MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14005	NC_016832	GCA	2	6	4355637	4355642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_016832	A	7	7	4355669	4355675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_016832	CCG	2	6	4358003	4358008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14009	NC_016832	ATT	2	6	4358085	4358090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_016832	TAA	2	6	4358094	4358099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_016832	ATT	2	6	4358111	4358116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_016832	CCG	2	6	4358135	4358140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_016832	ATT	2	6	4358156	4358161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_016832	T	7	7	4358160	4358166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_016832	CGGG	2	8	4359087	4359094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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14017	NC_016832	TTGC	2	8	4359105	4359112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14018	NC_016832	GGA	2	6	4359166	4359171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_016832	CG	3	6	4359279	4359284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14023	NC_016832	GGCG	2	8	4360796	4360803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14024	NC_016832	TC	3	6	4362265	4362270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14025	NC_016832	CG	3	6	4364062	4364067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14031	NC_016832	TG	3	6	4365503	4365508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14041	NC_016832	TTA	2	6	4368544	4368549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14043	NC_016832	TTAA	2	8	4368646	4368653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_016832	ATTT	2	8	4368678	4368685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14048	NC_016832	ATTTT	2	10	4368746	4368755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_016832	CAAT	2	8	4368783	4368790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14050	NC_016832	TAT	2	6	4368809	4368814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_016832	ATT	2	6	4368833	4368838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14054	NC_016832	A	6	6	4368879	4368884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_016832	GCG	2	6	4368942	4368947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14057	NC_016832	GCG	2	6	4369308	4369313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_016832	CG	3	6	4369321	4369326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_016832	TATT	2	8	4369352	4369359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_016832	TAT	2	6	4369380	4369385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14063	NC_016832	TGG	2	6	4369546	4369551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14065	NC_016832	CGG	3	9	4369589	4369597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14070	NC_016832	GC	3	6	4369956	4369961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14071	NC_016832	CG	4	8	4369972	4369979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14099	NC_016832	TGGTC	2	10	4371578	4371587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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14101	NC_016832	GC	3	6	4371646	4371651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14102	NC_016832	TGAC	2	8	4371701	4371708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_016832	TG	3	6	4371732	4371737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_016832	AGCG	2	8	4371751	4371758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14115	NC_016832	TTAC	2	8	4376170	4376177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14117	NC_016832	T	8	8	4376254	4376261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_016832	CT	4	8	4376271	4376278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_016832	TAA	2	6	4376280	4376285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14128	NC_016832	A	6	6	4376937	4376942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14130	NC_016832	ATT	2	6	4378141	4378146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14132	NC_016832	TA	3	6	4378182	4378187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14259	NC_016832	CTG	2	6	4398584	4398589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14381	NC_016832	TCT	2	6	4434057	4434062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14383	NC_016832	CGT	2	6	4434091	4434096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14386	NC_016832	CTA	2	6	4434187	4434192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14387	NC_016832	CACC	2	8	4434221	4434228	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14388	NC_016832	GGT	2	6	4434308	4434313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14389	NC_016832	CGA	2	6	4434355	4434360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14390	NC_016832	TAC	2	6	4434370	4434375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14391	NC_016832	CTT	3	9	4434437	4434445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14392	NC_016832	CTT	2	6	4434479	4434484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14393	NC_016832	GCCA	2	8	4434524	4434531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14394	NC_016832	CGA	2	6	4434539	4434544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14395	NC_016832	CGC	2	6	4434640	4434645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14396	NC_016832	TTCG	2	8	4434705	4434712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14397	NC_016832	A	6	6	4434738	4434743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14398	NC_016832	ACGG	2	8	4434777	4434784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14399	NC_016832	GTT	2	6	4434809	4434814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14401	NC_016832	TTCAT	2	10	4435059	4435068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14402	NC_016832	CTGA	2	8	4435093	4435100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14403	NC_016832	GT	3	6	4435121	4435126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14404	NC_016832	T	6	6	4435128	4435133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14405	NC_016832	T	6	6	4436108	4436113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14406	NC_016832	ATT	2	6	4436176	4436181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14408	NC_016832	A	6	6	4436285	4436290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14409	NC_016832	ACC	2	6	4436363	4436368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14410	NC_016832	GGT	2	6	4436495	4436500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14411	NC_016832	T	6	6	4436534	4436539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14412	NC_016832	TCT	2	6	4436670	4436675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14414	NC_016832	TCGC	2	8	4436697	4436704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14415	NC_016832	ACC	2	6	4437132	4437137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14418	NC_016832	GGCT	2	8	4437633	4437640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14419	NC_016832	GTT	2	6	4437651	4437656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14420	NC_016832	T	6	6	4437771	4437776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14421	NC_016832	AGG	2	6	4437818	4437823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14422	NC_016832	TAT	2	6	4437845	4437850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14423	NC_016832	CGT	2	6	4437861	4437866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14424	NC_016832	TTGTT	2	10	4437883	4437892	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14425	NC_016832	GAA	2	6	4438161	4438166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14426	NC_016832	ACC	2	6	4438932	4438937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14428	NC_016832	TAA	2	6	4442527	4442532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14430	NC_016832	T	7	7	4443504	4443510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14431	NC_016832	TGA	2	6	4443929	4443934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14432	NC_016832	CTA	2	6	4444181	4444186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14433	NC_016832	TTC	2	6	4444280	4444285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14439	NC_016832	AGA	2	6	4445962	4445967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14447	NC_016832	CACT	2	8	4446333	4446340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14448	NC_016832	GGA	2	6	4446350	4446355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14453	NC_016832	AAT	2	6	4446559	4446564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14457	NC_016832	GCG	2	6	4453192	4453197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14460	NC_016832	AAAATA	2	12	4453522	4453533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14463	NC_016832	CTAT	2	8	4453628	4453635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14464	NC_016832	AT	3	6	4453634	4453639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14469	NC_016832	A	6	6	4454410	4454415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14470	NC_016832	AACT	2	8	4454473	4454480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14471	NC_016832	A	8	8	4454531	4454538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14472	NC_016832	TGC	2	6	4454546	4454551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14474	NC_016832	AGC	2	6	4454564	4454569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14481	NC_016832	CA	3	6	4465022	4465027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14482	NC_016832	GCC	2	6	4465045	4465050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14488	NC_016832	GC	4	8	4470867	4470874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14489	NC_016832	GTT	2	6	4471044	4471049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14490	NC_016832	CCT	2	6	4471534	4471539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14492	NC_016832	TA	4	8	4471584	4471591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_016832	T	6	6	4471623	4471628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14497	NC_016832	AATC	2	8	4471792	4471799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14498	NC_016832	TGC	2	6	4471857	4471862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14499	NC_016832	CCG	2	6	4471931	4471936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14500	NC_016832	TCAT	2	8	4471980	4471987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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