MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016832	ATTCAA	2	12	3251650	3251661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10502	NC_016832	GCA	2	6	3251715	3251720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_016832	T	7	7	3253574	3253580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_016832	TCG	2	6	3253586	3253591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_016832	CAC	2	6	3253652	3253657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_016832	ATCA	2	8	3253693	3253700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10507	NC_016832	ACAAA	2	10	3253732	3253741	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10508	NC_016832	TGA	2	6	3253795	3253800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_016832	TG	3	6	3253810	3253815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_016832	TTATTT	2	12	3253849	3253860	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_016832	TCC	2	6	3257936	3257941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10512	NC_016832	CGG	2	6	3257952	3257957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_016832	AC	3	6	3257995	3258000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_016832	TTTC	2	8	3258019	3258026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10515	NC_016832	ACA	2	6	3258059	3258064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_016832	GAA	2	6	3258089	3258094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_016832	GAAA	2	8	3258124	3258131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_016832	ACA	2	6	3258234	3258239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_016832	ATTG	2	8	3258244	3258251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_016832	TTTA	2	8	3258320	3258327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_016832	TGG	2	6	3258373	3258378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_016832	CTG	2	6	3258397	3258402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_016832	GAAC	2	8	3258406	3258413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10524	NC_016832	GCG	2	6	3258419	3258424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_016832	TAA	2	6	3258447	3258452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_016832	CGC	2	6	3258463	3258468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10527	NC_016832	GAC	2	6	3258512	3258517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_016832	GCC	2	6	3258554	3258559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_016832	AGC	2	6	3258571	3258576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_016832	AGA	2	6	3258577	3258582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_016832	GAA	2	6	3258593	3258598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_016832	TGC	2	6	3258697	3258702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_016832	GAA	2	6	3258749	3258754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_016832	ATT	2	6	3258815	3258820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_016832	GGC	2	6	3258835	3258840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_016832	CACT	2	8	3258969	3258976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_016832	AAC	2	6	3259038	3259043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_016832	TAC	2	6	3259106	3259111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_016832	ATTA	2	8	3259252	3259259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_016832	CGC	2	6	3259314	3259319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10541	NC_016832	ATT	2	6	3259328	3259333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_016832	GC	3	6	3259354	3259359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10543	NC_016832	ATA	2	6	3259883	3259888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_016832	AAAGG	2	10	3263577	3263586	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_016832	ATCA	2	8	3263631	3263638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10546	NC_016832	GTC	2	6	3264560	3264565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_016832	A	7	7	3264597	3264603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_016832	ATC	2	6	3268274	3268279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_016832	CAT	2	6	3269002	3269007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_016832	CCA	2	6	3269033	3269038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_016832	GGA	2	6	3269043	3269048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_016832	GGC	2	6	3271416	3271421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_016832	CAA	2	6	3271428	3271433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_016832	ATT	2	6	3271455	3271460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_016832	GCA	2	6	3271505	3271510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_016832	GAG	2	6	3272571	3272576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_016832	GCA	2	6	3273465	3273470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_016832	AGCGC	2	10	3273517	3273526	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10559	NC_016832	AAC	2	6	3273573	3273578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_016832	CT	4	8	3275982	3275989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10561	NC_016832	TC	3	6	3276012	3276017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10562	NC_016832	A	7	7	3276058	3276064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_016832	TTTAC	2	10	3276095	3276104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10564	NC_016832	GTA	2	6	3278021	3278026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_016832	GGC	2	6	3278046	3278051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_016832	TCA	2	6	3278065	3278070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_016832	AAC	3	9	3278132	3278140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_016832	TGAA	2	8	3279107	3279114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_016832	CAA	2	6	3279135	3279140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_016832	CCAG	2	8	3279146	3279153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10571	NC_016832	C	6	6	3279162	3279167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10572	NC_016832	CGT	2	6	3281368	3281373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_016832	TCT	2	6	3281384	3281389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_016832	AACCCT	2	12	3281412	3281423	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_016832	CG	3	6	3281449	3281454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10576	NC_016832	TCAT	2	8	3281473	3281480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10577	NC_016832	CAA	2	6	3281483	3281488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10578	NC_016832	TGC	2	6	3281509	3281514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_016832	CTG	2	6	3281518	3281523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10580	NC_016832	A	6	6	3281525	3281530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_016832	CGC	2	6	3281904	3281909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10582	NC_016832	AAT	2	6	3281921	3281926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_016832	GCG	2	6	3281941	3281946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_016832	CT	3	6	3281964	3281969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10585	NC_016832	A	6	6	3283359	3283364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_016832	ATC	2	6	3283429	3283434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10588	NC_016832	GGC	2	6	3283460	3283465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_016832	GAGC	2	8	3283511	3283518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10590	NC_016832	GAC	2	6	3283545	3283550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_016832	TTCC	2	8	3286239	3286246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_016832	A	7	7	3288259	3288265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_016832	A	6	6	3288301	3288306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_016832	CGG	2	6	3288352	3288357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_016832	T	7	7	3288380	3288386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_016832	CGA	2	6	3288473	3288478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_016832	CGA	2	6	3288496	3288501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_016832	GCT	2	6	3288510	3288515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_016832	CTG	2	6	3288573	3288578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_016832	GGACG	2	10	3288593	3288602	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10601	NC_016832	ATGA	2	8	3288666	3288673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_016832	GAT	2	6	3288777	3288782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_016832	ATTT	2	8	3288796	3288803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_016832	TCAA	2	8	3288846	3288853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10605	NC_016832	T	6	6	3290245	3290250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_016832	TCA	2	6	3290294	3290299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_016832	TAA	2	6	3290307	3290312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_016832	GGC	2	6	3290321	3290326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_016832	A	8	8	3290371	3290378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_016832	TCTT	2	8	3290393	3290400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10611	NC_016832	ACC	2	6	3290455	3290460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10612	NC_016832	CCA	2	6	3290484	3290489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10613	NC_016832	A	7	7	3290992	3290998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_016832	GTT	2	6	3291009	3291014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_016832	T	6	6	3291013	3291018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_016832	GGC	2	6	3291030	3291035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_016832	CCG	2	6	3291038	3291043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10618	NC_016832	TGT	2	6	3293331	3293336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_016832	TTA	2	6	3295304	3295309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_016832	TTTC	2	8	3295350	3295357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10621	NC_016832	CT	3	6	3296507	3296512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10622	NC_016832	CTTT	2	8	3296546	3296553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10623	NC_016832	CAA	2	6	3296563	3296568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_016832	GTA	2	6	3297272	3297277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_016832	CA	3	6	3301064	3301069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10626	NC_016832	A	6	6	3301152	3301157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_016832	A	6	6	3301748	3301753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10629	NC_016832	GAA	2	6	3301866	3301871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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