MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016831	GCAG	2	8	4341864	4341871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17502	NC_016831	GC	3	6	4341955	4341960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17503	NC_016831	GTT	2	6	4341983	4341988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_016831	GCTTG	2	10	4342016	4342025	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17505	NC_016831	CGC	2	6	4342148	4342153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17506	NC_016831	AAT	2	6	4342289	4342294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_016831	AGC	2	6	4342314	4342319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17508	NC_016831	GC	3	6	4342364	4342369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17509	NC_016831	CCG	2	6	4342459	4342464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17510	NC_016831	ACCG	2	8	4342535	4342542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17511	NC_016831	GCA	2	6	4342586	4342591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17512	NC_016831	GAG	2	6	4342668	4342673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17513	NC_016831	GCC	2	6	4342775	4342780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17514	NC_016831	TAA	2	6	4342837	4342842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_016831	GTA	2	6	4342853	4342858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_016831	TGGT	2	8	4342881	4342888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_016831	GCC	2	6	4342899	4342904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17518	NC_016831	ACC	2	6	4342932	4342937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17519	NC_016831	GATT	2	8	4342939	4342946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_016831	GAC	2	6	4342979	4342984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17521	NC_016831	T	6	6	4342985	4342990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17522	NC_016831	T	6	6	4343062	4343067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17523	NC_016831	GAAA	2	8	4343150	4343157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17524	NC_016831	TAT	2	6	4343173	4343178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_016831	TCTGC	2	10	4343230	4343239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17526	NC_016831	GGAT	2	8	4343258	4343265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_016831	GGCA	2	8	4343319	4343326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17528	NC_016831	AAG	2	6	4344389	4344394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_016831	TGA	2	6	4344497	4344502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_016831	TCC	2	6	4344953	4344958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17531	NC_016831	TCA	2	6	4344966	4344971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17532	NC_016831	ATT	2	6	4345012	4345017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17533	NC_016831	CGG	2	6	4345036	4345041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17534	NC_016831	T	6	6	4346166	4346171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_016831	CAC	2	6	4346177	4346182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17536	NC_016831	AT	3	6	4346227	4346232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_016831	GTAA	2	8	4346336	4346343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_016831	CTCC	2	8	4346381	4346388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17539	NC_016831	TA	3	6	4346429	4346434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_016831	TC	3	6	4347993	4347998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17541	NC_016831	CTC	2	6	4348010	4348015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17542	NC_016831	GGA	2	6	4348025	4348030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_016831	GAC	2	6	4348064	4348069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_016831	CAG	2	6	4348091	4348096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17545	NC_016831	TG	3	6	4348106	4348111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_016831	ACG	2	6	4348116	4348121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17547	NC_016831	TGG	2	6	4351597	4351602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_016831	AGCATC	2	12	4352974	4352985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17549	NC_016831	CGT	2	6	4353036	4353041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_016831	TTA	2	6	4353100	4353105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_016831	TGC	2	6	4353880	4353885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17552	NC_016831	GA	3	6	4353945	4353950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17553	NC_016831	TG	3	6	4353970	4353975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_016831	AAT	2	6	4354009	4354014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_016831	A	7	7	4354087	4354093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_016831	TAT	2	6	4354129	4354134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_016831	GCA	2	6	4354141	4354146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_016831	A	8	8	4354173	4354180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_016831	CCG	2	6	4356508	4356513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17560	NC_016831	AAT	2	6	4356570	4356575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_016831	ATT	3	9	4356590	4356598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_016831	TAA	2	6	4356599	4356604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17563	NC_016831	ATT	2	6	4356616	4356621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_016831	AGCG	2	8	4356625	4356632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17565	NC_016831	CCG	2	6	4356640	4356645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17566	NC_016831	ATT	2	6	4356661	4356666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17567	NC_016831	T	7	7	4356665	4356671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17568	NC_016831	CGGG	2	8	4357592	4357599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17569	NC_016831	AGG	2	6	4357600	4357605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_016831	TTGC	2	8	4357610	4357617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17571	NC_016831	GGA	2	6	4357671	4357676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_016831	CG	3	6	4357784	4357789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17573	NC_016831	CCA	2	6	4357858	4357863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17574	NC_016831	ACT	2	6	4357875	4357880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17575	NC_016831	CTA	2	6	4359289	4359294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17576	NC_016831	GGCG	2	8	4359301	4359308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17577	NC_016831	TC	3	6	4359340	4359345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17578	NC_016831	ACA	2	6	4359348	4359353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17579	NC_016831	TAC	2	6	4359426	4359431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17580	NC_016831	TGG	2	6	4359439	4359444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17581	NC_016831	TCGG	2	8	4359450	4359457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17582	NC_016831	TCG	2	6	4359460	4359465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17583	NC_016831	CG	3	6	4359482	4359487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17584	NC_016831	CAT	2	6	4359512	4359517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17585	NC_016831	CTG	2	6	4359609	4359614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17586	NC_016831	AAC	2	6	4359757	4359762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17587	NC_016831	TTC	2	6	4359780	4359785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17588	NC_016831	CTGG	2	8	4359792	4359799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17589	NC_016831	GCGGA	2	10	4359844	4359853	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17590	NC_016831	CTC	2	6	4359947	4359952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17591	NC_016831	CGG	2	6	4359967	4359972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17592	NC_016831	GCC	2	6	4359973	4359978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17593	NC_016831	CT	3	6	4360029	4360034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17594	NC_016831	CTA	2	6	4360097	4360102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17595	NC_016831	CGGCG	2	10	4360157	4360166	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17596	NC_016831	GGGC	2	8	4360175	4360182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17597	NC_016831	GGC	2	6	4360263	4360268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17598	NC_016831	TGG	2	6	4360322	4360327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17599	NC_016831	GGC	2	6	4360411	4360416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17600	NC_016831	GCG	2	6	4360426	4360431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17601	NC_016831	TAT	2	6	4360515	4360520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_016831	ATG	2	6	4360546	4360551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_016831	CTA	2	6	4360572	4360577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17604	NC_016831	TGC	2	6	4360595	4360600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17605	NC_016831	CTG	2	6	4360618	4360623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17606	NC_016831	CGC	2	6	4360640	4360645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17607	NC_016831	TCG	2	6	4360649	4360654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17608	NC_016831	TC	3	6	4360717	4360722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17609	NC_016831	CTG	2	6	4360853	4360858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17610	NC_016831	GAA	2	6	4360859	4360864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17611	NC_016831	CCA	2	6	4360882	4360887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17612	NC_016831	TCT	2	6	4360905	4360910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17613	NC_016831	AC	3	6	4360956	4360961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17614	NC_016831	CTG	2	6	4360979	4360984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17615	NC_016831	CCG	3	9	4360993	4361001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17616	NC_016831	GCC	2	6	4361003	4361008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17617	NC_016831	GCC	2	6	4361027	4361032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17618	NC_016831	T	6	6	4361036	4361041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17619	NC_016831	CTG	2	6	4361057	4361062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17620	NC_016831	GCC	2	6	4361096	4361101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17621	NC_016831	GGT	2	6	4361144	4361149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17622	NC_016831	GATGG	2	10	4361207	4361216	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17623	NC_016831	CGCC	2	8	4361402	4361409	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17624	NC_016831	CCG	2	6	4361593	4361598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17625	NC_016831	CTT	2	6	4361627	4361632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17626	NC_016831	CAG	2	6	4361634	4361639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17627	NC_016831	CGT	2	6	4361702	4361707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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