MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016832	ATT	2	6	3124284	3124289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_016832	AAT	2	6	3124303	3124308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_016832	A	6	6	3125767	3125772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_016832	CAAT	2	8	3125833	3125840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10005	NC_016832	GGC	2	6	3125869	3125874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_016832	AAAT	2	8	3125898	3125905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_016832	AAAT	2	8	3125968	3125975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_016832	ATG	2	6	3125994	3125999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_016832	ATA	2	6	3126028	3126033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_016832	TGGC	2	8	3126103	3126110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_016832	AAG	2	6	3126139	3126144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_016832	CTT	2	6	3127343	3127348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_016832	AG	3	6	3130405	3130410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016832	AAAC	2	8	3130520	3130527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_016832	TCT	2	6	3130535	3130540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_016832	T	7	7	3130550	3130556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016832	TGA	2	6	3130606	3130611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_016832	TAA	2	6	3130633	3130638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_016832	TTA	2	6	3131716	3131721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016832	TAT	2	6	3131755	3131760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_016832	AAT	2	6	3131848	3131853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_016832	AAT	2	6	3131871	3131876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_016832	AAT	2	6	3131940	3131945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_016832	AAT	3	9	3131951	3131959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_016832	TAA	2	6	3132070	3132075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_016832	AT	3	6	3132094	3132099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_016832	GCG	2	6	3132154	3132159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_016832	AGCG	2	8	3132217	3132224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_016832	AAT	2	6	3132251	3132256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_016832	ATT	2	6	3132264	3132269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_016832	CGTT	2	8	3132305	3132312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_016832	ACA	2	6	3132320	3132325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_016832	CGA	2	6	3132356	3132361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10035	NC_016832	TCG	2	6	3134372	3134377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_016832	GCT	2	6	3134412	3134417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_016832	ACC	2	6	3134431	3134436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_016832	GTA	2	6	3135341	3135346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_016832	GTC	2	6	3135349	3135354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_016832	CTG	2	6	3135372	3135377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_016832	CGCTT	2	10	3135379	3135388	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10042	NC_016832	AT	3	6	3137172	3137177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_016832	AAT	2	6	3137179	3137184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_016832	ATA	2	6	3137207	3137212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016832	ACC	2	6	3137482	3137487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_016832	CCT	2	6	3144270	3144275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_016832	TA	3	6	3144283	3144288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_016832	TA	3	6	3144295	3144300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_016832	T	6	6	3144336	3144341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_016832	TCA	2	6	3144366	3144371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_016832	TCG	2	6	3144421	3144426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_016832	GTT	2	6	3144433	3144438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016832	CTG	2	6	3144464	3144469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_016832	TCC	2	6	3144486	3144491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_016832	GCC	3	9	3144507	3144515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_016832	GCG	2	6	3144516	3144521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_016832	GCG	2	6	3144540	3144545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_016832	TTG	2	6	3144548	3144553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016832	CGCCA	2	10	3144578	3144587	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10060	NC_016832	GA	3	6	3144592	3144597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_016832	TCG	2	6	3144643	3144648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_016832	CGC	2	6	3144661	3144666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_016832	TCG	2	6	3144682	3144687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_016832	GC	3	6	3144709	3144714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_016832	TTTC	2	8	3144757	3144764	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_016832	GCC	2	6	3144765	3144770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_016832	ACC	2	6	3144810	3144815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_016832	GTA	2	6	3144909	3144914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_016832	CTG	2	6	3144926	3144931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_016832	GGC	2	6	3145007	3145012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_016832	GGC	2	6	3145085	3145090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_016832	TTC	2	6	3145094	3145099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_016832	TTC	2	6	3145115	3145120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_016832	AG	3	6	3145130	3145135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_016832	TTA	2	6	3145140	3145145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_016832	CGCGC	2	10	3145163	3145172	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10077	NC_016832	CG	3	6	3145232	3145237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_016832	