MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016832	GCT	2	6	3998887	3998892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_016832	CGG	2	6	3998923	3998928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_016832	GCCA	2	8	3998940	3998947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_016832	GCT	2	6	3999082	3999087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_016832	GCA	2	6	3999102	3999107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_016832	TC	3	6	3999184	3999189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13007	NC_016832	GTG	2	6	3999315	3999320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016832	GCT	2	6	3999334	3999339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016832	G	6	6	3999340	3999345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016832	CCT	2	6	3999356	3999361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_016832	CAC	2	6	3999399	3999404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13012	NC_016832	GGA	2	6	3999439	3999444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016832	CGC	2	6	3999470	3999475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_016832	GGT	2	6	3999507	3999512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_016832	CGG	2	6	3999521	3999526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_016832	CGG	2	6	3999674	3999679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_016832	GTT	2	6	3999744	3999749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_016832	AGTT	2	8	3999787	3999794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_016832	ACG	2	6	3999816	3999821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_016832	CTT	2	6	3999881	3999886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_016832	GAAA	2	8	3999972	3999979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_016832	CTG	2	6	4000069	4000074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_016832	T	7	7	4000092	4000098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016832	TTTG	2	8	4000103	4000110	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016832	GTT	2	6	4000123	4000128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_016832	ACT	2	6	4000254	4000259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_016832	A	6	6	4000273	4000278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016832	A	6	6	4000280	4000285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016832	ACA	2	6	4000319	4000324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_016832	AGA	2	6	4000342	4000347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016832	GAA	2	6	4000362	4000367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016832	AGCGC	2	10	4001996	4002005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13033	NC_016832	GA	4	8	4002095	4002102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016832	GGC	2	6	4006066	4006071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_016832	CGC	2	6	4006229	4006234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_016832	GCG	2	6	4006237	4006242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_016832	TAC	2	6	4006278	4006283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_016832	GC	3	6	4006302	4006307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_016832	TGG	2	6	4006342	4006347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_016832	CT	3	6	4007683	4007688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13041	NC_016832	TGC	2	6	4007698	4007703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_016832	GAG	2	6	4007962	4007967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_016832	AGT	2	6	4008036	4008041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_016832	CAG	2	6	4008108	4008113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_016832	CGG	2	6	4008162	4008167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_016832	CCG	2	6	4008424	4008429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13047	NC_016832	ATG	2	6	4012072	4012077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_016832	GAC	2	6	4012114	4012119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_016832	TGC	2	6	4012129	4012134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_016832	T	6	6	4019182	4019187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_016832	GCTG	2	8	4019188	4019195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_016832	TTG	2	6	4019240	4019245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_016832	GCA	2	6	4019299	4019304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_016832	CGC	2	6	4019413	4019418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13055	NC_016832	TGC	2	6	4019532	4019537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_016832	CGC	2	6	4019544	4019549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_016832	AGG	2	6	4019568	4019573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_016832	CGA	2	6	4019586	4019591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_016832	CCG	2	6	4019645	4019650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_016832	GAC	2	6	4019677	4019682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_016832	GCCC	2	8	4019695	4019702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13062	NC_016832	TAA	2	6	4019755	4019760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_016832	TGT	2	6	4019787	4019792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_016832	GCGG	2	8	4019799	4019806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13065	NC_016832	CAG	2	6	4019885	4019890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_016832	GCC	2	6	4019975	4019980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_016832	AGC	2	6	4019997	4020002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_016832	CG	4	8	4020029	4020036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_016832	CGG	2	6	4020051	4020056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_016832	GGC	2	6	4020071	4020076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_016832	GCA	2	6	4020094	4020099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_016832	GAC	2	6	4020119	4020124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_016832	GC	3	6	4020138	4020143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_016832	GGCA	2	8	4020147	4020154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13075	NC_016832	CGCGCC	2	12	4020173	4020184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_016832	CAG	3	9	4020223	4020231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_016832	CTG	2	6	4020251	4020256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_016832	CAG	2	6	4020284	4020289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_016832	AAT	2	6	4020311	4020316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_016832	CAG	2	6	4020341	4020346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_016832	GCTGGG	2	12	4020382	4020393	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13082	NC_016832	GC	3	6	4020407	4020412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13083	NC_016832	GCC	3	9	4020422	4020430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13084	NC_016832	TTA	2	6	4020436	4020441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_016832	CAG	2	6	4020443	4020448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_016832	CGC	2	6	4020516	4020521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_016832	GCC	2	6	4020527	4020532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13088	NC_016832	GCCA	2	8	4020554	4020561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_016832	GCG	2	6	4020562	4020567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_016832	CGA	2	6	4020574	4020579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_016832	GCA	2	6	4020613	4020618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_016832	CCG	3	9	4020670	4020678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_016832	CT	3	6	4020775	4020780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_016832	GCA	2	6	4020784	4020789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_016832	GCG	2	6	4020857	4020862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_016832	CCAG	2	8	4020888	4020895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_016832	GAAGCG	2	12	4020989	4021000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13098	NC_016832	CAG	2	6	4021010	4021015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_016832	GCA	2	6	4021057	4021062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_016832	GCG	2	6	4021076	4021081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_016832	CGC	2	6	4021087	4021092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_016832	GCG	2	6	4021181	4021186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_016832	CG	3	6	4021185	4021190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13104	NC_016832	GGC	2	6	4021198	4021203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_016832	CTGC	2	8	4021205	4021212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_016832	CGG	3	9	4021281	4021289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_016832	CGC	2	6	4021311	4021316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13108	NC_016832	GCC	2	6	4021330	4021335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_016832	CGC	3	9	4021366	4021374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_016832	CGC	2	6	4021435	4021440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13111	NC_016832	ATG	2	6	4021497	4021502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_016832	GCGT	2	8	4021527	4021534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13113	NC_016832	GCG	2	6	4021541	4021546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_016832	CAG	2	6	4021559	4021564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_016832	ATT	2	6	4021590	4021595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_016832	GGC	2	6	4021613	4021618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_016832	CGGA	2	8	4021671	4021678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13118	NC_016832	ATA	2	6	4021752	4021757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_016832	ACG	2	6	4021868	4021873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_016832	CGG	2	6	4021903	4021908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_016832	CGA	2	6	4021921	4021926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_016832	TCG	2	6	4021960	4021965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_016832	GCT	2	6	4021981	4021986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_016832	CAG	2	6	4022011	4022016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_016832	GCG	2	6	4022037	4022042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_016832	CGG	3	9	4022053	4022061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13251	NC_016832	CCG	2	6	4067893	4067898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13253	NC_016832	GAG	2	6	4068525	4068530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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