MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016831	GAG	2	6	995625	995630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016831	CGG	2	6	995957	995962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016831	CTG	2	6	996000	996005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_016831	G	8	8	996034	996041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016831	GC	4	8	996619	996626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_016831	GCC	2	6	996678	996683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_016831	CG	4	8	998010	998017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_016831	GC	3	6	999329	999334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_016831	GGATC	2	10	999385	999394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_016831	CA	3	6	999403	999408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_016831	CTTA	2	8	999421	999428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_016831	TCA	2	6	1003952	1003957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_016831	CAC	2	6	1003989	1003994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_016831	ATG	2	6	1004054	1004059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016831	CTG	2	6	1004095	1004100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_016831	TTC	2	6	1004146	1004151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_016831	CTT	2	6	1004169	1004174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016831	TCA	2	6	1004193	1004198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_016831	TTTGA	2	10	1004208	1004217	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016831	ATG	2	6	1005506	1005511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016831	ATC	2	6	1005525	1005530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_016831	TAATTA	2	12	1005550	1005561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016831	TTG	2	6	1006664	1006669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016831	ATT	2	6	1006673	1006678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016831	TG	3	6	1006708	1006713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016831	TGCC	2	8	1006743	1006750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_016831	T	6	6	1006758	1006763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016831	AGC	2	6	1007853	1007858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_016831	CAG	2	6	1008449	1008454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016831	TAA	2	6	1009422	1009427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016831	TC	3	6	1010577	1010582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_016831	GAT	2	6	1010592	1010597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016831	GA	3	6	1010662	1010667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016831	C	6	6	1010943	1010948	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4035	NC_016831	TCT	2	6	1010996	1011001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_016831	TAA	2	6	1011024	1011029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016831	GGA	2	6	1011058	1011063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016831	TTCA	2	8	1011107	1011114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_016831	T	7	7	1011117	1011123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016831	TGT	2	6	1011128	1011133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016831	ATT	2	6	1011137	1011142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016831	TCA	2	6	1011163	1011168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_016831	A	6	6	1011180	1011185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016831	ACAT	2	8	1011204	1011211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_016831	AT	4	8	1011499	1011506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016831	AT	3	6	1011520	1011525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016831	TAA	2	6	1012594	1012599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016831	A	8	8	1012667	1012674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016831	GC	3	6	1012683	1012688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_016831	CAGCG	2	10	1013229	1013238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4051	NC_016831	A	10	10	1013241	1013250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016831	AGC	2	6	1013302	1013307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_016831	GGC	2	6	1013352	1013357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_016831	GCC	2	6	1013369	1013374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_016831	TCC	2	6	1014037	1014042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_016831	GGA	2	6	1014070	1014075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016831	TCT	2	6	1015333	1015338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_016831	GCG	3	9	1015344	1015352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_016831	T	6	6	1015358	1015363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016831	T	7	7	1015385	1015391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016831	TCA	2	6	1015420	1015425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_016831	GCA	2	6	1015433	1015438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_016831	A	6	6	1015443	1015448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016831	AGGA	2	8	1015521	1015528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016831	GTA	2	6	1017752	1017757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016831	AAT	2	6	1017787	1017792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016831	TA	3	6	1017840	1017845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016831	AAT	2	6	1017878	1017883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016831	CAT	2	6	1020415	1020420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_016831	AATA	2	8	1021185	1021192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016831	CG	4	8	1021224	1021231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_016831	GGA	2	6	1021271	1021276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016831	AGG	2	6	1022105	1022110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016831	AGTC	2	8	1022833	1022840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_016831	GCC	2	6	1025628	1025633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_016831	AAC	2	6	1028467	1028472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_016831	CAT	2	6	1028497	1028502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016831	CGC	2	6	1028539	1028544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_016831	TAA	2	6	1028569	1028574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016831	CAA	2	6	1028578	1028583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_016831	GGC	2	6	1028651	1028656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_016831	ATG	2	6	1028700	1028705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016831	GC	3	6	1028730	1028735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_016831	AGC	2	6	1028744	1028749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_016831	CTG	2	6	1028792	1028797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016831	T	7	7	1028836	1028842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016831	GCG	2	6	1028882	1028887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_016831	ACC	2	6	1028936	1028941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_016831	CAA	2	6	1029007	1029012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016831	CGG	2	6	1029163	1029168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_016831	GGC	2	6	1029232	1029237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_016831	CCGAC	2	10	1029252	1029261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4093	NC_016831	GCC	2	6	1029290	1029295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_016831	CGG	2	6	1029340	1029345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_016831	CGTTC	2	10	1029354	1029363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4096	NC_016831	GTTGGC	2	12	1029400	1029411	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4097	NC_016831	GCA	2	6	1029433	1029438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016831	CTT	2	6	1029478	1029483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_016831	GGT	2	6	1029499	1029504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016831	TAA	2	6	1029517	1029522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016831	GGT	2	6	1029553	1029558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016831	ACC	2	6	1029641	1029646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_016831	TCT	2	6	1029736	1029741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_016831	TCG	2	6	1029762	1029767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_016831	CAA	2	6	1029910	1029915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_016831	CAG	2	6	1029982	1029987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_016831	CAC	2	6	1029988	1029993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_016831	CGA	2	6	1030054	1030059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016831	CAG	2	6	1030085	1030090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_016831	TAT	2	6	1030091	1030096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016831	A	6	6	1031335	1031340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016831	ATT	2	6	1034596	1034601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016831	GAC	2	6	1034610	1034615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016831	AGC	2	6	1034768	1034773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_016831	AGA	2	6	1034792	1034797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016831	TGC	2	6	1034869	1034874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_016831	TGA	2	6	1034877	1034882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016831	CAT	2	6	1034948	1034953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016831	T	6	6	1035018	1035023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016831	TAA	2	6	1035046	1035051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016831	TG	3	6	1035116	1035121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016831	C	6	6	1035151	1035156	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4123	NC_016831	CT	3	6	1036120	1036125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_016831	ATA	2	6	1036160	1036165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016831	TTTTG	2	10	1036167	1036176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016831	G	6	6	1037046	1037051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016831	ACTGA	2	10	1037207	1037216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4128	NC_016831	T	6	6	1038099	1038104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016831	ATG	2	6	1038122	1038127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016831	TG	3	6	1038211	1038216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016831	ATT	2	6	1038220	1038225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016831	GC	3	6	1038286	1038291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_016831	GCC	2	6	1040273	1040278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4135	NC_016831	TTA	2	6	1043002	1043007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_016831	TAAT	2	8	1049117	1049124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_016831	AAATA	2	10	1084533	1084542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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