GGCT	2	8	3145287	3145294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_016832	CTG	2	6	3145322	3145327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_016832	CAT	2	6	3145352	3145357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10082	NC_016832	TAA	2	6	3145414	3145419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_016832	CG	3	6	3145520	3145525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_016832	TGC	2	6	3145581	3145586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_016832	ACA	2	6	3145639	3145644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_016832	TCC	2	6	3145695	3145700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10087	NC_016832	CGGG	2	8	3145731	3145738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10088	NC_016832	GCC	3	9	3145754	3145762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_016832	CATC	2	8	3145771	3145778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_016832	TTCC	2	8	3145870	3145877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10091	NC_016832	ACCC	2	8	3145910	3145917	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10092	NC_016832	A	6	6	3145933	3145938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_016832	GCA	2	6	3145981	3145986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_016832	TCA	2	6	3146025	3146030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_016832	AT	3	6	3146069	3146074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_016832	T	7	7	3146088	3146094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_016832	TA	3	6	3146127	3146132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_016832	TTA	2	6	3146162	3146167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_016832	GTA	2	6	3146186	3146191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_016832	AAG	2	6	3146235	3146240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_016832	CCG	2	6	3146283	3146288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_016832	CGG	2	6	3146293	3146298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_016832	ACA	2	6	3146842	3146847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_016832	T	8	8	3147380	3147387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016832	TGT	2	6	3148294	3148299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_016832	GTA	2	6	3148345	3148350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_016832	A	6	6	3149340	3149345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_016832	CAG	2	6	3149383	3149388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_016832	A	6	6	3150692	3150697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_016832	CA	3	6	3150736	3150741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_016832	TGGA	2	8	3152008	3152015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_016832	AT	3	6	3152017	3152022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_016832	TTG	2	6	3152052	3152057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_016832	GA	3	6	3153869	3153874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_016832	TC	3	6	3153877	3153882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_016832	ATG	2	6	3153894	3153899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10118	NC_016832	T	6	6	3155120	3155125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_016832	CAT	2	6	3155219	3155224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_016832	AGCA	2	8	3155294	3155301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_016832	ATCG	2	8	3155347	3155354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10122	NC_016832	GAA	2	6	3155382	3155387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_016832	AGC	2	6	3155408	3155413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_016832	CAC	2	6	3155441	3155446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_016832	A	6	6	3155502	3155507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_016832	GCG	2	6	3155797	3155802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_016832	CGCC	2	8	3155857	3155864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10128	NC_016832	CGG	2	6	3156041	3156046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_016832	CGA	2	6	3156075	3156080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_016832	GTC	2	6	3156082	3156087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_016832	T	6	6	3156092	3156097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_016832	CA	4	8	3156150	3156157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10133	NC_016832	ATT	2	6	3156166	3156171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_016832	TAT	2	6	3156199	3156204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_016832	AAT	2	6	3158278	3158283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10137	NC_016832	A	7	7	3160529	3160535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_016832	TGGAA	2	10	3160561	3160570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_016832	TC	3	6	3162082	3162087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_016832	CAAT	2	8	3162092	3162099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10143	NC_016832	CG	3	6	3164570	3164575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10245	NC_016832	GCGCT	2	10	3202129	3202138	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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10248	NC_016832	A	6	6	3203099	3203104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_016832	ATT	2	6	3203111	3203116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_016832	CCTG	2	8	3203487	3203494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_016832	TAT	2	6	3203536	3203541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_016832	TAAA	2	8	3203554	3203561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_016832	CCG	2	6	3204295	3204300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_016832	CG	3	6	3204299	3204304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10255	NC_016832	CCA	2	6	3204313	3204318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10256	NC_016832	TGC	2	6	3204359	3204364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10258	NC_016832	ATG	2	6	3204424	3204429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10260	NC_016832	A	6	6	3205573	3205578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_016832	AGC	3	9	3205597	3205605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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