MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016856	CGT	2	6	2689646	2689651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_016856	CGA	2	6	2689667	2689672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_016856	GTT	2	6	2689686	2689691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016856	CGC	2	6	2689715	2689720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_016856	GCC	2	6	2689768	2689773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_016856	GTC	2	6	2689774	2689779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016856	GCC	2	6	2689885	2689890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_016856	CGGG	2	8	2689920	2689927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_016856	TGA	2	6	2689934	2689939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016856	TGC	2	6	2689943	2689948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016856	GCC	2	6	2689965	2689970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_016856	TGG	2	6	2689976	2689981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016856	CAC	2	6	2690010	2690015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_016856	CGC	2	6	2690033	2690038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_016856	CGC	2	6	2690078	2690083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_016856	TTCACC	2	12	2690167	2690178	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_016856	CGC	2	6	2690238	2690243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_016856	GCC	2	6	2690304	2690309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_016856	GCG	2	6	2690338	2690343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016856	AGT	2	6	2690363	2690368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_016856	GC	3	6	2690446	2690451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_016856	GGCC	2	8	2690459	2690466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_016856	GGC	2	6	2690553	2690558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_016856	CCG	2	6	2690567	2690572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_016856	TGG	2	6	2690660	2690665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016856	GCG	2	6	2690732	2690737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_016856	GTG	2	6	2690887	2690892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016856	GA	3	6	2691085	2691090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016856	GTTCG	2	10	2691093	2691102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6030	NC_016856	GGT	2	6	2691150	2691155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016856	CCG	2	6	2691170	2691175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_016856	TCG	2	6	2691296	2691301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_016856	CCG	2	6	2691302	2691307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_016856	CAG	2	6	2691381	2691386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_016856	CCA	2	6	2691413	2691418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_016856	GC	3	6	2691441	2691446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_016856	GAC	2	6	2691468	2691473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_016856	CAC	2	6	2691516	2691521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_016856	CGCC	2	8	2691539	2691546	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6040	NC_016856	ATC	2	6	2691645	2691650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_016856	TCG	2	6	2691706	2691711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_016856	TGG	2	6	2691752	2691757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016856	CGGTGA	2	12	2691764	2691775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6044	NC_016856	CGC	2	6	2691810	2691815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_016856	GAG	2	6	2691982	2691987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016856	GTG	2	6	2692036	2692041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016856	CGC	2	6	2692049	2692054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_016856	GC	3	6	2692053	2692058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_016856	TTG	2	6	2692147	2692152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016856	GCGGT	2	10	2692159	2692168	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6051	NC_016856	CCG	2	6	2692184	2692189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_016856	GCT	3	9	2692272	2692280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_016856	GGT	2	6	2692296	2692301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016856	GC	3	6	2692334	2692339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_016856	GCG	2	6	2692358	2692363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_016856	GAC	2	6	2692392	2692397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_016856	GGT	3	9	2692446	2692454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016856	CGC	2	6	2692520	2692525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_016856	CGC	3	9	2692559	2692567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_016856	ATG	2	6	2692591	2692596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_016856	GAT	2	6	2692640	2692645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016856	CGG	2	6	2692646	2692651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_016856	CGG	2	6	2692673	2692678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016856	CCG	2	6	2692718	2692723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_016856	GCG	2	6	2692760	2692765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_016856	GACCA	2	10	2692792	2692801	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6067	NC_016856	GGC	2	6	2692808	2692813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_016856	GC	3	6	2692826	2692831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_016856	GCG	2	6	2692865	2692870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_016856	GGC	2	6	2692881	2692886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_016856	CGG	2	6	2692907	2692912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_016856	GC	3	6	2692913	2692918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_016856	GCCAG	2	10	2692928	2692937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6074	NC_016856	CGG	2	6	2692938	2692943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_016856	GC	3	6	2692991	2692996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_016856	CTGG	2	8	2693019	2693026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_016856	AGT	2	6	2693036	2693041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016856	CGC	2	6	2693052	2693057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_016856	GCT	2	6	2693169	2693174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6082	NC_016856	A	6	6	2693233	2693238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_016856	AC	3	6	2693242	2693247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_016856	GC	3	6	2699078	2699083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_016856	GGCT	2	8	2700133	2700140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_016856	ATA	2	6	2702491	2702496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_016856	TTAT	2	8	2702513	2702520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_016856	ACTT	2	8	2702942	2702949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_016856	AGCGC	2	10	2702968	2702977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6090	NC_016856	AC	3	6	2704583	2704588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_016856	CGAA	2	8	2707743	2707750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_016856	GC	3	6	2707785	2707790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_016856	GCTACA	2	12	2709960	2709971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_016856	CGA	2	6	2709999	2710004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_016856	GCCC	2	8	2710013	2710020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6096	NC_016856	GTTA	2	8	2710038	2710045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_016856	AATG	2	8	2710222	2710229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016856	TTA	2	6	2711433	2711438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016856	A	6	6	2711463	2711468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016856	ATA	2	6	2711563	2711568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016856	CAA	2	6	2712165	2712170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_016856	TAA	2	6	2716942	2716947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016856	TAAAT	2	10	2716961	2716970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016856	TGA	2	6	2724287	2724292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_016856	TGA	2	6	2724337	2724342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016856	GCCA	2	8	2724373	2724380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_016856	T	6	6	2725530	2725535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016856	ATG	2	6	2726221	2726226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016856	TAT	2	6	2726474	2726479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016856	CCG	2	6	2726495	2726500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_016856	TGC	2	6	2726596	2726601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_016856	CTT	2	6	2726658	2726663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_016856	CAGA	2	8	2726689	2726696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_016856	AGG	2	6	2726751	2726756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016856	CTTT	2	8	2726773	2726780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_016856	TTA	2	6	2728965	2728970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016856	GCC	2	6	2728979	2728984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_016856	GGC	2	6	2729033	2729038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_016856	TCG	2	6	2729054	2729059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_016856	TCA	2	6	2729113	2729118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_016856	GCG	2	6	2729176	2729181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_016856	CTT	2	6	2732192	2732197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_016856	CGC	2	6	2732204	2732209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_016856	CTTA	2	8	2734981	2734988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_016856	T	6	6	2735014	2735019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016856	CGG	2	6	2736799	2736804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_016856	CCG	2	6	2736819	2736824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_016856	TA	3	6	2737825	2737830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_016856	AT	3	6	2737851	2737856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016856	TTA	2	6	2737857	2737862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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