MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016832	GCT	2	6	3857694	3857699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_016832	GCA	2	6	3857714	3857719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_016832	AAT	2	6	3857747	3857752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_016832	ACA	2	6	3857756	3857761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_016832	TCATGT	2	12	3857785	3857796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12506	NC_016832	TCC	2	6	3857813	3857818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_016832	ACG	2	6	3857828	3857833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_016832	TTC	2	6	3857886	3857891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_016832	A	6	6	3857895	3857900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_016832	GGA	2	6	3857902	3857907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_016832	ATC	2	6	3861584	3861589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_016832	GTGTT	2	10	3861620	3861629	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_016832	A	6	6	3861672	3861677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_016832	T	6	6	3861693	3861698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_016832	ATC	2	6	3861719	3861724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_016832	GTT	2	6	3861796	3861801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_016832	GGT	2	6	3862298	3862303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_016832	ATT	2	6	3862311	3862316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_016832	CCA	2	6	3862344	3862349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_016832	GC	3	6	3862384	3862389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12521	NC_016832	GTA	2	6	3862408	3862413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_016832	GCC	2	6	3862447	3862452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12523	NC_016832	GCG	2	6	3862457	3862462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_016832	GATA	2	8	3862603	3862610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_016832	ATTC	2	8	3863339	3863346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12526	NC_016832	TTG	3	9	3863348	3863356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_016832	TGA	2	6	3863423	3863428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_016832	TTCT	2	8	3863466	3863473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12529	NC_016832	CAA	2	6	3863533	3863538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_016832	AG	3	6	3863577	3863582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_016832	ATT	2	6	3863584	3863589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_016832	A	6	6	3863595	3863600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_016832	ATT	2	6	3863644	3863649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_016832	AT	3	6	3863665	3863670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_016832	TTAT	2	8	3863686	3863693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_016832	GTT	2	6	3863739	3863744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_016832	TAA	2	6	3863769	3863774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_016832	TGC	2	6	3863801	3863806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_016832	T	6	6	3863807	3863812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_016832	AT	3	6	3863883	3863888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_016832	TA	3	6	3863901	3863906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_016832	AGG	2	6	3863982	3863987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_016832	GTG	2	6	3864160	3864165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_016832	ATA	2	6	3864234	3864239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_016832	ATT	2	6	3864296	3864301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_016832	CGCC	2	8	3864309	3864316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12547	NC_016832	GCT	2	6	3864321	3864326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12549	NC_016832	CGT	2	6	3864355	3864360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_016832	CAA	2	6	3864365	3864370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_016832	GAA	2	6	3864392	3864397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_016832	TGG	2	6	3864405	3864410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_016832	ATT	2	6	3864443	3864448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_016832	CGC	2	6	3864449	3864454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_016832	A	6	6	3864576	3864581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_016832	TGT	2	6	3865534	3865539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_016832	ACCT	2	8	3865602	3865609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_016832	GCT	2	6	3865704	3865709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_016832	TAT	2	6	3865742	3865747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_016832	TCA	2	6	3865795	3865800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_016832	CGG	2	6	3865856	3865861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_016832	ATC	2	6	3865863	3865868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_016832	ACC	2	6	3865924	3865929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12564	NC_016832	GC	3	6	3865961	3865966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_016832	CGAT	2	8	3866110	3866117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12566	NC_016832	TCAC	2	8	3866185	3866192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12567	NC_016832	GAC	2	6	3866194	3866199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12569	NC_016832	CTT	2	6	3866391	3866396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_016832	GTT	2	6	3866478	3866483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12572	NC_016832	CGG	2	6	3866529	3866534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12589	NC_016832	CAA	2	6	3867335	3867340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_016832	GCC	2	6	3867342	3867347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_016832	CGCC	2	8	3867386	3867393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12592	NC_016832	TC	3	6	3867512	3867517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12593	NC_016832	TAG	2	6	3867578	3867583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12597	NC_016832	GTA	2	6	3867727	3867732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_016832	CGA	2	6	3867754	3867759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_016832	TCG	2	6	3867846	3867851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_016832	TAA	3	9	3867961	3867969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_016832	ATT	2	6	3868028	3868033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_016832	TCCCG	2	10	3868094	3868103	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12603	NC_016832	GT	3	6	3868125	3868130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12605	NC_016832	CGG	2	6	3868280	3868285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_016832	GCTG	2	8	3868288	3868295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12607	NC_016832	GCC	2	6	3868335	3868340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12608	NC_016832	GGGA	2	8	3868342	3868349	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_016832	TGC	2	6	3868367	3868372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_016832	ATGA	2	8	3868389	3868396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_016832	CCT	2	6	3868422	3868427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_016832	AAT	2	6	3868459	3868464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12615	NC_016832	ATA	2	6	3869173	3869178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12621	NC_016832	GTGAT	2	10	3869440	3869449	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_016832	TTA	3	9	3869489	3869497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_016832	T	6	6	3869513	3869518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12626	NC_016832	TAATGC	2	12	3869632	3869643	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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