MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016832	CCG	2	6	4189624	4189629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_016832	CGG	2	6	4189643	4189648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_016832	TCC	2	6	4189702	4189707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13504	NC_016832	CGC	2	6	4189748	4189753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13505	NC_016832	CAC	2	6	4189773	4189778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13506	NC_016832	CAGC	2	8	4189782	4189789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13507	NC_016832	TTC	2	6	4189816	4189821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_016832	GCG	2	6	4189894	4189899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_016832	GCA	2	6	4189911	4189916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_016832	GTC	2	6	4190101	4190106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_016832	GC	4	8	4190156	4190163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13512	NC_016832	TTG	2	6	4190831	4190836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_016832	GC	3	6	4190858	4190863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_016832	CCG	2	6	4192904	4192909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_016832	ACA	2	6	4192935	4192940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_016832	GCC	2	6	4192962	4192967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13517	NC_016832	TC	3	6	4192988	4192993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13518	NC_016832	GCG	2	6	4193005	4193010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_016832	GAA	2	6	4193064	4193069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_016832	AAC	2	6	4193088	4193093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_016832	T	7	7	4195689	4195695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_016832	TTC	2	6	4195745	4195750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_016832	CGT	2	6	4196364	4196369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_016832	TTA	2	6	4196481	4196486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_016832	ATC	2	6	4196502	4196507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_016832	A	7	7	4196514	4196520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_016832	T	7	7	4196535	4196541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_016832	TGT	2	6	4196779	4196784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_016832	CGG	2	6	4196791	4196796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_016832	ATA	2	6	4196882	4196887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_016832	CTT	2	6	4196933	4196938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_016832	GCC	2	6	4197812	4197817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_016832	GCG	2	6	4197828	4197833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_016832	T	8	8	4197835	4197842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_016832	AT	3	6	4197854	4197859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_016832	ATTTG	2	10	4197871	4197880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_016832	TTAAT	2	10	4198000	4198009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_016832	AAT	2	6	4198020	4198025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_016832	T	8	8	4198070	4198077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_016832	TG	3	6	4199905	4199910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_016832	TTA	2	6	4199919	4199924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_016832	TAAG	2	8	4200350	4200357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_016832	AAACT	2	10	4200381	4200390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13544	NC_016832	AAC	2	6	4200417	4200422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_016832	GGCG	2	8	4200928	4200935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13546	NC_016832	TAACT	2	10	4200961	4200970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13547	NC_016832	CT	3	6	4203145	4203150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13548	NC_016832	TTGAA	2	10	4204389	4204398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_016832	TTG	2	6	4204420	4204425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_016832	TATT	2	8	4204447	4204454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_016832	T	6	6	4204459	4204464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_016832	T	8	8	4204760	4204767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_016832	AG	3	6	4204796	4204801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_016832	GCGACA	2	12	4205808	4205819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_016832	ACG	2	6	4205820	4205825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_016832	AAAGA	2	10	4205853	4205862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_016832	GAG	2	6	4206097	4206102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_016832	AAT	2	6	4206122	4206127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_016832	GGA	2	6	4208035	4208040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_016832	TC	3	6	4208896	4208901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13561	NC_016832	GAA	2	6	4208934	4208939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_016832	AAG	2	6	4208968	4208973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_016832	CGT	2	6	4208992	4208997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_016832	AGG	2	6	4209169	4209174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_016832	T	6	6	4211148	4211153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_016832	T	7	7	4211204	4211210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_016832	AGT	3	9	4211233	4211241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_016832	AGT	2	6	4211965	4211970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_016832	GGA	2	6	4213262	4213267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13571	NC_016832	GTAC	2	8	4216910	4216917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13572	NC_016832	TAG	2	6	4216926	4216931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13578	NC_016832	CG	3	6	4217812	4217817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_016832	GTCT	2	8	4217876	4217883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13580	NC_016832	AG	3	6	4218371	4218376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_016832	GTA	2	6	4219800	4219805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13584	NC_016832	T	7	7	4219830	4219836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13588	NC_016832	TAT	2	6	4220762	4220767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_016832	A	7	7	4220854	4220860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_016832	T	6	6	4220946	4220951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_016832	AAAT	2	8	4221463	4221470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_016832	ATAA	2	8	4221480	4221487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_016832	TAAAA	2	10	4224219	4224228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_016832	ATT	2	6	4225771	4225776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_016832	GGGA	2	8	4225857	4225864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_016832	TGC	2	6	4227449	4227454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13598	NC_016832	TCA	2	6	4230199	4230204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13600	NC_016832	CAA	2	6	4230314	4230319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13601	NC_016832	A	6	6	4230324	4230329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_016832	A	6	6	4230335	4230340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_016832	A	7	7	4230350	4230356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_016832	TG	3	6	4230548	4230553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_016832	GGC	2	6	4230702	4230707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13613	NC_016832	GGA	2	6	4231110	4231115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_016832	TAA	2	6	4231128	4231133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_016832	GCA	2	6	4231136	4231141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13619	NC_016832	GGA	2	6	4231374	4231379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13621	NC_016832	GAA	2	6	4231637	4231642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_016832	TGC	2	6	4231713	4231718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_016832	GTC	2	6	4231725	4231730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_016832	TTG	2	6	4231786	4231791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_016832	CCGG	2	8	4231800	4231807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13626	NC_016832	GGA	2	6	4231838	4231843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_016832	TCA	2	6	4231863	4231868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13628	NC_016832	AC	3	6	4231889	4231894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13629	NC_016832	CGT	2	6	4231957	4231962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13630	NC_016832	AC	3	6	4232058	4232063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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