MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	AG	3	6	57	62	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016837	ATT	2	6	133	138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016837	CAA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016837	AGAA	2	8	407	414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016837	ATT	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016837	ATTC	2	8	484	491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016837	AAATG	2	10	498	507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016837	ATT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016837	T	9	9	540	548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016837	A	6	6	580	585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016837	ATA	2	6	2662	2667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016837	CT	3	6	2731	2736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016837	TAG	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016837	T	6	6	2832	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016837	GCTTC	2	10	3740	3749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016837	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016837	T	6	6	3765	3770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016837	AAGTTC	2	12	3773	3784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016837	TTTC	2	8	3802	3809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016837	TTC	2	6	3881	3886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016837	CTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016837	CTT	2	6	3943	3948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016837	TCT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016837	ATA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016837	TAT	2	6	4067	4072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016837	TCT	2	6	4099	4104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016837	AT	3	6	4182	4187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016837	A	7	7	4245	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016837	AGT	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016837	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016837	AAG	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016837	GAG	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016837	CTT	2	6	5768	5773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016837	CCG	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016837	GAAT	2	8	5825	5832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016837	TAAA	2	8	5856	5863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016837	AAG	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016837	GA	3	6	6131	6136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016837	AAT	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016837	TGG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016837	CGG	2	6	6378	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016837	A	7	7	6743	6749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016837	AT	5	10	7387	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016837	TAA	2	6	7449	7454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016837	TAA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016837	A	7	7	7462	7468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016837	A	6	6	7533	7538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016837	T	7	7	7564	7570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016837	ATT	2	6	7806	7811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016837	TAA	2	6	7823	7828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016837	GTTT	2	8	8335	8342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016837	ATT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016837	ATTA	2	8	8378	8385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016837	TAT	2	6	8783	8788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016837	ATA	2	6	8814	8819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016837	TTTA	2	8	8835	8842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016837	TA	3	6	8893	8898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016837	TA	5	10	9544	9553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016837	AAT	2	6	9619	9624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016837	CAA	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016837	T	7	7	10088	10094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016837	A	6	6	10098	10103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016837	T	6	6	10127	10132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016837	A	6	6	10137	10142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016837	AGG	2	6	10151	10156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016837	A	6	6	11057	11062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016837	T	7	7	11083	11089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016837	TTAC	2	8	11100	11107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016837	GTA	2	6	11268	11273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016837	CAG	3	9	11560	11568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016837	AAC	2	6	11585	11590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016837	TGT	2	6	11618	11623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016837	TTG	2	6	11650	11655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016837	ATT	2	6	11745	11750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016837	ATC	2	6	11840	11845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016837	A	6	6	11909	11914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016837	TTC	2	6	11983	11988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016837	TCC	2	6	13448	13453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016837	TAT	2	6	13481	13486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016837	CT	4	8	13575	13582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016837	GGT	2	6	13601	13606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016837	TTC	2	6	13662	13667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016837	TA	3	6	13677	13682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016837	T	6	6	14295	14300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016837	T	6	6	14323	14328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016837	A	9	9	14508	14516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016837	TGT	2	6	14553	14558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016837	AATCT	2	10	14566	14575	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016837	CTG	2	6	15033	15038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016837	A	6	6	15188	15193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016837	CTG	2	6	15234	15239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016837	ACG	2	6	15244	15249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016837	ATA	2	6	16105	16110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016837	TGA	2	6	16113	16118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016837	A	6	6	16130	16135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016837	TAA	2	6	16172	16177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016837	TAC	2	6	17600	17605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016837	TCTT	2	8	17749	17756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016837	A	7	7	17773	17779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016837	T	7	7	17935	17941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016837	AATTG	2	10	17965	17974	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016837	TTTG	2	8	17993	18000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016837	TAT	2	6	18011	18016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016837	TTC	2	6	18051	18056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016837	GTA	2	6	18078	18083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016837	A	7	7	18104	18110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016837	CTT	2	6	18577	18582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016837	AAG	2	6	19479	19484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016837	TACA	2	8	19510	19517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016837	CCTCA	2	10	19522	19531	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_016837	TAT	2	6	19569	19574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016837	A	7	7	19578	19584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016837	T	6	6	19615	19620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016837	TAT	2	6	19640	19645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016837	ATA	2	6	19647	19652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016837	A	6	6	19657	19662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016837	AT	3	6	19707	19712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016837	TTC	2	6	19714	19719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016837	AAC	3	9	19782	19790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016837	A	6	6	19818	19823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.