MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_016831	CGG	2	6	4221006	4221011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_016831	GGC	2	6	4221043	4221048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_016831	CGT	2	6	4221103	4221108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_016831	GGAT	2	8	4221173	4221180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_016831	CGG	2	6	4221193	4221198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_016831	AGG	2	6	4221212	4221217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_016831	TGC	2	6	4221709	4221714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_016831	TCA	2	6	4224459	4224464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_016831	TG	3	6	4224809	4224814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_016831	GGC	2	6	4224963	4224968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_016831	AGC	2	6	4225003	4225008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_016831	TGC	2	6	4225010	4225015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17013	NC_016831	ACT	2	6	4225077	4225082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_016831	TTG	2	6	4225174	4225179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_016831	CGA	2	6	4225202	4225207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_016831	GCA	2	6	4225276	4225281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_016831	GAA	2	6	4225335	4225340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_016831	GGA	2	6	4225371	4225376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_016831	TAA	2	6	4225389	4225394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_016831	GCA	2	6	4225397	4225402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_016831	AGA	2	6	4225418	4225423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_016831	CAG	2	6	4225444	4225449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_016831	G	6	6	4225591	4225596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_016831	GGA	2	6	4225635	4225640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_016831	GGC	2	6	4225655	4225660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_016831	GAA	2	6	4225898	4225903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_016831	AGA	2	6	4225927	4225932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_016831	TGC	2	6	4225974	4225979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_016831	GTC	2	6	4225986	4225991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17030	NC_016831	TTG	2	6	4226047	4226052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_016831	GGA	2	6	4226099	4226104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_016831	TCA	2	6	4226124	4226129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_016831	AC	3	6	4226150	4226155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17034	NC_016831	CGT	2	6	4226218	4226223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_016831	AC	3	6	4226319	4226324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17036	NC_016831	GTAG	2	8	4226360	4226367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_016831	CCT	2	6	4226460	4226465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17038	NC_016831	AAG	2	6	4226473	4226478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_016831	CA	3	6	4226495	4226500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17040	NC_016831	TGA	2	6	4226508	4226513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17041	NC_016831	GGT	2	6	4226551	4226556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_016831	GGT	2	6	4226586	4226591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_016831	AGG	2	6	4226765	4226770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_016831	CCA	2	6	4226795	4226800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17045	NC_016831	A	6	6	4226818	4226823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_016831	AAC	2	6	4226905	4226910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_016831	GTT	2	6	4226915	4226920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17049	NC_016831	GAT	2	6	4226948	4226953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_016831	GCG	2	6	4227227	4227232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17051	NC_016831	GAG	2	6	4227243	4227248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_016831	TG	3	6	4227268	4227273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_016831	GC	3	6	4227295	4227300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17054	NC_016831	G	6	6	4227388	4227393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_016831	TCC	2	6	4227398	4227403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17056	NC_016831	CTGA	2	8	4227418	4227425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17057	NC_016831	GTAC	2	8	4227502	4227509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17058	NC_016831	TG	3	6	4227534	4227539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_016831	GGA	2	6	4227709	4227714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_016831	AC	3	6	4227927	4227932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17061	NC_016831	CGTC	2	8	4227945	4227952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17062	NC_016831	AAC	2	6	4227964	4227969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17063	NC_016831	AGC	2	6	4228054	4228059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_016831	CAT	2	6	4228060	4228065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_016831	AAAG	2	8	4228068	4228075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_016831	AGCGA	2	10	4228194	4228203	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17067	NC_016831	AGTCG	2	10	4228221	4228230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17068	NC_016831	CGTT	2	8	4228242	4228249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17069	NC_016831	G	6	6	4228486	4228491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_016831	GT	4	8	4228544	4228551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_016831	TGA	2	6	4228587	4228592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_016831	GGT	2	6	4228686	4228691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_016831	GA	3	6	4228716	4228721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_016831	AGTC	2	8	4228812	4228819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17075	NC_016831	GCTG	2	8	4228830	4228837	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17076	NC_016831	TTA	2	6	4228845	4228850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17078	NC_016831	ATG	2	6	4229045	4229050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_016831	ACC	2	6	4229240	4229245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17080	NC_016831	TGG	2	6	4229300	4229305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17082	NC_016831	GGA	2	6	4229343	4229348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_016831	AGG	2	6	4229381	4229386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_016831	GGT	2	6	4229463	4229468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_016831	CGG	2	6	4229550	4229555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17090	NC_016831	GT	3	6	4229911	4229916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_016831	GA	3	6	4229998	4230003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_016831	CAG	2	6	4230011	4230016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_016831	AAT	2	6	4230037	4230042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_016831	GCA	3	9	4230047	4230055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17095	NC_016831	GGC	2	6	4230057	4230062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17096	NC_016831	AAGGA	2	10	4230068	4230077	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_016831	CGC	2	6	4230122	4230127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17098	NC_016831	GGC	2	6	4230171	4230176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17099	NC_016831	GGT	2	6	4230185	4230190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17100	NC_016831	GAA	2	6	4230295	4230300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_016831	CGTC	2	8	4230304	4230311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17102	NC_016831	CTT	2	6	4230320	4230325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17103	NC_016831	T	6	6	4230896	4230901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_016831	TTCTA	2	10	4230908	4230917	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17105	NC_016831	TCT	2	6	4231973	4231978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17106	NC_016831	T	6	6	4232034	4232039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_016831	TCA	2	6	4232056	4232061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_016831	ATTTA	2	10	4232071	4232080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_016831	AATTA	2	10	4232106	4232115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_016831	TTTTGA	2	12	4232130	4232141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_016831	AGT	2	6	4232152	4232157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_016831	TTCG	2	8	4232193	4232200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17113	NC_016831	CAA	2	6	4232221	4232226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17114	NC_016831	GAG	2	6	4232228	4232233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17115	NC_016831	CAC	2	6	4233845	4233850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17116	NC_016831	GCGCT	2	10	4238343	4238352	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17117	NC_016831	ACA	2	6	4242249	4242254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17118	NC_016831	TCTT	2	8	4242282	4242289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17119	NC_016831	GAAG	2	8	4242309	4242316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_016831	GGC	2	6	4242340	4242345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17121	NC_016831	CAG	2	6	4242404	4242409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17122	NC_016831	TCA	2	6	4244899	4244904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17123	NC_016831	TAA	2	6	4244920	4244925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_016831	ATG	2	6	4244965	4244970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_016831	CG	3	6	4244990	4244995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17126	NC_016831	GCCAG	2	10	4245011	4245020	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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17128	NC_016831	AG	3	6	4245669	4245674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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