MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016831	GTG	2	6	3781531	3781536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_016831	ATTT	2	8	3781542	3781549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_016831	TCT	2	6	3781588	3781593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_016831	GCT	2	6	3781598	3781603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_016831	GGC	2	6	3781604	3781609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_016831	GCT	2	6	3781697	3781702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_016831	TCAT	2	8	3781729	3781736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15508	NC_016831	ATCA	2	8	3781761	3781768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15509	NC_016831	GC	3	6	3781778	3781783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15510	NC_016831	ATT	2	6	3781860	3781865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_016831	GGC	2	6	3781884	3781889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_016831	CCG	2	6	3781898	3781903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15513	NC_016831	GGC	2	6	3781916	3781921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_016831	CTG	2	6	3781926	3781931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_016831	GC	3	6	3781939	3781944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15516	NC_016831	GCCA	2	8	3782104	3782111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15517	NC_016831	AGC	2	6	3782206	3782211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_016831	TGG	2	6	3782412	3782417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_016831	GC	4	8	3782427	3782434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15520	NC_016831	T	8	8	3782446	3782453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_016831	ATC	2	6	3782458	3782463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_016831	CG	3	6	3782513	3782518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15523	NC_016831	GGC	2	6	3782537	3782542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_016831	GTCA	2	8	3782547	3782554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15525	NC_016831	CAA	2	6	3782707	3782712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_016831	GCA	2	6	3782762	3782767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_016831	GGA	2	6	3782961	3782966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_016831	GGC	2	6	3782971	3782976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_016831	TGG	2	6	3782987	3782992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_016831	GCG	2	6	3783139	3783144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_016831	GGC	2	6	3783147	3783152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_016831	GGC	2	6	3783156	3783161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_016831	GGC	2	6	3783165	3783170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_016831	GAC	2	6	3783192	3783197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_016831	ACC	2	6	3783367	3783372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15536	NC_016831	GGT	2	6	3783441	3783446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_016831	CGC	2	6	3783449	3783454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15538	NC_016831	TGA	2	6	3783537	3783542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_016831	GCTG	2	8	3783548	3783555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15540	NC_016831	CAG	2	6	3783580	3783585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_016831	ATC	2	6	3783656	3783661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_016831	ACG	2	6	3783773	3783778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_016831	A	6	6	3783806	3783811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_016831	GTCC	2	8	3783864	3783871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15545	NC_016831	GGC	2	6	3783937	3783942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_016831	TTA	2	6	3783956	3783961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_016831	GC	4	8	3783977	3783984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15548	NC_016831	GGC	2	6	3784117	3784122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_016831	GC	3	6	3784205	3784210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15550	NC_016831	ACG	2	6	3784213	3784218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15551	NC_016831	TGG	2	6	3784220	3784225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_016831	CGGTC	2	10	3784272	3784281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15553	NC_016831	AAAT	2	8	3784984	3784991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_016831	ATT	2	6	3785039	3785044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_016831	CAAT	2	8	3785050	3785057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15556	NC_016831	ATG	2	6	3785062	3785067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_016831	A	7	7	3785101	3785107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_016831	TAAT	2	8	3785115	3785122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_016831	TCT	2	6	3787186	3787191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_016831	AGG	2	6	3787865	3787870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_016831	T	6	6	3788647	3788652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_016831	TGATGC	2	12	3791807	3791818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15563	NC_016831	ACC	2	6	3791851	3791856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15564	NC_016831	AGC	2	6	3791888	3791893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_016831	AGC	2	6	3791912	3791917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_016831	AAC	2	6	3791938	3791943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15568	NC_016831	AGG	2	6	3792008	3792013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_016831	GCC	2	6	3792020	3792025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15583	NC_016831	GAG	2	6	3792314	3792319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15585	NC_016831	GGCT	2	8	3792380	3792387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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15590	NC_016831	GCT	2	6	3792550	3792555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15593	NC_016831	GAT	2	6	3792661	3792666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15596	NC_016831	CGG	2	6	3792695	3792700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15597	NC_016831	GGCGC	2	10	3792760	3792769	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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15602	NC_016831	CCTTG	2	10	3795692	3795701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15603	NC_016831	T	6	6	3795723	3795728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_016831	TA	3	6	3795808	3795813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_016831	GAA	2	6	3795865	3795870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_016831	CG	3	6	3797594	3797599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15607	NC_016831	CTT	3	9	3797622	3797630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_016831	TCT	2	6	3797632	3797637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15609	NC_016831	T	8	8	3797687	3797694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_016831	AGTT	2	8	3797696	3797703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_016831	T	8	8	3797719	3797726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_016831	GGT	2	6	3797737	3797742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_016831	AAT	2	6	3797763	3797768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_016831	TGAAA	2	10	3797805	3797814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_016831	GTC	2	6	3797973	3797978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15618	NC_016831	T	7	7	3802148	3802154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_016831	TTA	2	6	3803118	3803123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15622	NC_016831	GTC	2	6	3803243	3803248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_016831	CGG	2	6	3803271	3803276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15626	NC_016831	GAACG	2	10	3803325	3803334	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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15628	NC_016831	GC	3	6	3803429	3803434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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