MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016856	ATCCT	2	10	3429619	3429628	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8002	NC_016856	TAAA	2	8	3431779	3431786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_016856	TCAA	2	8	3431841	3431848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_016856	A	6	6	3431847	3431852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_016856	AT	3	6	3431869	3431874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016856	TCAA	2	8	3431933	3431940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_016856	T	7	7	3432047	3432053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_016856	TTTG	2	8	3432060	3432067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_016856	TAA	2	6	3432080	3432085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_016856	AAT	2	6	3432131	3432136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_016856	GAAA	2	8	3432177	3432184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_016856	TCA	2	6	3432240	3432245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_016856	AAT	2	6	3432254	3432259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_016856	CAC	2	6	3432267	3432272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_016856	AATT	2	8	3432280	3432287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_016856	TCT	2	6	3432308	3432313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_016856	CCG	2	6	3432353	3432358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_016856	CTTT	2	8	3432399	3432406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_016856	CGT	2	6	3432416	3432421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_016856	TCAT	2	8	3432428	3432435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_016856	CTTT	2	8	3432515	3432522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_016856	CGT	2	6	3432532	3432537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_016856	TCAT	2	8	3432544	3432551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_016856	GCC	2	6	3432555	3432560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_016856	CTTT	2	8	3432631	3432638	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8027	NC_016856	TCAT	2	8	3432660	3432667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8028	NC_016856	GCC	2	6	3432671	3432676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8031	NC_016856	CGT	2	6	3432764	3432769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_016856	TCAT	2	8	3432776	3432783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8033	NC_016856	GAT	2	6	3432841	3432846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_016856	CTTT	2	8	3432863	3432870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_016856	CGT	2	6	3432880	3432885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8037	NC_016856	GCC	2	6	3432903	3432908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8039	NC_016856	CTTT	2	8	3432971	3432978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_016856	CGT	2	6	3432988	3432993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_016856	TCAT	2	8	3433000	3433007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_016856	GCC	2	6	3433011	3433016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_016856	CCG	2	6	3433033	3433038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_016856	GAA	2	6	3433052	3433057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_016856	TCAT	2	8	3433096	3433103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_016856	AGC	2	6	3433131	3433136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8048	NC_016856	CGG	2	6	3433286	3433291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_016856	CT	3	6	3433296	3433301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_016856	C	7	7	3433322	3433328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8051	NC_016856	TCC	2	6	3433368	3433373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_016856	GAC	3	9	3433396	3433404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_016856	GCG	2	6	3433408	3433413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_016856	GC	3	6	3433432	3433437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_016856	CG	3	6	3433451	3433456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_016856	TC	3	6	3435602	3435607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_016856	GCC	2	6	3436435	3436440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_016856	TAACCA	2	12	3436863	3436874	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8061	NC_016856	ATTCAA	2	12	3438610	3438621	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8062	NC_016856	GCA	2	6	3438675	3438680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_016856	ACAAA	2	10	3440692	3440701	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8064	NC_016856	TTTC	2	8	3440718	3440725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_016856	TGA	2	6	3440755	3440760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_016856	TG	3	6	3440770	3440775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_016856	TTATTT	2	12	3440809	3440820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_016856	GAA	2	6	3442724	3442729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_016856	A	6	6	3442748	3442753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_016856	CTG	2	6	3442815	3442820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8083	NC_016856	TGG	2	6	3443320	3443325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8098	NC_016856	GGC	2	6	3455346	3455351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_016856	AGCGC	2	10	3455399	3455408	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8100	NC_016856	AAC	2	6	3455455	3455460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_016856	TA	3	6	3457255	3457260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_016856	TATGA	2	10	3457267	3457276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_016856	TTA	2	6	3457359	3457364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_016856	ATC	2	6	3457374	3457379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_016856	CT	4	8	3459220	3459227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_016856	TC	3	6	3459250	3459255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_016856	A	7	7	3459296	3459302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_016856	TTTAC	2	10	3459333	3459342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8109	NC_016856	GTA	2	6	3461259	3461264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8111	NC_016856	TCA	2	6	3461303	3461308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_016856	AAC	3	9	3461370	3461378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_016856	TGAA	2	8	3462345	3462352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_016856	CAA	2	6	3462373	3462378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_016856	CCAG	2	8	3462384	3462391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8117	NC_016856	ATA	2	6	3464595	3464600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8125	NC_016856	CT	3	6	3465202	3465207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_016856	A	6	6	3466597	3466602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8129	NC_016856	GGC	2	6	3466698	3466703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_016856	GAC	2	6	3466783	3466788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8255	NC_016856	CT	3	6	3527277	3527282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8257	NC_016856	GCGCT	2	10	3527423	3527432	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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8261	NC_016856	CT	4	8	3529199	3529206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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