MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016831	CG	3	6	3662354	3662359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15002	NC_016831	GAA	2	6	3662393	3662398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_016831	TGA	2	6	3662421	3662426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_016831	CG	3	6	3662558	3662563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15005	NC_016831	ACCA	2	8	3662654	3662661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15006	NC_016831	TCG	2	6	3662688	3662693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_016831	CGC	2	6	3662710	3662715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_016831	GATC	2	8	3662785	3662792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15009	NC_016831	CTT	2	6	3662860	3662865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_016831	CTG	2	6	3662885	3662890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_016831	CGTG	2	8	3662947	3662954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15012	NC_016831	GAT	2	6	3662969	3662974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_016831	CGT	2	6	3663225	3663230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_016831	GCTGG	2	10	3663241	3663250	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15015	NC_016831	GCA	2	6	3663253	3663258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_016831	GC	3	6	3663267	3663272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_016831	CGG	3	9	3663328	3663336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_016831	CTG	2	6	3663389	3663394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_016831	GACC	2	8	3663439	3663446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15020	NC_016831	TTG	2	6	3663482	3663487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_016831	ACT	2	6	3663501	3663506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_016831	TTC	2	6	3663524	3663529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_016831	GAT	2	6	3663535	3663540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_016831	CTT	2	6	3663547	3663552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_016831	GAT	2	6	3663640	3663645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_016831	AACAAA	2	12	3663707	3663718	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15027	NC_016831	GTCGC	2	10	3663722	3663731	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15028	NC_016831	ACG	2	6	3663813	3663818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_016831	TCT	2	6	3663981	3663986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_016831	GCG	2	6	3664017	3664022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_016831	GAA	2	6	3664085	3664090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_016831	GGT	3	9	3664150	3664158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_016831	GAA	2	6	3664159	3664164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_016831	GTTC	2	8	3664179	3664186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15035	NC_016831	ACG	2	6	3664208	3664213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_016831	GCT	2	6	3664221	3664226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_016831	ATG	2	6	3664262	3664267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_016831	CGT	2	6	3664271	3664276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_016831	GCTGG	2	10	3664309	3664318	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15040	NC_016831	GCATGG	2	12	3664319	3664330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15041	NC_016831	CCG	2	6	3664339	3664344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15042	NC_016831	CCG	2	6	3664365	3664370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15043	NC_016831	GGC	2	6	3664421	3664426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_016831	GCC	2	6	3664460	3664465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15045	NC_016831	CGC	2	6	3664581	3664586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15046	NC_016831	GCC	2	6	3664628	3664633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15047	NC_016831	ACT	2	6	3664722	3664727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_016831	CAAAGC	2	12	3664858	3664869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_016831	GTG	2	6	3664871	3664876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_016831	A	7	7	3664963	3664969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_016831	TCG	2	6	3664998	3665003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_016831	TCCT	2	8	3665036	3665043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15053	NC_016831	GAC	2	6	3665070	3665075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_016831	CAT	2	6	3665098	3665103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_016831	TCG	2	6	3665104	3665109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_016831	ACC	2	6	3665151	3665156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15057	NC_016831	CAC	2	6	3665185	3665190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_016831	TGA	2	6	3665245	3665250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_016831	CGG	2	6	3665283	3665288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_016831	CGG	2	6	3665415	3665420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_016831	GCTG	2	8	3665498	3665505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15062	NC_016831	GTG	2	6	3665577	3665582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_016831	CATT	2	8	3665627	3665634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15064	NC_016831	GGCG	2	8	3665663	3665670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15065	NC_016831	CGG	2	6	3665725	3665730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_016831	CATGT	2	10	3665745	3665754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15067	NC_016831	TGC	2	6	3665758	3665763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_016831	CGC	2	6	3665858	3665863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15069	NC_016831	GCC	2	6	3665886	3665891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15070	NC_016831	GTCGGC	2	12	3665907	3665918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_016831	GGAAGA	2	12	3665930	3665941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_016831	AAT	2	6	3668211	3668216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_016831	CAT	3	9	3668238	3668246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_016831	T	6	6	3668290	3668295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_016831	ATC	3	9	3668313	3668321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_016831	CAC	2	6	3668331	3668336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15077	NC_016831	TACA	3	12	3668369	3668380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15078	NC_016831	GAA	2	6	3680765	3680770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_016831	AAC	2	6	3682161	3682166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15080	NC_016831	ACG	2	6	3683630	3683635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_016831	ATCC	2	8	3683647	3683654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15082	NC_016831	GATG	2	8	3683656	3683663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_016831	GTT	2	6	3684431	3684436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_016831	TCAT	2	8	3684445	3684452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15085	NC_016831	ATA	2	6	3684493	3684498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_016831	ATT	2	6	3685486	3685491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_016831	GCC	2	6	3685503	3685508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15088	NC_016831	T	6	6	3685652	3685657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_016831	GGC	2	6	3685667	3685672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_016831	CGG	2	6	3685702	3685707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_016831	A	6	6	3685728	3685733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_016831	GCG	2	6	3685742	3685747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_016831	CGC	2	6	3685771	3685776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15094	NC_016831	CAT	2	6	3685820	3685825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_016831	GGA	2	6	3685826	3685831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_016831	A	6	6	3685831	3685836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_016831	GCG	2	6	3685878	3685883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_016831	GCC	2	6	3685900	3685905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15099	NC_016831	ACA	2	6	3685955	3685960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15100	NC_016831	A	7	7	3685974	3685980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_016831	AGAA	2	8	3685996	3686003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_016831	ATT	2	6	3686016	3686021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_016831	TTC	2	6	3686029	3686034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_016831	TCG	2	6	3686047	3686052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_016831	GCT	2	6	3686060	3686065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_016831	CCT	2	6	3686146	3686151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15107	NC_016831	TACT	2	8	3686302	3686309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15108	NC_016831	TGATT	2	10	3686351	3686360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_016831	GCA	2	6	3686372	3686377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_016831	AAT	2	6	3686379	3686384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_016831	CCG	2	6	3690145	3690150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15112	NC_016831	TCC	2	6	3692091	3692096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15113	NC_016831	GTG	2	6	3692227	3692232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_016831	CAG	2	6	3692328	3692333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_016831	ACG	2	6	3692353	3692358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_016831	CGA	2	6	3693817	3693822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_016831	TGC	2	6	3693832	3693837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_016831	GGC	2	6	3693840	3693845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_016831	ATAG	2	8	3693868	3693875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_016831	GCA	3	9	3693908	3693916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_016831	T	6	6	3693980	3693985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_016831	CCA	2	6	3693988	3693993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15123	NC_016831	CTG	2	6	3694068	3694073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_016831	TAA	2	6	3696566	3696571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_016831	GCT	2	6	3696585	3696590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_016831	G	6	6	3696642	3696647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_016831	TAT	2	6	3696666	3696671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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