MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_016831	CGG	2	6	4416192	4416197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_016831	CGG	2	6	4416213	4416218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_016831	GGT	2	6	4416232	4416237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_016831	AGC	2	6	4416266	4416271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_016831	GC	3	6	4416287	4416292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18006	NC_016831	CGA	2	6	4416308	4416313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_016831	CGG	2	6	4416387	4416392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_016831	GC	3	6	4416500	4416505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18009	NC_016831	TTG	2	6	4416578	4416583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_016831	TCAG	2	8	4416604	4416611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18011	NC_016831	GCA	2	6	4416616	4416621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_016831	ACA	2	6	4416655	4416660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_016831	GCT	2	6	4416799	4416804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_016831	GCC	2	6	4416844	4416849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18015	NC_016831	ATGA	2	8	4416903	4416910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_016831	GCCT	2	8	4416925	4416932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18017	NC_016831	TTA	2	6	4418297	4418302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_016831	GA	3	6	4419633	4419638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_016831	A	6	6	4419672	4419677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_016831	GCC	2	6	4419678	4419683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18021	NC_016831	GAT	2	6	4419704	4419709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_016831	CGG	2	6	4419718	4419723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_016831	ACC	2	6	4422107	4422112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_016831	GGT	2	6	4422129	4422134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_016831	TTGC	2	8	4423778	4423785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18026	NC_016831	T	6	6	4423858	4423863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_016831	AAAT	2	8	4423878	4423885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_016831	ATC	2	6	4423911	4423916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_016831	GGA	2	6	4424413	4424418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_016831	AGA	2	6	4426882	4426887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_016831	AAC	2	6	4426938	4426943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18032	NC_016831	T	6	6	4427697	4427702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_016831	CCAT	2	8	4427713	4427720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18034	NC_016831	T	8	8	4427731	4427738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_016831	TTTA	2	8	4427785	4427792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_016831	A	6	6	4427794	4427799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_016831	GAGATA	2	12	4427800	4427811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_016831	GGC	2	6	4428226	4428231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_016831	AGA	2	6	4428289	4428294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_016831	TGA	2	6	4428301	4428306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_016831	AGC	2	6	4428330	4428335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_016831	AGCC	2	8	4428445	4428452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18043	NC_016831	GGC	2	6	4428469	4428474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_016831	CGC	2	6	4428493	4428498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18045	NC_016831	GAA	2	6	4428518	4428523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_016831	GAA	2	6	4428554	4428559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_016831	AGC	2	6	4428642	4428647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_016831	GC	4	8	4428682	4428689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18049	NC_016831	GAC	2	6	4428700	4428705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18050	NC_016831	CGG	3	9	4428738	4428746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_016831	GCC	2	6	4428800	4428805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18052	NC_016831	CAA	2	6	4428920	4428925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_016831	AGG	2	6	4432961	4432966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_016831	GTA	2	6	4434608	4434613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_016831	TTA	2	6	4434928	4434933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_016831	TGTT	2	8	4434974	4434981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_016831	AATC	2	8	4435035	4435042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18058	NC_016831	ATT	2	6	4435492	4435497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_016831	GA	3	6	4435552	4435557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_016831	GAT	2	6	4437093	4437098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_016831	A	6	6	4437133	4437138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_016831	CAGC	2	8	4438160	4438167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18063	NC_016831	TGTT	2	8	4438246	4438253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_016831	AAG	2	6	4438306	4438311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_016831	T	6	6	4438323	4438328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_016831	AGA	2	6	4438356	4438361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_016831	GAA	2	6	4438424	4438429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_016831	TTAT	2	8	4438435	4438442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_016831	ATT	2	6	4438469	4438474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_016831	TTG	2	6	4438508	4438513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_016831	ATT	2	6	4438542	4438547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_016831	ACA	2	6	4438604	4438609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_016831	T	7	7	4438619	4438625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_016831	A	7	7	4443065	4443071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_016831	CCT	2	6	4443407	4443412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18077	NC_016831	CGC	2	6	4443482	4443487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_016831	TGT	2	6	4443512	4443517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_016831	A	6	6	4443520	4443525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_016831	T	6	6	4443540	4443545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18081	NC_016831	AAC	2	6	4443554	4443559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_016831	AGG	2	6	4443838	4443843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_016831	AAT	2	6	4443847	4443852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_016831	TGA	2	6	4444270	4444275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_016831	C	6	6	4444312	4444317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18086	NC_016831	GTG	2	6	4444409	4444414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_016831	T	6	6	4445366	4445371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_016831	ATT	2	6	4445432	4445437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_016831	CCT	2	6	4447075	4447080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18090	NC_016831	TCC	2	6	4447204	4447209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18091	NC_016831	AGA	2	6	4447228	4447233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_016831	TGC	2	6	4447247	4447252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18093	NC_016831	T	6	6	4447260	4447265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_016831	GAT	2	6	4447926	4447931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_016831	CAG	2	6	4447964	4447969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18096	NC_016831	ATTTT	2	10	4447978	4447987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_016831	CGT	2	6	4447996	4448001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18098	NC_016831	CCG	2	6	4448098	4448103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18099	NC_016831	TCG	2	6	4448140	4448145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18100	NC_016831	ACAG	2	8	4448180	4448187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18101	NC_016831	GAA	2	6	4448194	4448199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_016831	TTC	2	6	4449668	4449673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_016831	TTC	2	6	4449804	4449809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18104	NC_016831	GCC	2	6	4449847	4449852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18105	NC_016831	TGA	2	6	4449854	4449859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_016831	GGC	2	6	4449871	4449876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_016831	ATA	2	6	4449886	4449891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_016831	AAT	2	6	4453235	4453240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_016831	CTC	2	6	4455220	4455225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18110	NC_016831	TTA	2	6	4455243	4455248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_016831	ACC	2	6	4455253	4455258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18112	NC_016831	ACTT	2	8	4455262	4455269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18113	NC_016831	AGTA	2	8	4455272	4455279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_016831	GAT	2	6	4457740	4457745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_016831	AGA	2	6	4457781	4457786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_016831	T	6	6	4457812	4457817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_016831	TAT	2	6	4457856	4457861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_016831	AAC	2	6	4457918	4457923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_016831	CTT	2	6	4459252	4459257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18120	NC_016831	T	7	7	4459260	4459266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_016831	GCGG	2	8	4459347	4459354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18122	NC_016831	ACG	2	6	4459465	4459470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_016831	ACA	2	6	4459564	4459569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18124	NC_016831	A	6	6	4459800	4459805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_016831	A	9	9	4459808	4459816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_016831	GGAAG	2	10	4461233	4461242	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_016831	AC	3	6	4462082	4462087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18129	NC_016831	GTC	2	6	4462137	4462142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18254	NC_016831	GGC	2	6	4513567	4513572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18258	NC_016831	GCCT	2	8	4515207	4515214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18259	NC_016831	TTA	2	6	4515301	4515306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18263	NC_016831	TCT	2	6	4515535	4515540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18375	NC_016831	ATAGT	2	10	4528563	4528572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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