MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016856	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016856	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016856	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016856	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016856	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016856	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016856	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016856	A	7	7	5924	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016856	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016856	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016856	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016856	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016856	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016856	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016856	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016856	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016856	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016856	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016856	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016856	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016856	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016856	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016856	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016856	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016856	T	6	6	11429	11434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016856	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016856	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016856	A	8	8	11498	11505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016856	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016856	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016856	TTC	2	6	14753	14758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016856	T	6	6	14780	14785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016856	TTG	2	6	14834	14839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016856	TAT	2	6	14970	14975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016856	T	7	7	14985	14991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016856	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016856	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016856	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016856	T	6	6	16478	16483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016856	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016856	T	6	6	17791	17796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016856	CCA	2	6	20031	20036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016856	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016856	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016856	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016856	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016856	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016856	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016856	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016856	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016856	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016856	ATA	2	6	33134	33139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016856	T	6	6	33146	33151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016856	T	6	6	33154	33159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016856	T	6	6	33186	33191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016856	CAT	2	6	33201	33206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016856	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016856	TAA	2	6	33255	33260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016856	GTG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016856	ATG	2	6	33327	33332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016856	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016856	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016856	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016856	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016856	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016856	A	6	6	35093	35098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016856	TAG	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016856	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016856	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016856	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016856	TGT	2	6	35292	35297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016856	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016856	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016856	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016856	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016856	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016856	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016856	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016856	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016856	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016856	T	7	7	39904	39910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016856	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016856	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016856	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016856	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016856	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016856	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016856	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016856	A	6	6	41637	41642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016856	GTA	2	6	42916	42921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016856	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016856	TGA	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016856	GTT	2	6	44214	44219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016856	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016856	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016856	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016856	A	6	6	46090	46095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016856	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016856	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016856	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016856	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016856	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016856	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016856	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016856	AAC	2	6	51862	51867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016856	ATT	2	6	51894	51899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016856	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016856	AGT	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016856	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016856	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016856	TTA	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016856	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016856	T	6	6	52062	52067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016856	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016856	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016856	A	6	6	52145	52150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016856	A	7	7	52227	52233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016856	CTT	2	6	52607	52612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016856	TGA	2	6	58771	58776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016856	GAA	2	6	58829	58834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016856	GTC	2	6	58844	58849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016856	T	6	6	58912	58917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016856	TACT	2	8	63482	63489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016856	TTTC	2	8	63490	63497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016856	A	6	6	63500	63505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016856	ACG	2	6	66918	66923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016856	GAC	2	6	66932	66937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016856	TGC	2	6	67024	67029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016856	CCG	2	6	67037	67042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016856	TAA	2	6	68437	68442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016856	TAAT	2	8	68492	68499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016856	ATT	2	6	68503	68508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016856	TCT	2	6	73843	73848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016856	TC	3	6	73854	73859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016856	GGC	2	6	73951	73956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016856	GC	3	6	73963	73968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016856	TGTGGT	2	12	74858	74869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016856	AT	3	6	74898	74903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016856	C	6	6	74923	74928	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_016856	ATAA	2	8	74943	74950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016856	G	8	8	75262	75269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016856	T	6	6	75301	75306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016856	AAAGAA	2	12	75353	75364	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016856	TTA	2	6	75394	75399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016856	T	6	6	75418	75423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016856	ATG	2	6	75433	75438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016856	ATTTG	2	10	75440	75449	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016856	T	6	6	75450	75455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016856	AT	3	6	75465	75470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016856	T	7	7	75483	75489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016856	GTT	2	6	75561	75566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016856	T	6	6	75565	75570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016856	GTT	2	6	75571	75576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_016856	AGTG	2	8	75853	75860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016856	GGA	2	6	81053	81058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_016856	TTA	2	6	81206	81211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016856	CGG	2	6	83249	83254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_016856	TAA	2	6	87389	87394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_016856	ATT	2	6	140134	140139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016856	T	6	6	140162	140167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016856	CTTT	2	8	140173	140180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
282	NC_016856	CGG	2	6	140443	140448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_016856	AAT	2	6	151779	151784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016856	GCC	2	6	156345	156350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_016856	GA	4	8	156385	156392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016856	CCG	2	6	157593	157598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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290	NC_016856	T	8	8	158633	158640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_016856	CTG	2	6	158752	158757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_016856	T	6	6	162239	162244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016856	CAA	2	6	162252	162257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_016856	AT	3	6	202848	202853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_016856	GCTTC	2	10	204612	204621	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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423	NC_016856	GAT	2	6	209732	209737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_016856	AT	4	8	209788	209795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_016856	GAC	2	6	210449	210454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_016856	CTT	2	6	212118	212123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_016856	ATA	2	6	230856	230861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_016856	TAA	2	6	230883	230888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_016856	T	6	6	230950	230955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016856	T	8	8	230957	230964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_016856	AAAT	2	8	230982	230989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016856	A	6	6	231147	231152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_016856	CTT	2	6	231226	231231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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