MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016831	CAC	2	6	3544266	3544271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14502	NC_016831	CAA	3	9	3544305	3544313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_016831	ATAG	2	8	3544320	3544327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_016831	GAT	2	6	3544337	3544342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_016831	GC	3	6	3544363	3544368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14506	NC_016831	CCG	2	6	3544484	3544489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_016831	TCA	2	6	3544555	3544560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_016831	ACC	2	6	3544761	3544766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14509	NC_016831	T	6	6	3544785	3544790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_016831	GTA	2	6	3544858	3544863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_016831	CCA	2	6	3544913	3544918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14512	NC_016831	CCT	2	6	3545046	3545051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14513	NC_016831	CGA	2	6	3545100	3545105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_016831	AAC	2	6	3545120	3545125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_016831	GCCAG	2	10	3545132	3545141	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14516	NC_016831	GCC	2	6	3545219	3545224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14517	NC_016831	CAA	2	6	3545251	3545256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_016831	CAC	2	6	3545265	3545270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14519	NC_016831	CGT	2	6	3545283	3545288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_016831	ACC	2	6	3545357	3545362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14521	NC_016831	CGT	2	6	3545391	3545396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_016831	CTC	2	6	3545439	3545444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14523	NC_016831	A	8	8	3545463	3545470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_016831	ATA	2	6	3545559	3545564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_016831	CAC	3	9	3545567	3545575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14526	NC_016831	T	7	7	3545692	3545698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_016831	T	6	6	3545743	3545748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_016831	TCC	2	6	3545785	3545790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14529	NC_016831	CTT	2	6	3545821	3545826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_016831	A	6	6	3545902	3545907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_016831	TCT	2	6	3545932	3545937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_016831	AGG	2	6	3545959	3545964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_016831	AAAAC	2	10	3547922	3547931	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14534	NC_016831	AAT	2	6	3547950	3547955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_016831	ATG	2	6	3548810	3548815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_016831	AAAAGA	2	12	3548816	3548827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_016831	A	10	10	3548873	3548882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_016831	ATT	2	6	3548902	3548907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_016831	GA	3	6	3548921	3548926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_016831	ACGG	2	8	3549001	3549008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14541	NC_016831	CAGG	2	8	3549036	3549043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14542	NC_016831	ACC	2	6	3549218	3549223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14543	NC_016831	GCC	2	6	3549232	3549237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_016831	GCG	2	6	3549281	3549286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_016831	TCCT	2	8	3549327	3549334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14546	NC_016831	GCC	2	6	3549346	3549351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14547	NC_016831	TGC	3	9	3549353	3549361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_016831	ATT	2	6	3549366	3549371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_016831	CTG	2	6	3549392	3549397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_016831	TC	3	6	3549405	3549410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14551	NC_016831	AC	3	6	3549492	3549497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14552	NC_016831	CGT	3	9	3549510	3549518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_016831	AGC	2	6	3549691	3549696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14554	NC_016831	C	6	6	3549696	3549701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14555	NC_016831	ACG	2	6	3549745	3549750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_016831	TGA	2	6	3549825	3549830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_016831	CCG	2	6	3549853	3549858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14558	NC_016831	ACC	2	6	3549940	3549945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14559	NC_016831	CCT	2	6	3550022	3550027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14560	NC_016831	CTC	2	6	3550059	3550064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14561	NC_016831	AGG	2	6	3550076	3550081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_016831	CCA	2	6	3550103	3550108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14563	NC_016831	GGT	2	6	3550163	3550168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_016831	CAT	2	6	3550358	3550363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_016831	GCC	2	6	3550433	3550438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14566	NC_016831	TAA	2	6	3550558	3550563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_016831	CAGC	2	8	3550571	3550578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14568	NC_016831	GACT	2	8	3550589	3550596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14569	NC_016831	TC	3	6	3550687	3550692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14570	NC_016831	ACC	2	6	3550717	3550722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14571	NC_016831	TCA	2	6	3550816	3550821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_016831	AC	4	8	3550857	3550864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14573	NC_016831	C	6	6	3550917	3550922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14574	NC_016831	AACG	2	8	3551159	3551166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14575	NC_016831	CGACT	2	10	3551178	3551187	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14576	NC_016831	TCGCT	2	10	3551205	3551214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14577	NC_016831	CTTT	2	8	3551333	3551340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14578	NC_016831	ATG	2	6	3551343	3551348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_016831	GCT	2	6	3551349	3551354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_016831	GTT	2	6	3551439	3551444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_016831	ACG	2	6	3551454	3551459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_016831	GT	3	6	3551476	3551481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_016831	TCGGT	2	10	3551685	3551694	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14584	NC_016831	CA	3	6	3551869	3551874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14585	NC_016831	GTAC	2	8	3551899	3551906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14586	NC_016831	GTCA	2	8	3551982	3551989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14587	NC_016831	GGA	2	6	3552005	3552010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_016831	C	6	6	3552015	3552020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14589	NC_016831	CG	3	6	3552107	3552112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14590	NC_016831	AC	3	6	3552134	3552139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14591	NC_016831	CTC	2	6	3552160	3552165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14592	NC_016831	TCGC	2	8	3552171	3552178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14593	NC_016831	TCA	2	6	3552453	3552458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_016831	GA	3	6	3552476	3552481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_016831	AAC	2	6	3552488	3552493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_016831	GTT	2	6	3552498	3552503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_016831	TCAC	2	8	3552600	3552607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14598	NC_016831	CCG	2	6	3552651	3552656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14599	NC_016831	TCA	2	6	3552734	3552739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_016831	TG	3	6	3552747	3552752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_016831	CTT	2	6	3552769	3552774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_016831	AGG	2	6	3552782	3552787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_016831	CTAC	2	8	3552880	3552887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14604	NC_016831	GT	3	6	3552923	3552928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_016831	ACG	2	6	3553024	3553029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_016831	GT	3	6	3553092	3553097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_016831	ATG	2	6	3553117	3553122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_016831	TCC	2	6	3553143	3553148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14609	NC_016831	CAA	2	6	3553195	3553200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_016831	GAC	2	6	3553256	3553261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_016831	GCA	2	6	3553268	3553273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_016831	TTC	2	6	3553314	3553319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_016831	TTC	2	6	3553344	3553349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_016831	GCC	2	6	3553587	3553592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14615	NC_016831	TCC	2	6	3553607	3553612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14616	NC_016831	C	6	6	3553651	3553656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14617	NC_016831	TGCG	2	8	3553739	3553746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14618	NC_016831	GCT	2	6	3553797	3553802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14619	NC_016831	CTT	2	6	3553822	3553827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14620	NC_016831	TGC	2	6	3553845	3553850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14621	NC_016831	TTA	2	6	3553853	3553858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_016831	TCC	2	6	3553871	3553876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14623	NC_016831	CTT	2	6	3553906	3553911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_016831	CTG	2	6	3553965	3553970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_016831	TCG	2	6	3554040	3554045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_016831	CAA	2	6	3554068	3554073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_016831	AGT	2	6	3554165	3554170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14629	NC_016831	GCT	2	6	3554239	3554244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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