MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016833	AC	3	6	119932	119937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_016833	GGT	2	6	119968	119973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016833	GGT	2	6	120029	120034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016833	TAG	2	6	120047	120052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016833	G	6	6	120085	120090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016833	GCA	2	6	120194	120199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016833	TTCATT	2	12	120248	120259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
508	NC_016833	AAC	2	6	120332	120337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016833	CGG	2	6	120390	120395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016833	CTT	2	6	120401	120406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016833	GCA	2	6	120408	120413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016833	GTT	2	6	120416	120421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016833	GACA	2	8	120438	120445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_016833	CAC	2	6	120450	120455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_016833	GCA	2	6	120459	120464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016833	TCA	2	6	120539	120544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016833	C	6	6	120636	120641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
518	NC_016833	GTT	2	6	120689	120694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016833	TGC	2	6	120709	120714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_016833	GTTT	2	8	120721	120728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016833	TA	3	6	120767	120772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016833	ATT	2	6	120800	120805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016833	CAT	2	6	120821	120826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016833	ATA	2	6	120933	120938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016833	TAT	3	9	120944	120952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016833	T	7	7	120972	120978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016833	CAA	2	6	120998	121003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016833	A	6	6	121010	121015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016833	A	6	6	121030	121035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016833	AT	3	6	121113	121118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016833	ATT	3	9	121123	121131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016833	TAA	2	6	121148	121153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016833	A	6	6	121239	121244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016833	A	7	7	121251	121257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016833	CTT	2	6	121276	121281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016833	AAG	2	6	121290	121295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016833	A	6	6	121296	121301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016833	CAT	2	6	121373	121378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016833	CAA	2	6	121391	121396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016833	CCA	2	6	121398	121403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_016833	ACCC	2	8	121453	121460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
542	NC_016833	AAT	2	6	121483	121488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016833	GAA	2	6	121489	121494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016833	TCAT	2	8	121513	121520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_016833	A	6	6	121541	121546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016833	AAT	2	6	121596	121601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016833	TATCA	2	10	121621	121630	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
548	NC_016833	CTA	2	6	121648	121653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016833	AG	3	6	121825	121830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016833	GTT	2	6	121873	121878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016833	TTG	3	9	121884	121892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016833	ATT	2	6	121905	121910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016833	ATA	2	6	121921	121926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016833	AAACA	2	10	121933	121942	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
555	NC_016833	CAG	2	6	122001	122006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016833	TAA	2	6	122051	122056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016833	TGG	2	6	122524	122529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016833	TGC	2	6	122927	122932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016833	GAC	3	9	122958	122966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016833	TCCAC	2	10	123845	123854	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
561	NC_016833	TGT	2	6	123861	123866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016833	ATC	2	6	126637	126642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016833	ATTG	2	8	126676	126683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016833	T	6	6	126704	126709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016833	CAC	2	6	126761	126766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_016833	CAT	2	6	126790	126795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016833	TCA	2	6	127367	127372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016833	AGA	2	6	127386	127391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016833	T	6	6	127396	127401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016833	CTT	3	9	127488	127496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016833	A	7	7	127501	127507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016833	GGA	2	6	127536	127541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016833	CTT	2	6	127547	127552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016833	GCC	2	6	127673	127678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_016833	CTTA	2	8	127717	127724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_016833	TAA	2	6	127725	127730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016833	TTCAT	2	10	127807	127816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
578	NC_016833	TCAA	2	8	127837	127844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_016833	CGC	2	6	128034	128039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_016833	GCAG	2	8	128058	128065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_016833	CCA	2	6	128090	128095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_016833	CAT	2	6	128105	128110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016833	CAT	2	6	128127	128132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016833	TCGT	2	8	128146	128153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_016833	CAC	3	9	128205	128213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_016833	GCA	3	9	128225	128233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016833	GCCTGC	2	12	128248	128259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
588	NC_016833	CAG	2	6	128605	128610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_016833	TCA	2	6	128652	128657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016833	T	6	6	129483	129488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016833	GCG	2	6	129552	129557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_016833	GAA	2	6	129941	129946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016833	T	7	7	129949	129955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016833	AATAT	2	10	129970	129979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016833	AT	4	8	131222	131229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016833	ATA	2	6	131251	131256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016833	TTC	2	6	131270	131275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016833	AGAA	2	8	131458	131465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016833	ATT	2	6	131504	131509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016833	TAT	2	6	131514	131519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016833	T	7	7	131542	131548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016833	AT	3	6	131586	131591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016833	AT	3	6	131628	131633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016833	AT	3	6	131640	131645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016833	ATA	2	6	131703	131708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016833	ATG	2	6	135103	135108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016833	GTT	2	6	135275	135280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016833	CAA	2	6	135287	135292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016833	AT	3	6	135302	135307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016833	AGT	2	6	135350	135355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016833	TGA	2	6	137005	137010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016833	AGC	2	6	137143	137148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_016833	ACT	2	6	137150	137155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016833	AAC	2	6	137168	137173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016833	CTT	2	6	139040	139045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_016833	ACA	2	6	139261	139266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016833	CCG	2	6	139267	139272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_016833	GA	3	6	139304	139309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016833	GCT	2	6	139323	139328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016833	TTC	2	6	139873	139878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016833	TTG	2	6	139883	139888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016833	TAC	2	6	139911	139916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016833	AAC	2	6	140034	140039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_016833	GCCA	2	8	140064	140071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_016833	TGGC	2	8	140073	140080	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_016833	CGT	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016833	CGAT	2	8	140139	140146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
628	NC_016833	GTA	2	6	140189	140194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016833	CCT	2	6	140271	140276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_016833	C	6	6	140406	140411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
631	NC_016833	T	6	6	140445	140450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016833	TGCAGC	2	12	140456	140467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016833	ACA	2	6	140540	140545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016833	G	6	6	140634	140639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016833	CGC	2	6	140646	140651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_016833	GCG	2	6	140655	140660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016833	CAC	2	6	140734	140739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_016833	ATG	2	6	140755	140760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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974	NC_016833	AATA	2	8	214323	214330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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