MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016831	CGG	2	6	405113	405118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016831	CGG	2	6	405162	405167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016831	GCA	2	6	405185	405190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_016831	ATC	2	6	405193	405198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016831	CCCG	2	8	405206	405213	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1506	NC_016831	CGG	2	6	405242	405247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016831	ACG	3	9	405352	405360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016831	GCG	2	6	405413	405418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016831	AAC	2	6	405442	405447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016831	TCG	2	6	405461	405466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_016831	ACG	2	6	405482	405487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016831	GCG	2	6	405491	405496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016831	ACG	2	6	405536	405541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_016831	CGG	2	6	405549	405554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_016831	CAG	2	6	405568	405573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016831	CCG	2	6	405611	405616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_016831	CGG	2	6	405669	405674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016831	AAC	2	6	405698	405703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016831	CTGC	2	8	405714	405721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_016831	CGG	2	6	405734	405739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016831	TCA	3	9	405821	405829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016831	GCC	2	6	405856	405861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_016831	CG	3	6	405881	405886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_016831	GC	3	6	405900	405905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_016831	AGG	2	6	405911	405916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016831	CGG	4	12	405926	405937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_016831	AGC	2	6	405967	405972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_016831	ACGCTG	2	12	406009	406020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_016831	GCG	2	6	406037	406042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_016831	CGC	2	6	406055	406060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_016831	CGG	2	6	406064	406069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_016831	GC	3	6	406094	406099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_016831	ACT	2	6	406151	406156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016831	CAG	2	6	406185	406190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016831	GGCGT	2	10	406192	406201	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1536	NC_016831	GCT	2	6	406212	406217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016831	CTA	2	6	406269	406274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016831	GGC	2	6	406333	406338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016831	ACCG	2	8	406356	406363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_016831	CAA	3	9	406446	406454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_016831	TGG	2	6	406468	406473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016831	CGG	2	6	406520	406525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016831	ACG	2	6	406538	406543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_016831	ATG	2	6	406547	406552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016831	ACG	2	6	406558	406563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016831	TAC	2	6	406579	406584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016831	CGC	2	6	406604	406609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_016831	GCC	3	9	406615	406623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_016831	CTGACG	2	12	406627	406638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016831	ACC	2	6	406657	406662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_016831	GAA	2	6	406677	406682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016831	GCC	2	6	406696	406701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_016831	CGC	2	6	406719	406724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_016831	CTG	2	6	406864	406869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016831	CCG	2	6	406946	406951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_016831	GCC	2	6	406972	406977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_016831	GCA	2	6	406988	406993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_016831	GACA	2	8	406998	407005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_016831	GCT	2	6	407118	407123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_016831	GC	3	6	407124	407129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_016831	CGG	2	6	407144	407149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_016831	TA	3	6	407276	407281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016831	G	6	6	407345	407350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016831	CAGT	2	8	407385	407392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_016831	ATA	3	9	407414	407422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016831	GAA	2	6	407538	407543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016831	CGC	2	6	407591	407596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_016831	CGGG	2	8	407641	407648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_016831	CGG	2	6	407667	407672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_016831	GAT	2	6	407803	407808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016831	CGA	2	6	407847	407852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016831	GCT	2	6	407982	407987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016831	GGC	2	6	407988	407993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_016831	TGG	2	6	408199	408204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016831	GCG	2	6	408205	408210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016831	GCG	2	6	408257	408262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_016831	GT	3	6	408304	408309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016831	GCG	2	6	408382	408387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_016831	AGC	2	6	408436	408441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_016831	GCCA	2	8	408583	408590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_016831	ACC	3	9	408598	408606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_016831	CGGATA	2	12	408767	408778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1583	NC_016831	GTT	2	6	408783	408788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016831	TGCA	2	8	408896	408903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_016831	ACA	2	6	408938	408943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016831	ATA	2	6	408992	408997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016831	AGC	2	6	409081	409086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016831	GCG	2	6	409097	409102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_016831	GGCA	2	8	409143	409150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_016831	CGTG	2	8	409166	409173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_016831	TAT	2	6	409182	409187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016831	AAT	2	6	409202	409207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016831	CATT	2	8	409252	409259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_016831	CCA	2	6	409287	409292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_016831	CG	3	6	409301	409306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_016831	TA	3	6	409355	409360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016831	AAT	2	6	409366	409371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016831	GGC	2	6	409386	409391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_016831	AGCG	2	8	409393	409400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_016831	AAGT	2	8	409420	409427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016831	CGCAGC	2	12	409444	409455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_016831	ATTT	3	12	409535	409546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016831	AT	3	6	409549	409554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016831	TTA	2	6	409559	409564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016831	TTA	2	6	409588	409593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016831	TAA	2	6	409670	409675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016831	ATA	2	6	409686	409691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016831	TTAT	2	8	409736	409743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016831	TTA	2	6	409818	409823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016831	CGGG	2	8	415582	415589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_016831	CAG	2	6	417104	417109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016831	A	7	7	417161	417167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016831	TTA	2	6	417212	417217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016831	TTC	2	6	418710	418715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016831	ATTT	2	8	418737	418744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016831	TCCT	2	8	420363	420370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_016831	TTTA	2	8	420425	420432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016831	GGC	2	6	420471	420476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016831	ATA	2	6	420868	420873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016831	TTC	2	6	420880	420885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_016831	TA	3	6	420889	420894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016831	TTC	2	6	421052	421057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_016831	ATC	2	6	421082	421087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_016831	TTTC	2	8	421177	421184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_016831	TC	3	6	421191	421196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_016831	AACGA	2	10	421326	421335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_016831	ATT	2	6	421341	421346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016831	ACAAA	2	10	421419	421428	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_016831	TCC	2	6	421459	421464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_016831	GTTGAG	2	12	421588	421599	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016831	CA	3	6	421626	421631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_016831	CAGG	2	8	421781	421788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_016831	CTT	2	6	421869	421874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_016831	TTC	2	6	422148	422153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_016831	GCA	2	6	473374	473379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1998	NC_016831	A	7	7	500300	500306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_016831	GGC	2	6	500616	500621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2000	NC_016831	AGGTG	2	10	500870	500879	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

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