MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 15464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016832	TCG	2	6	2544675	2544680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_016832	AGC	2	6	2544744	2544749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_016832	ATTGT	2	10	2544792	2544801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_016832	ATCAT	2	10	2545726	2545735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8005	NC_016832	ATA	2	6	2545762	2545767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016832	AC	3	6	2546423	2546428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_016832	GGAG	2	8	2548424	2548431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_016832	TA	3	6	2548861	2548866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_016832	ACC	2	6	2548891	2548896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_016832	TTAC	2	8	2548911	2548918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_016832	AT	3	6	2548927	2548932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_016832	ATTG	2	8	2548938	2548945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_016832	TGT	2	6	2549131	2549136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_016832	TTA	2	6	2549421	2549426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_016832	GAA	2	6	2549451	2549456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_016832	GAA	2	6	2549497	2549502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_016832	AAT	2	6	2549512	2549517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_016832	CGC	2	6	2549527	2549532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_016832	ATA	2	6	2549565	2549570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_016832	A	6	6	2549578	2549583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_016832	AAT	2	6	2549585	2549590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_016832	TTTAA	2	10	2549656	2549665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_016832	TTAGC	2	10	2550939	2550948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8024	NC_016832	TGG	2	6	2550964	2550969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_016832	TCA	2	6	2551015	2551020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_016832	TA	3	6	2551042	2551047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_016832	CAA	2	6	2553222	2553227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_016832	GCGA	2	8	2553251	2553258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_016832	ATC	2	6	2553449	2553454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_016832	GC	3	6	2553782	2553787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_016832	CTT	2	6	2556159	2556164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_016832	GCT	2	6	2556177	2556182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_016832	CGG	2	6	2556187	2556192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_016832	CGA	2	6	2556280	2556285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_016832	CAG	2	6	2556296	2556301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_016832	CCG	2	6	2556370	2556375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_016832	T	6	6	2556381	2556386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_016832	T	6	6	2556394	2556399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_016832	GCC	2	6	2556421	2556426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_016832	GTA	2	6	2556429	2556434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_016832	ACC	2	6	2556447	2556452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_016832	GTC	2	6	2557636	2557641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_016832	AAT	2	6	2558317	2558322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_016832	GA	3	6	2558377	2558382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_016832	ACC	2	6	2559952	2559957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_016832	ATT	2	6	2560075	2560080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_016832	GGAA	2	8	2560107	2560114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_016832	GCA	2	6	2560115	2560120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_016832	CAT	2	6	2560140	2560145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_016832	CAT	2	6	2560182	2560187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_016832	CCG	2	6	2560224	2560229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_016832	ATC	3	9	2560282	2560290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_016832	ACC	2	6	2560297	2560302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_016832	AGT	2	6	2560315	2560320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_016832	ATC	2	6	2560324	2560329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_016832	TAGAA	2	10	2560344	2560353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_016832	GAC	2	6	2560378	2560383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_016832	GTT	2	6	2560417	2560422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_016832	CAA	2	6	2560452	2560457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_016832	CAT	2	6	2560470	2560475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_016832	TAATAT	2	12	2560683	2560694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_016832	CAG	2	6	2560731	2560736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_016832	TCA	2	6	2560817	2560822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_016832	ATC	3	9	2560858	2560866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_016832	AAG	2	6	2560932	2560937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_016832	ATA	2	6	2561011	2561016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_016832	ACC	2	6	2561101	2561106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_016832	ATC	2	6	2561134	2561139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_016832	GTA	2	6	2561189	2561194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_016832	CTC	2	6	2561284	2561289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_016832	AAC	2	6	2561598	2561603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_016832	TA	3	6	2561657	2561662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_016832	AAG	2	6	2561664	2561669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_016832	GCC	3	9	2561681	2561689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8075	NC_016832	CTGC	2	8	2561732	2561739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_016832	GCG	2	6	2562774	2562779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_016832	GCC	2	6	2562784	2562789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_016832	CTG	2	6	2564780	2564785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_016832	