MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016831	TTAT	2	8	3917431	3917438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_016831	TCA	2	6	3917448	3917453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_016831	TCG	2	6	3917505	3917510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_016831	GC	3	6	3917522	3917527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16005	NC_016831	TTAT	2	8	3917540	3917547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_016831	TATG	2	8	3917592	3917599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_016831	T	7	7	3917604	3917610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_016831	GAT	2	6	3917615	3917620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_016831	TCC	2	6	3917827	3917832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16010	NC_016831	GATA	2	8	3918257	3918264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_016831	GC	3	6	3918276	3918281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_016831	AGTG	2	8	3918282	3918289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_016831	TTC	2	6	3918291	3918296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_016831	ATT	2	6	3918346	3918351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_016831	GAAA	2	8	3918386	3918393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_016831	GGA	2	6	3918512	3918517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_016831	CGG	2	6	3918734	3918739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_016831	CTC	2	6	3920601	3920606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16019	NC_016831	GCC	2	6	3920656	3920661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16020	NC_016831	CTT	2	6	3922626	3922631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_016831	TGTAG	2	10	3922697	3922706	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_016831	AG	3	6	3922790	3922795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_016831	A	7	7	3922832	3922838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_016831	TTG	2	6	3922909	3922914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_016831	CCT	2	6	3923018	3923023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16026	NC_016831	CCA	2	6	3923762	3923767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16027	NC_016831	CCA	2	6	3923776	3923781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16028	NC_016831	TTAAA	2	10	3927042	3927051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_016831	ATT	2	6	3927071	3927076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_016831	CTT	2	6	3927099	3927104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_016831	AAT	2	6	3927133	3927138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_016831	A	7	7	3932082	3932088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_016831	TAA	2	6	3932152	3932157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_016831	TCA	2	6	3933103	3933108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_016831	GCC	2	6	3933152	3933157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_016831	TGA	2	6	3939757	3939762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_016831	T	7	7	3942245	3942251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_016831	AT	3	6	3942287	3942292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_016831	A	6	6	3942332	3942337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_016831	ATC	2	6	3942345	3942350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_016831	T	6	6	3942359	3942364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_016831	AC	3	6	3942386	3942391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16043	NC_016831	GA	3	6	3942422	3942427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_016831	GCG	2	6	3943300	3943305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_016831	CT	3	6	3943314	3943319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16046	NC_016831	CGT	2	6	3943828	3943833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_016831	ATG	2	6	3943844	3943849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_016831	CTGT	2	8	3945132	3945139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16049	NC_016831	GTA	2	6	3945194	3945199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_016831	T	6	6	3945235	3945240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_016831	GAG	2	6	3945265	3945270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_016831	TCA	2	6	3947339	3947344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_016831	CGA	2	6	3947648	3947653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_016831	ACGC	2	8	3947714	3947721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16055	NC_016831	A	7	7	3947857	3947863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_016831	TG	3	6	3948458	3948463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_016831	AT	3	6	3949698	3949703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_016831	ATG	2	6	3949766	3949771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_016831	ATT	2	6	3949776	3949781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_016831	AAGT	2	8	3953001	3953008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_016831	TG	3	6	3953010	3953015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_016831	TAT	2	6	3953030	3953035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_016831	TTC	2	6	3953065	3953070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_016831	CA	3	6	3953084	3953089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16065	NC_016831	CAT	2	6	3953471	3953476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_016831	TAA	3	9	3954605	3954613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_016831	TAA	2	6	3954636	3954641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_016831	AAAC	2	8	3954996	3955003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16069	NC_016831	TCCT	2	8	3955046	3955053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16070	NC_016831	GGC	2	6	3955999	3956004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_016831	TAAA	2	8	3958085	3958092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_016831	T	7	7	3958115	3958121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_016831	TAA	2	6	3958150	3958155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_016831	ATTG	2	8	3958185	3958192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_016831	ATT	2	6	3958199	3958204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_016831	CAGA	2	8	3958296	3958303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16077	NC_016831	AAT	2	6	3958330	3958335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_016831	GGC	2	6	3958350	3958355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_016831	GAGT	2	8	3958360	3958367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_016831	GAGC	2	8	3958401	3958408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16081	NC_016831	CAT	2	6	3958659	3958664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_016831	TGG	2	6	3958933	3958938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_016831	T	7	7	3959084	3959090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_016831	ACT	2	6	3959117	3959122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_016831	AC	3	6	3959123	3959128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16086	NC_016831	CAG	2	6	3959153	3959158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_016831	TGT	2	6	3959208	3959213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_016831	ACT	2	6	3959316	3959321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_016831	ACTT	2	8	3959367	3959374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_016831	GTAA	2	8	3959380	3959387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_016831	TTCT	2	8	3959401	3959408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16092	NC_016831	TGA	2	6	3959477	3959482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_016831	ATA	2	6	3959499	3959504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_016831	GCA	2	6	3959521	3959526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_016831	TTG	2	6	3959540	3959545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16098	NC_016831	TGG	2	6	3959652	3959657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_016831	TCA	2	6	3959993	3959998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_016831	AAGA	2	8	3960102	3960109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_016831	CT	3	6	3960134	3960139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_016831	ATCCC	2	10	3960199	3960208	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16103	NC_016831	TC	3	6	3960239	3960244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16104	NC_016831	ATG	2	6	3960280	3960285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16106	NC_016831	ATC	2	6	3960392	3960397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_016831	CAG	2	6	3960405	3960410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_016831	GAA	2	6	3960510	3960515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_016831	ACG	2	6	3960517	3960522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_016831	TGA	2	6	3960533	3960538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_016831	A	6	6	3960620	3960625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_016831	TTG	2	6	3960762	3960767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_016831	CTA	2	6	3961382	3961387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_016831	G	6	6	3961457	3961462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_016831	A	8	8	3961472	3961479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_016831	CAGG	2	8	3961490	3961497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16117	NC_016831	A	6	6	3961752	3961757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_016831	T	6	6	3961795	3961800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_016831	TTTTA	2	10	3961937	3961946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_016831	CGGG	2	8	3961970	3961977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16121	NC_016831	CA	3	6	3962332	3962337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16122	NC_016831	G	6	6	3962393	3962398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_016831	CGC	2	6	3962404	3962409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16124	NC_016831	TACGC	2	10	3962441	3962450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16125	NC_016831	TTA	3	9	3964529	3964537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_016831	AAT	2	6	3964549	3964554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_016831	TGAA	2	8	3964602	3964609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_016831	AAT	2	6	3964615	3964620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16130	NC_016831	GCC	2	6	3964671	3964676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16500	NC_016831	TA	3	6	4057830	4057835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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