MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016856	GAT	2	6	441470	441475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016856	ACAAT	2	10	442405	442414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_016856	CTG	2	6	442455	442460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_016856	ACG	2	6	442525	442530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_016856	TAA	2	6	442534	442539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016856	TTAAT	2	10	443271	443280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016856	CGG	2	6	443601	443606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016856	GTT	2	6	445569	445574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016856	ACC	2	6	446762	446767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_016856	GC	3	6	446791	446796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_016856	ATT	2	6	446884	446889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016856	A	7	7	451287	451293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016856	TAAC	2	8	451463	451470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_016856	TGG	2	6	453634	453639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016856	T	6	6	453640	453645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016856	ACA	2	6	453919	453924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016856	T	6	6	455315	455320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016856	TCC	2	6	456778	456783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_016856	CCT	2	6	456789	456794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_016856	TAA	2	6	456799	456804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016856	GAT	2	6	456812	456817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016856	GGT	2	6	458700	458705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016856	A	6	6	458724	458729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016856	AACGC	2	10	459400	459409	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_016856	AGGG	2	8	459419	459426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016856	CAAT	2	8	459454	459461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_016856	ATCG	2	8	459478	459485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_016856	ATG	2	6	459503	459508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016856	CGG	2	6	459543	459548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016856	ACGC	2	8	459554	459561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_016856	TAA	2	6	462645	462650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016856	T	7	7	465898	465904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016856	CTC	2	6	465965	465970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_016856	AGG	2	6	465991	465996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016856	AG	3	6	466381	466386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016856	TCA	2	6	467130	467135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016856	AT	3	6	467165	467170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016856	TAT	2	6	467231	467236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016856	CTG	2	6	467607	467612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_016856	CAA	2	6	468023	468028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016856	GGC	2	6	468030	468035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016856	GGC	2	6	468080	468085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016856	TGG	2	6	468126	468131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016856	CGC	3	9	468165	468173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_016856	GCA	2	6	468177	468182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_016856	GAC	2	6	468204	468209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016856	T	6	6	468218	468223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016856	TATC	2	8	469220	469227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_016856	CAA	2	6	469337	469342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_016856	CG	3	6	469347	469352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_016856	AGC	2	6	471660	471665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_016856	ATT	2	6	471672	471677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016856	C	6	6	471691	471696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1054	NC_016856	AG	3	6	471720	471725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016856	T	6	6	472200	472205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016856	CCG	2	6	472674	472679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_016856	CTTTT	2	10	472688	472697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_016856	T	7	7	472694	472700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016856	CTG	2	6	472701	472706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016856	CT	3	6	478365	478370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_016856	GTGATA	2	12	478456	478467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016856	GCT	2	6	478501	478506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_016856	GCC	2	6	478555	478560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_016856	GGC	2	6	480024	480029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_016856	AAAT	2	8	483937	483944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016856	GAT	2	6	483957	483962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016856	ACGAT	2	10	483989	483998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_016856	TGCC	2	8	484780	484787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_016856	CGC	2	6	486898	486903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_016856	TCC	2	6	488388	488393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_016856	TCA	2	6	488436	488441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016856	TAT	2	6	488472	488477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016856	GCAAC	2	10	488478	488487	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1074	NC_016856	GAA	2	6	488501	488506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016856	GTT	2	6	489002	489007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016856	CGC	2	6	489024	489029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_016856	AGT	2	6	490437	490442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016856	A	6	6	490514	490519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016856	TCAT	2	8	490575	490582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_016856	TG	3	6	490659	490664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016856	TGGC	2	8	490735	490742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_016856	GGTG	2	8	490744	490751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016856	TTTGC	2	10	490762	490771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_016856	TCT	2	6	490818	490823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016856	CAA	2	6	490840	490845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_016856	GC	3	6	490879	490884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_016856	AGA	2	6	490896	490901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016856	CAG	2	6	490907	490912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_016856	TAT	2	6	490920	490925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016856	ATT	2	6	490926	490931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016856	TGA	2	6	493985	493990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016856	A	7	7	493998	494004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016856	CCG	2	6	494005	494010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_016856	CGG	2	6	494020	494025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_016856	T	6	6	494026	494031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016856	CGC	2	6	494941	494946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_016856	TGG	2	6	498866	498871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016856	TAT	2	6	499096	499101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016856	AAATTT	2	12	499126	499137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016856	AAT	2	6	499183	499188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016856	AT	3	6	499220	499225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016856	T	6	6	499225	499230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016856	TTA	2	6	499270	499275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016856	AAT	2	6	499284	499289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016856	TTG	3	9	500800	500808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016856	CAT	2	6	501439	501444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_016856	GGA	2	6	501681	501686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016856	TA	3	6	502221	502226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016856	GAT	2	6	502240	502245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016856	GAC	2	6	502249	502254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_016856	TGAT	2	8	502263	502270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016856	T	6	6	502341	502346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016856	T	8	8	503714	503721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016856	CAG	2	6	503867	503872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_016856	T	6	6	503874	503879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016856	GC	3	6	504591	504596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_016856	ACTT	2	8	504606	504613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_016856	CGA	2	6	504633	504638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_016856	GCC	2	6	504642	504647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_016856	A	6	6	506076	506081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016856	G	6	6	506082	506087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016856	TG	3	6	506131	506136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016856	GGT	2	6	506171	506176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016856	ACTAA	2	10	506214	506223	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_016856	GA	3	6	506224	506229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016856	TAA	2	6	508610	508615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016856	T	7	7	508652	508658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016856	CCA	2	6	508691	508696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_016856	CTG	2	6	508735	508740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_016856	GAAGA	2	10	508788	508797	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016856	T	6	6	509126	509131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016856	CGC	2	6	509206	509211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_016856	ATGCG	2	10	509221	509230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_016856	GCC	2	6	509309	509314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_016856	AAC	3	9	511835	511843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_016856	GCC	2	6	512344	512349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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