MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 11167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016856	AGGG	2	8	2470298	2470305	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016856	G	6	6	2470323	2470328	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_016856	TGT	2	6	2471165	2471170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016856	AATT	2	8	2471217	2471224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016856	T	6	6	2471223	2471228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_016856	TTA	2	6	2471278	2471283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016856	GCG	2	6	2471327	2471332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_016856	TTTG	2	8	2471418	2471425	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016856	GCGT	2	8	2471498	2471505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_016856	GAA	2	6	2471566	2471571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016856	GAC	2	6	2471593	2471598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_016856	GTT	2	6	2471659	2471664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016856	GC	3	6	2471681	2471686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_016856	GCCCG	2	10	2471721	2471730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5515	NC_016856	CCG	2	6	2471810	2471815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_016856	GCC	2	6	2471863	2471868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_016856	GGA	2	6	2471928	2471933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_016856	T	6	6	2472137	2472142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_016856	A	6	6	2472164	2472169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016856	TACAG	2	10	2473213	2473222	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5521	NC_016856	TAT	2	6	2475088	2475093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016856	AAT	2	6	2475113	2475118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016856	CCA	2	6	2475136	2475141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_016856	ATA	2	6	2475142	2475147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_016856	A	6	6	2475147	2475152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_016856	ATA	2	6	2475175	2475180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016856	GAA	2	6	2475240	2475245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016856	AT	3	6	2475280	2475285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_016856	CCA	2	6	2475337	2475342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_016856	TGC	2	6	2475399	2475404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016856	TCA	2	6	2475852	2475857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_016856	CCG	2	6	2475865	2475870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_016856	CGG	2	6	2475877	2475882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016856	CAT	2	6	2475890	2475895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_016856	CA	3	6	2478971	2478976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_016856	ATC	2	6	2479034	2479039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_016856	ATT	2	6	2479145	2479150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016856	CAA	2	6	2479205	2479210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016856	GTG	2	6	2489855	2489860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016856	GAAGT	2	10	2489898	2489907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016856	GCT	2	6	2489908	2489913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_016856	T	6	6	2491183	2491188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016856	A	7	7	2491598	2491604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_016856	T	6	6	2491618	2491623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016856	T	6	6	2491639	2491644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016856	CTTA	2	8	2492773	2492780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_016856	ATA	2	6	2492786	2492791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016856	AT	3	6	2492811	2492816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_016856	ATG	2	6	2492862	2492867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_016856	AT	3	6	2492927	2492932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_016856	TAT	2	6	2493040	2493045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_016856	AAT	2	6	2493050	2493055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_016856	ATT	2	6	2493096	2493101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016856	ATA	2	6	2493133	2493138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016856	ATTA	2	8	2493139	2493146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016856	CATT	2	8	2493157	2493164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_016856	C	6	6	2493190	2493195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5558	NC_016856	GCC	2	6	2493196	2493201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_016856	ATG	2	6	2493269	2493274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016856	TC	3	6	2493283	2493288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_016856	ACA	2	6	2493308	2493313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_016856	A	6	6	2493315	2493320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016856	CATA	2	8	2493354	2493361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_016856	A	7	7	2493365	2493371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_016856	CTAA	2	8	2493384	2493391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_016856	TCT	3	9	2493444	2493452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_016856	CGT	2	6	2493473	2493478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_016856	TCCC	2	8	2494806	2494813	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5569	NC_016856	GGC	2	6	2495464	2495469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_016856	TTC	2	6	2495492	2495497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5572	NC_016856	CTT	2	6	2498667	2498672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_016856	T	7	7	2499457	2499463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_016856	GGC	2	6	2502936	2502941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_016856	T	6	6	2503044	2503049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016856	CTT	2	6	2503084	2503089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_016856	CTTTG	2	10	2503104	2503113	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5578	NC_016856	CACG	2	8	2508194	2508201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_016856	A	6	6	2508894	2508899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_016856	TGT	2	6	2508911	2508916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_016856	CTT	2	6	2510523	2510528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_016856	CTC	2	6	2511129	2511134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_016856	TTC	2	6	2511849	2511854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_016856	CTG	2	6	2511876	2511881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_016856	TGA	2	6	2511887	2511892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_016856	CA	4	8	2511898	2511905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_016856	AGG	2	6	2511908	2511913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016856	CAT	2	6	2512625	2512630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_016856	ATG	2	6	2512633	2512638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_016856	A	6	6	2512656	2512661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_016856	TCC	2	6	2512716	2512721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_016856	GCC	2	6	2513668	2513673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_016856	CTT	2	6	2513677	2513682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_016856	CCTGT	2	10	2515865	2515874	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5595	NC_016856	TG	4	8	2515875	2515882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_016856	TAA	2	6	2515889	2515894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_016856	GGC	2	6	2515931	2515936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_016856	GCGCG	2	10	2517040	2517049	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5599	NC_016856	AAT	2	6	2518109	2518114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_016856	GCC	2	6	2520169	2520174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_016856	CGG	2	6	2520187	2520192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_016856	CTT	2	6	2522764	2522769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_016856	ATC	2	6	2522770	2522775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_016856	GAC	2	6	2522777	2522782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_016856	T	6	6	2524287	2524292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016856	AAT	2	6	2524298	2524303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016856	TCA	2	6	2524356	2524361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_016856	ACG	2	6	2524364	2524369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_016856	ACA	2	6	2524392	2524397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_016856	GGC	2	6	2528148	2528153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_016856	GC	3	6	2528220	2528225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_016856	GCT	2	6	2530182	2530187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_016856	GCCCT	2	10	2530223	2530232	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5614	NC_016856	TAT	2	6	2531190	2531195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_016856	A	6	6	2531276	2531281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_016856	ATT	2	6	2533878	2533883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_016856	AAG	2	6	2533898	2533903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_016856	GCC	2	6	2535099	2535104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_016856	AT	3	6	2535109	2535114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_016856	TAAT	2	8	2535138	2535145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_016856	TTTC	2	8	2537881	2537888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_016856	TGA	2	6	2537897	2537902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_016856	TCT	2	6	2537915	2537920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_016856	CTTT	2	8	2537937	2537944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_016856	CTTT	2	8	2537978	2537985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_016856	TCT	2	6	2538032	2538037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_016856	CAA	2	6	2538338	2538343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_016856	TAA	2	6	2538345	2538350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_016856	TTA	2	6	2538361	2538366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_016856	TTA	2	6	2538449	2538454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_016856	TGT	2	6	2540098	2540103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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