ATT	2	6	2567463	2567468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_016832	CCGTA	2	10	2567498	2567507	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8081	NC_016832	GGC	2	6	2567545	2567550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_016832	CAAAG	2	10	2568505	2568514	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8083	NC_016832	GAAAA	2	10	2568612	2568621	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_016832	A	6	6	2568693	2568698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_016832	CCG	2	6	2570446	2570451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_016832	ATG	2	6	2570473	2570478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_016832	TAT	2	6	2570779	2570784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_016832	CAT	2	6	2570790	2570795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8091	NC_016832	ATC	2	6	2570931	2570936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_016832	TAA	2	6	2570949	2570954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_016832	ATT	2	6	2573793	2573798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_016832	A	6	6	2573856	2573861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_016832	GCG	2	6	2573890	2573895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_016832	AAT	2	6	2575013	2575018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_016832	GA	3	6	2575038	2575043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_016832	GA	3	6	2575101	2575106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_016832	TCCC	2	8	2577675	2577682	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8100	NC_016832	TA	3	6	2577686	2577691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_016832	GAAAC	2	10	2577731	2577740	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8102	NC_016832	T	8	8	2577793	2577800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_016832	GGCT	2	8	2577803	2577810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8104	NC_016832	GTC	2	6	2577847	2577852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_016832	GTA	2	6	2577871	2577876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_016832	CAAAA	2	10	2577951	2577960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8107	NC_016832	A	7	7	2577957	2577963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_016832	ACGGG	2	10	2578059	2578068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8109	NC_016832	CGCT	2	8	2578095	2578102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_016832	GCG	2	6	2578105	2578110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_016832	CAA	2	6	2583136	2583141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_016832	A	6	6	2583158	2583163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_016832	GAT	2	6	2583170	2583175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_016832	CAT	2	6	2583201	2583206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_016832	TGT	2	6	2583214	2583219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_016832	AGG	2	6	2583244	2583249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_016832	GCG	2	6	2584585	2584590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_016832	CGT	2	6	2584608	2584613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_016832	TG	3	6	2585044	2585049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_016832	GC	4	8	2585726	2585733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_016832	GCG	2	6	2585743	2585748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_016832	CG	4	8	2585747	2585754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_016832	AT	3	6	2585765	2585770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_016832	CGA	2	6	2586119	2586124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_016832	ATA	2	6	2586174	2586179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_016832	AAT	3	9	2586898	2586906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_016832	TAA	2	6	2587013	2587018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_016832	GTT	2	6	2587056	2587061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_016832	TAA	2	6	2587077	2587082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_016832	TCA	2	6	2587085	2587090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8132	NC_016832	ATATT	2	10	2587175	2587184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8134	NC_016832	CA	3	6	2587802	2587807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8247	NC_016832	A	6	6	2620972	2620977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8248	NC_016832	AAGA	2	8	2620984	2620991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8257	NC_016832	GT	3	6	2625532	2625537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8259	NC_016832	CGC	2	6	2626498	2626503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8396	NC_016832	A	6	6	2641916	2641921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8397	NC_016832	TCA	2	6	2641933	2641938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8398	NC_016832	AAAT	2	8	2649405	2649412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8399	NC_016832	AGA	2	6	2649483	2649488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_016832	CATAA	2	10	2649541	2649550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8401	NC_016832	ATAA	2	8	2649563	2649570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_016832	ATTTT	2	10	2649595	2649604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8403	NC_016832	GCATT	2	10	2649624	2649633	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8404	NC_016832	TAA	2	6	2649649	2649654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8407	NC_016832	CCA	2	6	2649787	2649792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8417	NC_016832	CTGA	2	8	2651566	2651573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8420	NC_016832	ATT	2	6	2651603	2651608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8424	NC_016832	ATT	2	6	2651821	2651826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8427	NC_016832	ACC	2	6	2652841	2652846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8428	NC_016832	CCCG	2	8	2653683	2653690	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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8434	NC_016832	GCA	2	6	2653932	2653937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8435	NC_016832	ATCA	2	8	2653951	2653958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8436	NC_016832	CCA	2	6	2653986	2653991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8487	NC_016832	TTCA	2	8	2655794	2655801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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