	2041643	2041648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_016857	AAAAG	2	10	2041760	2041769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_016857	TAA	2	6	2041775	2041780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016857	TTA	2	6	2042159	2042164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016857	ACA	2	6	2042165	2042170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_016857	ATT	2	6	2042198	2042203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_016857	ATC	2	6	2042212	2042217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016857	TGAC	2	8	2042227	2042234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_016857	TATT	2	8	2042283	2042290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_016857	T	6	6	2042356	2042361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_016857	CAGGA	2	10	2044545	2044554	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5535	NC_016857	CAC	2	6	2044572	2044577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_016857	GCC	2	6	2044582	2044587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_016857	GC	3	6	2044670	2044675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_016857	GCA	2	6	2044682	2044687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016857	AAT	2	6	2044707	2044712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016857	T	6	6	2044766	2044771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016857	CCG	2	6	2044795	2044800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_016857	TCG	2	6	2044852	2044857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_016857	CCA	2	6	2044889	2044894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_016857	CACG	2	8	2044936	2044943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_016857	C	6	6	2044993	2044998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5546	NC_016857	CG	5	10	2045027	2045036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_016857	CTC	2	6	2045049	2045054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_016857	C	8	8	2045063	2045070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5549	NC_016857	GCC	2	6	2045197	2045202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_016857	ATC	2	6	2045242	2045247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_016857	TCA	2	6	2045378	2045383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_016857	CA	3	6	2045382	2045387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_016857	GCA	2	6	2045394	2045399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_016857	GCA	2	6	2045444	2045449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_016857	ACA	2	6	2045492	2045497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016857	CTG	2	6	2045500	2045505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016857	CTCCAG	2	12	2050919	2050930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_016857	CGC	2	6	2050943	2050948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_016857	CCG	2	6	2050949	2050954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_016857	GTT	2	6	2051626	2051631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016857	AGT	2	6	2053202	2053207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016857	TCA	2	6	2053213	2053218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_016857	CCT	2	6	2053228	2053233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_016857	AAT	2	6	2053842	2053847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_016857	CCA	2	6	2055311	2055316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_016857	GGGC	2	8	2060880	2060887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_016857	ATT	2	6	2060947	2060952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_016857	TAA	2	6	2061340	2061345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_016857	GTT	2	6	2061416	2061421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_016857	TCA	2	6	2061439	2061444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_016857	TGAC	2	8	2061459	2061466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_016857	TGG	2	6	2061515	2061520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016857	TGA	2	6	2061543	2061548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_016857	GAT	2	6	2061561	2061566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016857	T	6	6	2061613	2061618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016857	TAGTT	2	10	2061651	2061660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_016857	CCT	2	6	2061673	2061678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_016857	CAT	2	6	2061714	2061719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_016857	CTG	2	6	2061740	2061745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_016857	TTCA	2	8	2061806	2061813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_016857	CCA	2	6	2061852	2061857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_016857	TGA	2	6	2062324	2062329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_016857	CA	3	6	2062337	2062342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_016857	CG	3	6	2062423	2062428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_016857	ACC	2	6	2064560	2064565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_016857	CTG	2	6	2064586	2064591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_016857	GGC	2	6	2064617	2064622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_016857	TAG	2	6	2064645	2064650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_016857	TGC	2	6	2064666	2064671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_016857	GTT	2	6	2064688	2064693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_016857	A	7	7	2064713	2064719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_016857	GCT	2	6	2064724	2064729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_016857	TCG	2	6	2064812	2064817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_016857	T	7	7	2064863	2064869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_016857	TTC	2	6	2065283	2065288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_016857	C	6	6	2065360	2065365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5597	NC_016857	AGAC	2	8	2065366	2065373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_016857	CAGC	2	8	2065427	2065434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_016857	GCGCG	2	10	2065439	2065448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5600	NC_016857	GTG	2	6	2065492	2065497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_016857	CTT	2	6	2067371	2067376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_016857	TCGTGA	2	12	2067418	2067429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5603	NC_016857	CCA	2	6	2067466	2067471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_016857	GTC	2	6	2067491	2067496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_016857	TGT	2	6	2067538	2067543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016857	GAT	2	6	2067584	2067589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016857	GCT	2	6	2067597	2067602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_016857	CGT	2	6	2067627	2067632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_016857	GCAG	2	8	2067653	2067660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5610	NC_016857	GAC	2	6	2067697	2067702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_016857	GC	3	6	2067726	2067731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_016857	CACT	2	8	2068696	2068703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_016857	GC	3	6	2068749	2068754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_016857	TCCA	2	8	2068801	2068808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_016857	ACG	2	6	2068821	2068826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_016857	AAC	2	6	2068828	2068833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_016857	TGTC	2	8	2068955	2068962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_016857	ACTT	2	8	2069027	2069034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_016857	GCA	2	6	2069968	2069973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_016857	GTG	2	6	2071912	2071917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_016857	CCT	2	6	2072151	2072156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_016857	A	6	6	2072222	2072227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_016857	TAATG	2	10	2072229	2072238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_016857	CCA	2	6	2072958	2072963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_016857	TGG	2	6	2072967	2072972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_016857	T	9	9	2072974	2072982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_016857	AT	3	6	2072996	2073001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_016857	AGC	2	6	2073054	2073059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_016857	CAGG	2	8	2073063	2073070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5631	NC_016857	GAT	2	6	2073110	2073115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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